MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. RKS5078 chromosome

Total Repeats: 18925

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_016831	TGC	3	9	3411467	3411475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14002	NC_016831	ATT	2	6	3411480	3411485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14003	NC_016831	CTG	2	6	3411506	3411511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14004	NC_016831	TC	3	6	3411519	3411524	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14005	NC_016831	AC	3	6	3411606	3411611	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14006	NC_016831	CGT	3	9	3411624	3411632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14007	NC_016831	AGC	2	6	3411805	3411810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14008	NC_016831	C	6	6	3411810	3411815	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
14009	NC_016831	ACG	2	6	3411859	3411864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14010	NC_016831	TGA	2	6	3411939	3411944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14011	NC_016831	CCG	2	6	3411967	3411972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14012	NC_016831	ACC	2	6	3412054	3412059	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14013	NC_016831	CCT	2	6	3412136	3412141	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14014	NC_016831	CTC	2	6	3412173	3412178	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14015	NC_016831	AGG	2	6	3412190	3412195	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14016	NC_016831	CCA	2	6	3412217	3412222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14017	NC_016831	GGT	2	6	3412277	3412282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14018	NC_016831	CAT	2	6	3412472	3412477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14019	NC_016831	GCC	2	6	3412547	3412552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14020	NC_016831	TAA	2	6	3412672	3412677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14021	NC_016831	CAGC	2	8	3412685	3412692	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
14022	NC_016831	GACT	2	8	3412703	3412710	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14023	NC_016831	TC	3	6	3412801	3412806	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14024	NC_016831	ACC	2	6	3412831	3412836	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14025	NC_016831	TCA	2	6	3412930	3412935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14026	NC_016831	AC	4	8	3412971	3412978	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14027	NC_016831	C	6	6	3413031	3413036	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
14028	NC_016831	AACG	2	8	3413273	3413280	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
14029	NC_016831	CGACT	2	10	3413292	3413301	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
14030	NC_016831	TCGCT	2	10	3413319	3413328	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
14031	NC_016831	CTTT	2	8	3413447	3413454	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
14032	NC_016831	ATG	2	6	3413457	3413462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14033	NC_016831	GCT	2	6	3413463	3413468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14034	NC_016831	GTT	2	6	3413553	3413558	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14035	NC_016831	ACG	2	6	3413568	3413573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14036	NC_016831	GT	3	6	3413590	3413595	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14037	NC_016831	TCGGT	2	10	3413799	3413808	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
14038	NC_016831	CA	3	6	3413983	3413988	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14039	NC_016831	GTAC	2	8	3414013	3414020	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14040	NC_016831	GTCA	2	8	3414096	3414103	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14041	NC_016831	GGA	2	6	3414119	3414124	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14042	NC_016831	C	6	6	3414129	3414134	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
14043	NC_016831	CG	3	6	3414221	3414226	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14044	NC_016831	AC	3	6	3414248	3414253	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14045	NC_016831	CTC	2	6	3414274	3414279	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14046	NC_016831	TCGC	2	8	3414285	3414292	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14047	NC_016831	TCA	2	6	3414567	3414572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14048	NC_016831	GA	3	6	3414590	3414595	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14049	NC_016831	AAC	2	6	3414602	3414607	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14050	NC_016831	GTT	2	6	3414612	3414617	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14051	NC_016831	TCAC	2	8	3414714	3414721	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
14052	NC_016831	CCG	2	6	3414765	3414770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14053	NC_016831	TCA	2	6	3414848	3414853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14054	NC_016831	TG	3	6	3414861	3414866	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14055	NC_016831	CTT	2	6	3414883	3414888	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14056	NC_016831	AGG	2	6	3414896	3414901	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14057	NC_016831	CTAC	2	8	3414995	3415002	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
14058	NC_016831	GT	3	6	3415038	3415043	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14059	NC_016831	ACG	2	6	3415139	3415144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14060	NC_016831	GT	3	6	3415207	3415212	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14061	NC_016831	ATG	2	6	3415232	3415237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14062	NC_016831	TCC	2	6	3415258	3415263	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14063	NC_016831	CAA	2	6	3415310	3415315	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14064	NC_016831	GAC	2	6	3415371	3415376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14065	NC_016831	GCA	2	6	3415383	3415388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14066	NC_016831	TTC	2	6	3415429	3415434	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14067	NC_016831	TTC	2	6	3415459	3415464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14068	NC_016831	GCC	2	6	3415702	3415707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14069	NC_016831	TCC	2	6	3415722	3415727	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14070	NC_016831	C	6	6	3415766	3415771	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
14071	NC_016831	TGCG	2	8	3415854	3415861	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14072	NC_016831	GCT	2	6	3415912	3415917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14073	NC_016831	CTT	2	6	3415937	3415942	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14074	NC_016831	TGC	2	6	3415960	3415965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14075	NC_016831	TTA	2	6	3415968	3415973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14076	NC_016831	TCC	2	6	3415986	3415991	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14077	NC_016831	CTT	2	6	3416021	3416026	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14078	NC_016831	CTG	2	6	3416080	3416085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14079	NC_016831	TCG	2	6	3416155	3416160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14080	NC_016831	CAA	2	6	3416183	3416188	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14081	NC_016831	AGT	2	6	3416280	3416285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14082	NC_016831	AGC	2	6	3416346	3416351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14083	NC_016831	GCT	2	6	3416354	3416359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14084	NC_016831	GCC	2	6	3416394	3416399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14085	NC_016831	CA	3	6	3416548	3416553	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14086	NC_016831	CTG	2	6	3416745	3416750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14087	NC_016831	TGC	2	6	3416785	3416790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14088	NC_016831	CT	3	6	3417029	3417034	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14089	NC_016831	CTTA	2	8	3422705	3422712	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14090	NC_016831	TTC	2	6	3422729	3422734	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14091	NC_016831	CG	3	6	3422747	3422752	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14092	NC_016831	GCC	2	6	3422833	3422838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14093	NC_016831	AG	4	8	3422895	3422902	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14094	NC_016831	GGC	2	6	3423403	3423408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14095	NC_016831	T	7	7	3424500	3424506	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14096	NC_016831	G	6	6	3424530	3424535	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
14097	NC_016831	GC	3	6	3427057	3427062	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14098	NC_016831	CGG	3	9	3427072	3427080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14099	NC_016831	CGC	2	6	3427149	3427154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14100	NC_016831	TCA	2	6	3427179	3427184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14101	NC_016831	CTC	2	6	3427249	3427254	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14102	NC_016831	CG	3	6	3427265	3427270	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14103	NC_016831	CAA	2	6	3427299	3427304	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14104	NC_016831	CAG	2	6	3427354	3427359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14105	NC_016831	CGG	2	6	3427373	3427378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14106	NC_016831	CGA	2	6	3427383	3427388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14107	NC_016831	TAG	2	6	3427412	3427417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14108	NC_016831	GC	3	6	3427654	3427659	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14109	NC_016831	GCC	2	6	3427681	3427686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14110	NC_016831	CCA	2	6	3427743	3427748	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14111	NC_016831	CT	3	6	3427753	3427758	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14112	NC_016831	TGT	2	6	3427812	3427817	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14113	NC_016831	ATT	2	6	3427822	3427827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14115	NC_016831	GGC	2	6	3428465	3428470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14116	NC_016831	TAAG	2	8	3428498	3428505	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14117	NC_016831	TGC	3	9	3428643	3428651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14118	NC_016831	GCG	2	6	3428660	3428665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14119	NC_016831	CGT	2	6	3428684	3428689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14120	NC_016831	T	6	6	3428710	3428715	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14121	NC_016831	CGAG	2	8	3434119	3434126	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
14122	NC_016831	T	7	7	3434167	3434173	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14123	NC_016831	ATT	2	6	3434226	3434231	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14124	NC_016831	TAAA	2	8	3434537	3434544	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14125	NC_016831	TAA	2	6	3434554	3434559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14126	NC_016831	AATTA	2	10	3434562	3434571	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
14127	NC_016831	CTT	2	6	3434580	3434585	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14128	NC_016831	GTA	2	6	3434655	3434660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14129	NC_016831	CAA	2	6	3434673	3434678	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14130	NC_016831	ATT	2	6	3434736	3434741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14131	NC_016831	ATG	2	6	3435804	3435809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14132	NC_016831	ATT	2	6	3435810	3435815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14133	NC_016831	T	6	6	3435824	3435829	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14134	NC_016831	GGA	2	6	3435878	3435883	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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14245	NC_016831	CTT	2	6	3458316	3458321	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14248	NC_016831	GT	3	6	3458470	3458475	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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14250	NC_016831	GT	3	6	3458639	3458644	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14251	NC_016831	ATG	2	6	3458664	3458669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14252	NC_016831	TCC	2	6	3458690	3458695	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14253	NC_016831	CAA	2	6	3458742	3458747	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14254	NC_016831	GAC	2	6	3458803	3458808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14255	NC_016831	GCA	2	6	3458815	3458820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14256	NC_016831	TTC	2	6	3458861	3458866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14388	NC_016831	CATT	2	8	3496173	3496180	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14389	NC_016831	ATA	2	6	3496199	3496204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14391	NC_016831	ATTA	2	8	3496248	3496255	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14422	NC_016831	CTCA	2	8	3508262	3508269	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
14423	NC_016831	CT	3	6	3508292	3508297	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14424	NC_016831	TGAT	2	8	3508320	3508327	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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