MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. RKS5078 chromosome

Total Repeats: 18925

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_016831	CGC	2	6	3111404	3111409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13002	NC_016831	GCC	2	6	3115797	3115802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13003	NC_016831	ATG	2	6	3116868	3116873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13004	NC_016831	ATA	2	6	3116886	3116891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13005	NC_016831	GTTG	2	8	3116894	3116901	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13006	NC_016831	AGTT	2	8	3120051	3120058	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13007	NC_016831	TGC	2	6	3120118	3120123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13008	NC_016831	AAT	2	6	3120139	3120144	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13009	NC_016831	ACA	2	6	3121602	3121607	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13010	NC_016831	CATCGG	2	12	3124280	3124291	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13011	NC_016831	TA	3	6	3124298	3124303	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13012	NC_016831	A	6	6	3124360	3124365	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13013	NC_016831	GCGCC	2	10	3124373	3124382	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
13014	NC_016831	CAC	2	6	3124401	3124406	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13015	NC_016831	CGG	2	6	3124419	3124424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13016	NC_016831	GCA	2	6	3124444	3124449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13017	NC_016831	CGCC	3	12	3124453	3124464	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
13018	NC_016831	CGC	2	6	3124490	3124495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13019	NC_016831	CTTT	2	8	3124546	3124553	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
13020	NC_016831	GCG	2	6	3124691	3124696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13021	NC_016831	CGG	2	6	3124766	3124771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13022	NC_016831	GCCAT	2	10	3124965	3124974	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
13023	NC_016831	GAA	2	6	3124995	3125000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13024	NC_016831	ACG	2	6	3125001	3125006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13025	NC_016831	TGCC	2	8	3125034	3125041	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13026	NC_016831	ACC	2	6	3125056	3125061	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13027	NC_016831	GGC	2	6	3125143	3125148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13028	NC_016831	GTT	2	6	3125240	3125245	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13029	NC_016831	T	6	6	3125294	3125299	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13030	NC_016831	CAT	2	6	3125411	3125416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13031	NC_016831	CCA	2	6	3125488	3125493	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13032	NC_016831	TCACG	2	10	3125584	3125593	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
13033	NC_016831	TCA	2	6	3125616	3125621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13034	NC_016831	ACC	2	6	3125639	3125644	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13035	NC_016831	CGC	2	6	3125666	3125671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13036	NC_016831	GTG	2	6	3125714	3125719	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13037	NC_016831	ATT	2	6	3125732	3125737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13038	NC_016831	CGC	2	6	3125758	3125763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13039	NC_016831	CAG	2	6	3125768	3125773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13040	NC_016831	CGC	2	6	3125795	3125800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13041	NC_016831	A	6	6	3125951	3125956	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13042	NC_016831	GGC	2	6	3125968	3125973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13043	NC_016831	A	6	6	3125990	3125995	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13044	NC_016831	GGC	2	6	3126072	3126077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13045	NC_016831	GGC	2	6	3126101	3126106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13046	NC_016831	CCG	2	6	3126138	3126143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13047	NC_016831	CCG	2	6	3126148	3126153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13048	NC_016831	GC	3	6	3126166	3126171	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13049	NC_016831	GAC	2	6	3126266	3126271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13050	NC_016831	GGTG	2	8	3126319	3126326	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
13051	NC_016831	GGC	2	6	3126353	3126358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13052	NC_016831	GAGTA	2	10	3126398	3126407	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
13053	NC_016831	TGT	2	6	3126512	3126517	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13054	NC_016831	A	7	7	3126562	3126568	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13055	NC_016831	GAAA	2	8	3126570	3126577	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
13056	NC_016831	AAC	2	6	3127522	3127527	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13057	NC_016831	GTG	2	6	3127531	3127536	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13058	NC_016831	GAA	2	6	3127563	3127568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13059	NC_016831	CAC	2	6	3127685	3127690	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13060	NC_016831	T	6	6	3127697	3127702	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13061	NC_016831	ATT	2	6	3127768	3127773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13062	NC_016831	ATA	2	6	3127817	3127822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13063	NC_016831	TAGA	2	8	3127897	3127904	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13064	NC_016831	TC	3	6	3127929	3127934	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13065	NC_016831	CAA	2	6	3127946	3127951	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13066	NC_016831	TGCC	2	8	3127958	3127965	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13067	NC_016831	ACA	2	6	3127981	3127986	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13068	NC_016831	TAA	2	6	3128006	3128011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13069	NC_016831	T	6	6	3128087	3128092	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13070	NC_016831	TGTTT	2	10	3128117	3128126	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
13071	NC_016831	AT	3	6	3128180	3128185	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13072	NC_016831	ATG	2	6	3128241	3128246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13073	NC_016831	A	6	6	3128271	3128276	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13074	NC_016831	TAA	2	6	3130186	3130191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13075	NC_016831	CCT	2	6	3131043	3131048	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13076	NC_016831	ATT	2	6	3131078	3131083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13077	NC_016831	AT	3	6	3131087	3131092	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13078	NC_016831	AAT	2	6	3132027	3132032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13079	NC_016831	TGT	2	6	3133821	3133826	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13080	NC_016831	GCG	2	6	3133833	3133838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13081	NC_016831	A	6	6	3135343	3135348	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13082	NC_016831	TAA	2	6	3135355	3135360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13083	NC_016831	ATT	2	6	3135367	3135372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13084	NC_016831	T	6	6	3135371	3135376	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13085	NC_016831	ATTT	2	8	3135408	3135415	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13086	NC_016831	A	6	6	3135428	3135433	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13087	NC_016831	ATT	2	6	3135452	3135457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13088	NC_016831	AT	3	6	3136290	3136295	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13089	NC_016831	CT	3	6	3136312	3136317	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13090	NC_016831	TCA	2	6	3139087	3139092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13091	NC_016831	A	6	6	3139189	3139194	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13092	NC_016831	ATT	2	6	3139196	3139201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13093	NC_016831	GCA	2	6	3139329	3139334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13094	NC_016831	CAG	2	6	3139379	3139384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13095	NC_016831	GTA	2	6	3139406	3139411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13096	NC_016831	CAA	2	6	3139465	3139470	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13097	NC_016831	GA	3	6	3139479	3139484	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13098	NC_016831	ATT	2	6	3139547	3139552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13099	NC_016831	GTAC	2	8	3139608	3139615	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13100	NC_016831	C	6	6	3139734	3139739	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
13101	NC_016831	CTG	2	6	3139781	3139786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13102	NC_016831	ATC	2	6	3139814	3139819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13103	NC_016831	AGC	2	6	3139829	3139834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13104	NC_016831	TTG	2	6	3139853	3139858	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13105	NC_016831	AAT	2	6	3139949	3139954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13106	NC_016831	T	6	6	3140012	3140017	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13107	NC_016831	CCG	2	6	3140058	3140063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13108	NC_016831	GCC	2	6	3140075	3140080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13109	NC_016831	ACA	2	6	3140109	3140114	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13110	NC_016831	CAC	2	6	3140180	3140185	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13111	NC_016831	T	6	6	3140231	3140236	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13112	NC_016831	GTA	2	6	3140246	3140251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13113	NC_016831	TCA	2	6	3140291	3140296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13114	NC_016831	GAA	2	6	3140351	3140356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13115	NC_016831	ATG	2	6	3141936	3141941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13116	NC_016831	AGC	2	6	3142298	3142303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13117	NC_016831	CGT	2	6	3142361	3142366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13118	NC_016831	TTG	2	6	3142937	3142942	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13119	NC_016831	CAG	2	6	3142957	3142962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13120	NC_016831	CGG	2	6	3142975	3142980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13121	NC_016831	TTA	2	6	3142997	3143002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13122	NC_016831	A	6	6	3143017	3143022	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13123	NC_016831	TGA	2	6	3143077	3143082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13124	NC_016831	CT	3	6	3143160	3143165	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13125	NC_016831	CGT	2	6	3143217	3143222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13126	NC_016831	ATTTT	2	10	3143400	3143409	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
13127	NC_016831	TTA	2	6	3143441	3143446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13129	NC_016831	A	6	6	3143477	3143482	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13262	NC_016831	GGC	2	6	3178533	3178538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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13267	NC_016831	CG	3	6	3178715	3178720	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13268	NC_016831	GCTC	2	8	3178778	3178785	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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13387	NC_016831	AT	3	6	3205958	3205963	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13388	NC_016831	GGAA	2	8	3207769	3207776	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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13500	NC_016831	CCCT	2	8	3246401	3246408	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding

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