MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. RKS5078 chromosome

Total Repeats: 18925

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_016831	CT	3	6	116260	116265	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
502	NC_016831	TAATT	2	10	116269	116278	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_016831	ATTTT	2	10	116295	116304	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_016831	CGGGTG	2	12	116311	116322	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
505	NC_016831	AAATG	2	10	117588	117597	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
506	NC_016831	TCCA	2	8	120853	120860	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
507	NC_016831	AG	3	6	120885	120890	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
508	NC_016831	CAGG	2	8	120907	120914	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
509	NC_016831	AATGCT	2	12	120937	120948	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
510	NC_016831	TCA	2	6	121089	121094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_016831	GTC	2	6	121125	121130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
512	NC_016831	TCT	2	6	121154	121159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
513	NC_016831	ATG	2	6	122037	122042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
514	NC_016831	TCA	2	6	122126	122131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_016831	AC	3	6	122141	122146	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
516	NC_016831	GGC	2	6	122933	122938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
517	NC_016831	TAT	2	6	128085	128090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_016831	AAT	2	6	128105	128110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_016831	AAGAGG	2	12	128126	128137	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
520	NC_016831	CAT	2	6	128279	128284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
521	NC_016831	CAG	2	6	128329	128334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_016831	ATA	2	6	128335	128340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_016831	CTG	2	6	128342	128347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
524	NC_016831	T	7	7	128350	128356	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_016831	GAC	2	6	128376	128381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_016831	CGG	2	6	128411	128416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
527	NC_016831	TGA	2	6	128435	128440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
528	NC_016831	T	7	7	128506	128512	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_016831	ATC	2	6	128520	128525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
530	NC_016831	TTG	2	6	132043	132048	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
531	NC_016831	CGG	2	6	132092	132097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
532	NC_016831	GGA	2	6	132138	132143	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
533	NC_016831	CGA	2	6	132146	132151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
534	NC_016831	GCG	2	6	132180	132185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_016831	ATG	2	6	132189	132194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
536	NC_016831	ACG	2	6	132199	132204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
537	NC_016831	CGT	2	6	132272	132277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
538	NC_016831	GCCGTT	2	12	132321	132332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
539	NC_016831	CGC	2	6	132333	132338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
540	NC_016831	CAC	2	6	132356	132361	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
541	NC_016831	TTC	2	6	132441	132446	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
542	NC_016831	TAA	2	6	132458	132463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_016831	T	6	6	132501	132506	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_016831	CGT	2	6	132527	132532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_016831	TGT	2	6	132545	132550	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
546	NC_016831	CGG	2	6	132593	132598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
547	NC_016831	TGG	2	6	132700	132705	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
548	NC_016831	TTG	2	6	132748	132753	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
549	NC_016831	CTGG	2	8	132789	132796	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
550	NC_016831	GTG	2	6	132810	132815	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
551	NC_016831	GT	3	6	132826	132831	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
552	NC_016831	ATG	2	6	132838	132843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
553	NC_016831	CTT	2	6	132872	132877	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
554	NC_016831	CG	3	6	132934	132939	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
555	NC_016831	GCC	2	6	132952	132957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
556	NC_016831	TCG	2	6	132985	132990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
557	NC_016831	GAT	2	6	133005	133010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
558	NC_016831	CCA	2	6	133136	133141	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
559	NC_016831	CG	3	6	133142	133147	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
560	NC_016831	TCA	2	6	133198	133203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
561	NC_016831	CG	3	6	133236	133241	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
562	NC_016831	TGC	2	6	133262	133267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_016831	TGG	2	6	133274	133279	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
564	NC_016831	AAT	2	6	133581	133586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_016831	ATG	2	6	133600	133605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
566	NC_016831	A	7	7	133642	133648	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_016831	TTTG	2	8	133668	133675	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
568	NC_016831	GCC	2	6	133701	133706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
569	NC_016831	AGT	3	9	133738	133746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
570	NC_016831	ACGA	2	8	133758	133765	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
571	NC_016831	TTG	2	6	133863	133868	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
572	NC_016831	TTTG	2	8	133979	133986	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
573	NC_016831	GGTTT	2	10	134027	134036	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
574	NC_016831	GGATAA	2	12	134086	134097	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
575	NC_016831	TAA	2	6	134133	134138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_016831	TTGC	2	8	134214	134221	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
577	NC_016831	ATT	2	6	134377	134382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_016831	TA	3	6	135440	135445	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_016831	A	6	6	135445	135450	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
580	NC_016831	TCG	2	6	135483	135488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
581	NC_016831	ATT	2	6	135533	135538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_016831	TCT	2	6	135577	135582	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
583	NC_016831	CTT	2	6	135583	135588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
584	NC_016831	CCT	2	6	135590	135595	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
585	NC_016831	ATT	2	6	135597	135602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_016831	AGCG	2	8	135651	135658	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
587	NC_016831	TGA	2	6	135680	135685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
588	NC_016831	TGT	2	6	135716	135721	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
589	NC_016831	GTC	2	6	135736	135741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
590	NC_016831	ATG	2	6	135809	135814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
591	NC_016831	GATC	2	8	135834	135841	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
592	NC_016831	GTG	2	6	135916	135921	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
593	NC_016831	ATTCC	2	10	135983	135992	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
594	NC_016831	ATTG	2	8	136026	136033	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
595	NC_016831	ATG	2	6	136037	136042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
596	NC_016831	GGT	2	6	136080	136085	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
597	NC_016831	CTGG	2	8	136146	136153	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
598	NC_016831	GGT	2	6	136176	136181	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
599	NC_016831	A	6	6	136216	136221	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_016831	A	6	6	136325	136330	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
601	NC_016831	GGT	2	6	136334	136339	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
602	NC_016831	CAT	2	6	136391	136396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
603	NC_016831	GGT	2	6	136415	136420	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
604	NC_016831	GAC	2	6	136557	136562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
605	NC_016831	ACG	2	6	136566	136571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
606	NC_016831	AAT	2	6	136572	136577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_016831	GGT	2	6	136664	136669	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
608	NC_016831	GAT	2	6	136740	136745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
609	NC_016831	TGG	2	6	136755	136760	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
610	NC_016831	CAG	2	6	136761	136766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
611	NC_016831	AG	3	6	136769	136774	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
612	NC_016831	GC	3	6	136778	136783	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
613	NC_016831	GAAAGC	2	12	136809	136820	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
614	NC_016831	ACA	2	6	136895	136900	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
615	NC_016831	CT	3	6	136915	136920	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
616	NC_016831	CGG	2	6	136958	136963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
617	NC_016831	GAAA	2	8	137021	137028	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
618	NC_016831	TGG	2	6	137029	137034	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
619	NC_016831	CTGAAC	2	12	137118	137129	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_016831	ACC	2	6	137263	137268	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
621	NC_016831	TCG	2	6	137332	137337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_016831	CCCAA	2	10	138051	138060	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
623	NC_016831	T	8	8	138076	138083	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
624	NC_016831	CGG	2	6	139220	139225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
625	NC_016831	CT	3	6	139235	139240	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
626	NC_016831	GCC	2	6	139244	139249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
627	NC_016831	CAAA	2	8	139252	139259	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
628	NC_016831	AAT	2	6	139285	139290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_016831	T	6	6	139323	139328	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
630	NC_016831	CTTT	2	8	139334	139341	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
631	NC_016831	TTGTT	2	10	139398	139407	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
632	NC_016831	TCG	2	6	139424	139429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
633	NC_016831	CGG	2	6	139604	139609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
634	NC_016831	T	7	7	139621	139627	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
635	NC_016831	T	6	6	139709	139714	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
636	NC_016831	CTTG	2	8	139734	139741	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
637	NC_016831	TCC	2	6	139751	139756	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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780	NC_016831	T	6	6	187296	187301	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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910	NC_016831	TCC	2	6	225496	225501	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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