MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. RKS5078 chromosome

Total Repeats: 18925

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9501	NC_016831	CGA	2	6	2263266	2263271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9502	NC_016831	T	6	6	2263338	2263343	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9503	NC_016831	GC	3	6	2263416	2263421	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9504	NC_016831	GC	4	8	2263425	2263432	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9505	NC_016831	GAA	2	6	2263441	2263446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9506	NC_016831	CGG	2	6	2263609	2263614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9507	NC_016831	GC	3	6	2263625	2263630	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9508	NC_016831	CCG	2	6	2263679	2263684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9509	NC_016831	GCC	2	6	2263742	2263747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9510	NC_016831	TGG	2	6	2263762	2263767	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9511	NC_016831	GC	4	8	2263801	2263808	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9512	NC_016831	TCG	2	6	2263827	2263832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9513	NC_016831	GCC	2	6	2263843	2263848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9514	NC_016831	CAC	2	6	2263948	2263953	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9515	NC_016831	CGC	2	6	2263987	2263992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9516	NC_016831	GTG	2	6	2264024	2264029	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9517	NC_016831	GCT	2	6	2264035	2264040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9518	NC_016831	GGT	2	6	2264059	2264064	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9519	NC_016831	T	6	6	2264099	2264104	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9520	NC_016831	CTG	2	6	2264147	2264152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9521	NC_016831	GC	3	6	2264219	2264224	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9522	NC_016831	CGC	2	6	2264308	2264313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9523	NC_016831	AGCG	2	8	2264318	2264325	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
9524	NC_016831	GC	3	6	2264348	2264353	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9525	NC_016831	TTA	2	6	2264363	2264368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9526	NC_016831	TGC	2	6	2264388	2264393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9527	NC_016831	CACC	2	8	2264398	2264405	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
9528	NC_016831	GAC	2	6	2264426	2264431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9529	NC_016831	GC	3	6	2264438	2264443	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9530	NC_016831	CCCT	2	8	2264487	2264494	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
9531	NC_016831	TCG	2	6	2264553	2264558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9532	NC_016831	AGC	2	6	2264592	2264597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9533	NC_016831	CTG	2	6	2264603	2264608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9534	NC_016831	GAA	2	6	2264666	2264671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9535	NC_016831	AGCG	2	8	2264687	2264694	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
9536	NC_016831	CTG	2	6	2264714	2264719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9537	NC_016831	ACGC	2	8	2264740	2264747	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
9538	NC_016831	CG	3	6	2264815	2264820	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9539	NC_016831	ACC	2	6	2264855	2264860	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9540	NC_016831	AAT	2	6	2264870	2264875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9541	NC_016831	CGG	2	6	2264902	2264907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9542	NC_016831	A	6	6	2264918	2264923	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9543	NC_016831	GTC	2	6	2264945	2264950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9544	NC_016831	TGC	2	6	2265121	2265126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9545	NC_016831	AGA	2	6	2265195	2265200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9546	NC_016831	CAA	2	6	2265223	2265228	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9547	NC_016831	CCG	2	6	2265234	2265239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9548	NC_016831	TGGGGC	2	12	2265249	2265260	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
9549	NC_016831	TGGGGC	2	12	2265267	2265278	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
9550	NC_016831	CGG	2	6	2265310	2265315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9551	NC_016831	GCG	2	6	2265345	2265350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9552	NC_016831	ACC	2	6	2265382	2265387	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9553	NC_016831	ATT	2	6	2266103	2266108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9554	NC_016831	ATTT	2	8	2266135	2266142	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9555	NC_016831	AAT	2	6	2266154	2266159	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9556	NC_016831	ATATT	2	10	2266173	2266182	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
9557	NC_016831	A	6	6	2266196	2266201	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9558	NC_016831	ATT	2	6	2266266	2266271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9559	NC_016831	T	6	6	2266285	2266290	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9560	NC_016831	GGT	2	6	2266470	2266475	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9561	NC_016831	TA	3	6	2266602	2266607	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9562	NC_016831	AGA	2	6	2266615	2266620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9563	NC_016831	GTA	2	6	2266670	2266675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9564	NC_016831	TTA	2	6	2266723	2266728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9565	NC_016831	T	7	7	2266755	2266761	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9566	NC_016831	T	6	6	2266781	2266786	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9567	NC_016831	GAA	2	6	2266790	2266795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9568	NC_016831	GC	3	6	2270371	2270376	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9569	NC_016831	AGCGC	2	10	2270972	2270981	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
9570	NC_016831	A	6	6	2270991	2270996	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9571	NC_016831	TTC	2	6	2271016	2271021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9572	NC_016831	A	7	7	2273330	2273336	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9573	NC_016831	ATA	2	6	2273384	2273389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9574	NC_016831	A	7	7	2273408	2273414	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9575	NC_016831	CCA	3	9	2274733	2274741	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9576	NC_016831	GCG	2	6	2275310	2275315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9577	NC_016831	AAT	2	6	2275358	2275363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9578	NC_016831	TTA	2	6	2275453	2275458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9579	NC_016831	GA	3	6	2275467	2275472	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9580	NC_016831	T	6	6	2276074	2276079	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9581	NC_016831	TCC	2	6	2276083	2276088	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9582	NC_016831	A	6	6	2276120	2276125	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9583	NC_016831	GC	3	6	2277103	2277108	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9584	NC_016831	TTAT	2	8	2277112	2277119	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9585	NC_016831	GTGG	2	8	2281089	2281096	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
9586	NC_016831	TCACG	2	10	2281526	2281535	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
9587	NC_016831	ACC	2	6	2281560	2281565	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9588	NC_016831	CCT	2	6	2281640	2281645	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9589	NC_016831	GTA	2	6	2281704	2281709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9590	NC_016831	CAGCC	2	10	2281775	2281784	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
9591	NC_016831	GAA	2	6	2281821	2281826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9592	NC_016831	CCA	2	6	2281869	2281874	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9593	NC_016831	GAC	2	6	2281883	2281888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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9595	NC_016831	CGT	2	6	2282033	2282038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9596	NC_016831	CG	4	8	2282072	2282079	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9597	NC_016831	TGG	2	6	2282096	2282101	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9598	NC_016831	GCC	2	6	2282112	2282117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9599	NC_016831	CGC	2	6	2282181	2282186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9600	NC_016831	TGGAG	2	10	2282228	2282237	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
9601	NC_016831	T	7	7	2282252	2282258	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9602	NC_016831	GCG	2	6	2282411	2282416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9603	NC_016831	GC	4	8	2282452	2282459	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9604	NC_016831	CGG	2	6	2282486	2282491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9605	NC_016831	TCG	2	6	2282533	2282538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9606	NC_016831	CGC	2	6	2282619	2282624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9607	NC_016831	AAT	2	6	2282756	2282761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9608	NC_016831	GCC	2	6	2282766	2282771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9609	NC_016831	GTC	2	6	2282784	2282789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9610	NC_016831	AAC	2	6	2282817	2282822	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9611	NC_016831	AGCCAG	2	12	2282856	2282867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9612	NC_016831	TAC	2	6	2282870	2282875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9613	NC_016831	TGC	2	6	2282924	2282929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9614	NC_016831	A	6	6	2282948	2282953	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9615	NC_016831	TAAAAA	2	12	2282954	2282965	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9616	NC_016831	TAC	2	6	2282987	2282992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9617	NC_016831	TAA	2	6	2283050	2283055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9618	NC_016831	CTG	2	6	2283099	2283104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9619	NC_016831	AGAA	2	8	2283124	2283131	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
9620	NC_016831	AAT	2	6	2283159	2283164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9621	NC_016831	TAA	2	6	2283201	2283206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9622	NC_016831	AAT	2	6	2283221	2283226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9623	NC_016831	AAT	2	6	2283235	2283240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9624	NC_016831	A	6	6	2283254	2283259	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9625	NC_016831	CCA	2	6	2283282	2283287	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9626	NC_016831	GC	3	6	2283322	2283327	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9627	NC_016831	GTA	2	6	2283346	2283351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9628	NC_016831	GCC	2	6	2283385	2283390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9629	NC_016831	GCG	2	6	2283395	2283400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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9631	NC_016831	CGC	2	6	2283499	2283504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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