MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. RKS5078 chromosome

Total Repeats: 18925

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_016831	AAC	2	6	2580071	2580076	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10502	NC_016831	CTC	2	6	2580993	2580998	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10503	NC_016831	T	6	6	2581000	2581005	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10504	NC_016831	CCG	2	6	2582039	2582044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10505	NC_016831	ATT	2	6	2582362	2582367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10506	NC_016831	TTA	2	6	2583106	2583111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10507	NC_016831	TCG	2	6	2583114	2583119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10508	NC_016831	AGC	2	6	2583183	2583188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10509	NC_016831	ATTGT	2	10	2583231	2583240	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
10510	NC_016831	ATCAT	2	10	2584165	2584174	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
10511	NC_016831	ATA	2	6	2584201	2584206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10512	NC_016831	AC	3	6	2584604	2584609	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10513	NC_016831	C	6	6	2586416	2586421	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10514	NC_016831	ATC	2	6	2586482	2586487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10515	NC_016831	AGG	2	6	2586488	2586493	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10516	NC_016831	GGC	2	6	2586498	2586503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10517	NC_016831	TCA	2	6	2586539	2586544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10518	NC_016831	ATT	2	6	2586548	2586553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10519	NC_016831	GGA	2	6	2586604	2586609	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10520	NC_016831	TA	3	6	2587041	2587046	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10521	NC_016831	ACC	2	6	2587071	2587076	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10522	NC_016831	TTAC	2	8	2587091	2587098	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10523	NC_016831	AT	3	6	2587107	2587112	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10524	NC_016831	ATTG	2	8	2587118	2587125	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10525	NC_016831	AGA	2	6	2587177	2587182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10526	NC_016831	TTA	2	6	2587204	2587209	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10527	NC_016831	TCT	2	6	2587233	2587238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10528	NC_016831	AAC	2	6	2587300	2587305	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10529	NC_016831	TGT	2	6	2587308	2587313	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10530	NC_016831	TTA	2	6	2587598	2587603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10531	NC_016831	GAA	2	6	2587628	2587633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10532	NC_016831	AAT	2	6	2587689	2587694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10533	NC_016831	ATA	2	6	2587742	2587747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10534	NC_016831	A	6	6	2587755	2587760	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10535	NC_016831	AAT	2	6	2587762	2587767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10536	NC_016831	AT	3	6	2587825	2587830	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10537	NC_016831	TTTAA	2	10	2587833	2587842	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
10538	NC_016831	A	7	7	2589043	2589049	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10539	NC_016831	CCAAA	2	10	2589053	2589062	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
10540	NC_016831	TTAGC	2	10	2589128	2589137	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
10541	NC_016831	TGG	2	6	2589153	2589158	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10542	NC_016831	TCA	2	6	2589204	2589209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10543	NC_016831	TA	3	6	2589231	2589236	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10544	NC_016831	CAA	2	6	2591411	2591416	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10545	NC_016831	GGCG	2	8	2591439	2591446	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
10546	NC_016831	TTAA	2	8	2591478	2591485	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10547	NC_016831	ATC	2	6	2591638	2591643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10548	NC_016831	GC	3	6	2591971	2591976	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10549	NC_016831	CTT	2	6	2594348	2594353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10550	NC_016831	GCT	2	6	2594366	2594371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10551	NC_016831	CGG	2	6	2594376	2594381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10552	NC_016831	CGA	2	6	2594480	2594485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10553	NC_016831	CAG	2	6	2594496	2594501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10554	NC_016831	CCG	2	6	2594570	2594575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10555	NC_016831	T	6	6	2594581	2594586	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10556	NC_016831	T	6	6	2594594	2594599	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10557	NC_016831	GCC	2	6	2594621	2594626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10558	NC_016831	GTA	2	6	2594629	2594634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10559	NC_016831	ACC	2	6	2594647	2594652	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10560	NC_016831	GTC	2	6	2595836	2595841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10561	NC_016831	AAT	2	6	2596517	2596522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10562	NC_016831	GA	3	6	2596577	2596582	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10563	NC_016831	CCG	3	9	2596641	2596649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10564	NC_016831	TTC	2	6	2596680	2596685	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10565	NC_016831	GTT	2	6	2596772	2596777	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10566	NC_016831	GTC	2	6	2596781	2596786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10567	NC_016831	GTC	2	6	2596928	2596933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10568	NC_016831	AGA	2	6	2597036	2597041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10569	NC_016831	GTT	2	6	2597090	2597095	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10570	NC_016831	CAA	2	6	2597122	2597127	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10571	NC_016831	TGT	2	6	2597131	2597136	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10572	NC_016831	CTG	2	6	2597227	2597232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10573	NC_016831	GTT	2	6	2597255	2597260	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10574	NC_016831	ATG	2	6	2597289	2597294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10575	NC_016831	CCG	2	6	2597346	2597351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10576	NC_016831	GCC	2	6	2597369	2597374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10577	NC_016831	TTTG	2	8	2597564	2597571	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
10578	NC_016831	CCGTTA	2	12	2597766	2597777	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
10579	NC_016831	GTCGT	2	10	2597835	2597844	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
10580	NC_016831	GTCAG	2	10	2597859	2597868	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
10581	NC_016831	ATT	2	6	2598005	2598010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10582	NC_016831	GCA	2	6	2598039	2598044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10583	NC_016831	CCAG	2	8	2598056	2598063	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10584	NC_016831	CAT	2	6	2598070	2598075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10585	NC_016831	ACC	2	6	2598155	2598160	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10586	NC_016831	CAA	2	6	2598199	2598204	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10587	NC_016831	ACA	2	6	2598208	2598213	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10588	NC_016831	ATCA	2	8	2598237	2598244	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10589	NC_016831	TAG	2	6	2598254	2598259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10590	NC_016831	AGTTGC	2	12	2598417	2598428	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
10591	NC_016831	TGC	2	6	2598570	2598575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10592	NC_016831	ATT	2	6	2598594	2598599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10593	NC_016831	GAA	2	6	2598687	2598692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10594	NC_016831	ACA	2	6	2598718	2598723	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10595	NC_016831	CGT	2	6	2598756	2598761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10596	NC_016831	TGCAT	2	10	2598763	2598772	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
10597	NC_016831	CGCAAT	2	12	2598798	2598809	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
10598	NC_016831	TCA	2	6	2598811	2598816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10599	NC_016831	TTA	2	6	2598847	2598852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10600	NC_016831	TCA	2	6	2598880	2598885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10601	NC_016831	CAA	2	6	2598914	2598919	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10602	NC_016831	ATTG	2	8	2598921	2598928	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10603	NC_016831	TTA	2	6	2598931	2598936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10604	NC_016831	ACT	2	6	2598945	2598950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10605	NC_016831	TCG	2	6	2598976	2598981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10606	NC_016831	ATT	2	6	2599032	2599037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10607	NC_016831	CAA	2	6	2599097	2599102	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10609	NC_016831	TAG	2	6	2599169	2599174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10610	NC_016831	ATAC	2	8	2599205	2599212	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10611	NC_016831	GTA	2	6	2599315	2599320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10612	NC_016831	CAT	2	6	2599325	2599330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10613	NC_016831	TAG	2	6	2599336	2599341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10614	NC_016831	CG	3	6	2599363	2599368	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10615	NC_016831	GTT	2	6	2599419	2599424	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10616	NC_016831	CAT	2	6	2599439	2599444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10618	NC_016831	TGA	2	6	2599480	2599485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10619	NC_016831	TAG	3	9	2599517	2599525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10620	NC_016831	CTC	2	6	2599614	2599619	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10621	NC_016831	A	8	8	2599821	2599828	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10622	NC_016831	AAT	2	6	2599879	2599884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10623	NC_016831	AAC	2	6	2599929	2599934	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10624	NC_016831	TA	3	6	2599988	2599993	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10625	NC_016831	CTG	2	6	2600010	2600015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10627	NC_016831	GCG	2	6	2601105	2601110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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10887	NC_016831	CG	3	6	2641415	2641420	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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