MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. RKS5078 chromosome

Total Repeats: 18925

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_016831	AACG	2	8	2421213	2421220	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10002	NC_016831	TCT	2	6	2421325	2421330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10003	NC_016831	CT	3	6	2421329	2421334	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10004	NC_016831	ATC	2	6	2422437	2422442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10005	NC_016831	GT	3	6	2425744	2425749	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10006	NC_016831	TAA	2	6	2425753	2425758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10007	NC_016831	ATT	2	6	2425775	2425780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10008	NC_016831	AGC	2	6	2425790	2425795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10009	NC_016831	CAC	2	6	2425870	2425875	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10010	NC_016831	TCG	2	6	2427122	2427127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10011	NC_016831	GC	3	6	2427142	2427147	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10012	NC_016831	AGC	2	6	2427199	2427204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10013	NC_016831	CAC	2	6	2427213	2427218	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10014	NC_016831	GCG	2	6	2428818	2428823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10015	NC_016831	CGC	2	6	2428834	2428839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10016	NC_016831	GGAT	2	8	2430539	2430546	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
10017	NC_016831	A	6	6	2433660	2433665	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10018	NC_016831	TTTA	2	8	2433670	2433677	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10019	NC_016831	AAAT	2	8	2433707	2433714	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10020	NC_016831	T	7	7	2433725	2433731	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10021	NC_016831	ATTTT	2	10	2433753	2433762	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
10022	NC_016831	CGT	2	6	2433795	2433800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10023	NC_016831	CGC	2	6	2433890	2433895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10024	NC_016831	TCAC	2	8	2433937	2433944	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10025	NC_016831	CGAA	2	8	2433973	2433980	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10026	NC_016831	GGC	2	6	2433989	2433994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10027	NC_016831	TGC	2	6	2434063	2434068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10028	NC_016831	A	9	9	2434118	2434126	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10029	NC_016831	GCG	2	6	2434165	2434170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10030	NC_016831	GCT	2	6	2434194	2434199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10031	NC_016831	GTCT	2	8	2434216	2434223	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10032	NC_016831	GGCGG	2	10	2434257	2434266	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
10033	NC_016831	CAT	2	6	2434322	2434327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10034	NC_016831	CCA	2	6	2434342	2434347	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10035	NC_016831	GC	3	6	2434429	2434434	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10036	NC_016831	TTA	2	6	2434464	2434469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10037	NC_016831	CGC	2	6	2434472	2434477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10038	NC_016831	TGA	4	12	2434498	2434509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10039	NC_016831	CTG	2	6	2434530	2434535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10040	NC_016831	GCC	2	6	2434549	2434554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10041	NC_016831	TTCTT	2	10	2434629	2434638	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
10042	NC_016831	ATT	2	6	2434646	2434651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10043	NC_016831	TAT	2	6	2434722	2434727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10044	NC_016831	CAGGAT	2	12	2434734	2434745	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
10045	NC_016831	TTG	2	6	2434783	2434788	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10046	NC_016831	A	6	6	2434844	2434849	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10047	NC_016831	AAT	2	6	2434861	2434866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10048	NC_016831	CGG	2	6	2436919	2436924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10049	NC_016831	ATT	2	6	2436937	2436942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10050	NC_016831	T	7	7	2436987	2436993	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10051	NC_016831	CCA	2	6	2438225	2438230	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10052	NC_016831	ATC	2	6	2438257	2438262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10053	NC_016831	GGA	2	6	2438287	2438292	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10054	NC_016831	A	7	7	2438302	2438308	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10055	NC_016831	CG	3	6	2438347	2438352	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10056	NC_016831	TAAAG	2	10	2438389	2438398	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
10057	NC_016831	GCT	2	6	2438424	2438429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10058	NC_016831	CAG	2	6	2438484	2438489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10059	NC_016831	GC	3	6	2438495	2438500	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10060	NC_016831	TAA	2	6	2438544	2438549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10061	NC_016831	TCA	2	6	2438608	2438613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10062	NC_016831	TCA	2	6	2438728	2438733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10063	NC_016831	CCG	2	6	2438734	2438739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10064	NC_016831	AAT	2	6	2438744	2438749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10065	NC_016831	CGG	2	6	2438807	2438812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10066	NC_016831	TGA	2	6	2438819	2438824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10067	NC_016831	GCT	2	6	2438893	2438898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10068	NC_016831	ATC	2	6	2438910	2438915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10069	NC_016831	A	6	6	2439017	2439022	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10070	NC_016831	GC	3	6	2439037	2439042	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10071	NC_016831	AGC	2	6	2439048	2439053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10072	NC_016831	A	7	7	2439057	2439063	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10073	NC_016831	CCG	2	6	2439070	2439075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10074	NC_016831	CGAC	2	8	2439154	2439161	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10075	NC_016831	GCG	2	6	2439184	2439189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10076	NC_016831	CAC	2	6	2439234	2439239	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10077	NC_016831	CAGG	2	8	2439293	2439300	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10078	NC_016831	GGT	2	6	2439308	2439313	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10079	NC_016831	A	6	6	2439315	2439320	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10080	NC_016831	TG	3	6	2439327	2439332	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10081	NC_016831	ACA	2	6	2439433	2439438	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10082	NC_016831	TAA	2	6	2439451	2439456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10083	NC_016831	AT	3	6	2439463	2439468	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10084	NC_016831	CGT	2	6	2439493	2439498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10085	NC_016831	GAC	2	6	2439499	2439504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10086	NC_016831	GTT	2	6	2442448	2442453	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10087	NC_016831	AAAT	2	8	2442475	2442482	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10088	NC_016831	ATAAA	2	10	2442483	2442492	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
10089	NC_016831	TAG	2	6	2442497	2442502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10090	NC_016831	ATT	2	6	2442508	2442513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10091	NC_016831	TTC	2	6	2443764	2443769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10092	NC_016831	A	7	7	2444775	2444781	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10093	NC_016831	ATT	2	6	2444793	2444798	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10094	NC_016831	TTA	2	6	2447394	2447399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10095	NC_016831	A	6	6	2447428	2447433	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10096	NC_016831	AGCG	2	8	2447444	2447451	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10097	NC_016831	AAG	2	6	2448342	2448347	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10098	NC_016831	TAT	2	6	2448993	2448998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10099	NC_016831	ACT	2	6	2449004	2449009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10100	NC_016831	AGG	2	6	2449052	2449057	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10101	NC_016831	GAT	2	6	2450037	2450042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10102	NC_016831	CTG	2	6	2453840	2453845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10103	NC_016831	ATT	2	6	2453854	2453859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10104	NC_016831	T	6	6	2454270	2454275	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10105	NC_016831	GTC	2	6	2454277	2454282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10106	NC_016831	CCG	2	6	2454301	2454306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10107	NC_016831	GCG	2	6	2454310	2454315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10108	NC_016831	TCG	2	6	2454436	2454441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10109	NC_016831	CCG	2	6	2454469	2454474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10110	NC_016831	TCG	2	6	2454514	2454519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10111	NC_016831	CAC	2	6	2454675	2454680	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10112	NC_016831	TAA	2	6	2454685	2454690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10113	NC_016831	CTGTT	2	10	2454694	2454703	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
10114	NC_016831	ATC	2	6	2454855	2454860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10115	NC_016831	ATA	2	6	2454867	2454872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10116	NC_016831	CGAT	2	8	2455085	2455092	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10117	NC_016831	GCC	2	6	2455093	2455098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10118	NC_016831	GATA	2	8	2455134	2455141	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10119	NC_016831	ATA	2	6	2455168	2455173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10120	NC_016831	T	6	6	2455202	2455207	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10121	NC_016831	CTA	2	6	2455219	2455224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10122	NC_016831	A	6	6	2455255	2455260	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10123	NC_016831	ATT	2	6	2455290	2455295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10124	NC_016831	CAT	2	6	2455298	2455303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10125	NC_016831	GGC	2	6	2459009	2459014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10126	NC_016831	AACG	2	8	2459061	2459068	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10127	NC_016831	GC	3	6	2459921	2459926	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10128	NC_016831	AG	3	6	2459961	2459966	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10129	NC_016831	GCA	2	6	2460015	2460020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10130	NC_016831	GAT	2	6	2460174	2460179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10131	NC_016831	CGC	2	6	2460180	2460185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10132	NC_016831	GC	3	6	2460198	2460203	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10133	NC_016831	CTG	2	6	2460286	2460291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10134	NC_016831	GAA	2	6	2460310	2460315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10135	NC_016831	CAA	2	6	2460328	2460333	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10138	NC_016831	CAGGAT	2	12	2460502	2460513	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
10139	NC_016831	GGC	2	6	2460558	2460563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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10142	NC_016831	GTTGCA	2	12	2460642	2460653	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
10143	NC_016831	GAA	2	6	2460670	2460675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10144	NC_016831	GCC	3	9	2460715	2460723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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10146	NC_016831	CT	3	6	2460831	2460836	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10147	NC_016831	GC	3	6	2460846	2460851	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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10151	NC_016831	TAAT	2	8	2462406	2462413	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10152	NC_016831	G	7	7	2462416	2462422	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10153	NC_016831	AGG	2	6	2462492	2462497	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10154	NC_016831	TGA	2	6	2464369	2464374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10155	NC_016831	GAAA	2	8	2464460	2464467	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
10156	NC_016831	AAC	2	6	2464474	2464479	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10161	NC_016831	CGC	2	6	2464902	2464907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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10164	NC_016831	CGGT	2	8	2464975	2464982	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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10168	NC_016831	GCGG	2	8	2465091	2465098	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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10212	NC_016831	GTA	2	6	2468945	2468950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10226	NC_016831	AAAAT	2	10	2476011	2476020	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10240	NC_016831	GC	3	6	2476521	2476526	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10241	NC_016831	TGT	2	6	2476575	2476580	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10242	NC_016831	GCC	2	6	2476614	2476619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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10246	NC_016831	GCC	2	6	2476753	2476758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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10250	NC_016831	ATG	2	6	2476898	2476903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10251	NC_016831	CGA	2	6	2476912	2476917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10252	NC_016831	CTT	2	6	2476939	2476944	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10253	NC_016831	GCC	2	6	2477933	2477938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10254	NC_016831	A	6	6	2478154	2478159	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10256	NC_016831	ACC	2	6	2478857	2478862	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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10381	NC_016831	CA	3	6	2531800	2531805	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10382	NC_016831	TCA	2	6	2531818	2531823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10388	NC_016831	AAT	2	6	2532115	2532120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10389	NC_016831	T	6	6	2532144	2532149	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10390	NC_016831	TTG	2	6	2532179	2532184	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10395	NC_016831	A	6	6	2532272	2532277	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10484	NC_016831	CCCT	2	8	2566219	2566226	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
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10500	NC_016831	GGT	2	6	2578878	2578883	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding

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