MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. RKS5078 chromosome

Total Repeats: 18925

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9001	NC_016831	AAAT	2	8	2118028	2118035	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9002	NC_016831	TA	3	6	2118103	2118108	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9003	NC_016831	A	7	7	2118126	2118132	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9004	NC_016831	TGA	3	9	2118139	2118147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9005	NC_016831	TCA	2	6	2118222	2118227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9006	NC_016831	TAT	2	6	2118263	2118268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9007	NC_016831	AAT	2	6	2118283	2118288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9008	NC_016831	ATA	2	6	2118372	2118377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9009	NC_016831	AGG	2	6	2119836	2119841	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9010	NC_016831	TCC	2	6	2120812	2120817	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9011	NC_016831	AT	3	6	2121581	2121586	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9012	NC_016831	TC	3	6	2122111	2122116	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9013	NC_016831	AT	3	6	2122143	2122148	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9014	NC_016831	T	6	6	2122162	2122167	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9015	NC_016831	C	6	6	2122186	2122191	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
9016	NC_016831	T	6	6	2122463	2122468	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9017	NC_016831	TCGA	2	8	2122527	2122534	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9018	NC_016831	CGG	2	6	2122649	2122654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9019	NC_016831	TGA	2	6	2122719	2122724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9020	NC_016831	CAAT	2	8	2122745	2122752	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9021	NC_016831	T	6	6	2123205	2123210	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9022	NC_016831	CCT	2	6	2123211	2123216	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9023	NC_016831	T	6	6	2123252	2123257	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9024	NC_016831	CG	4	8	2126713	2126720	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9025	NC_016831	CA	3	6	2131159	2131164	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9026	NC_016831	TTG	2	6	2131187	2131192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9027	NC_016831	ATTC	2	8	2131199	2131206	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
9028	NC_016831	ATA	2	6	2131300	2131305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9029	NC_016831	AGC	2	6	2133440	2133445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9030	NC_016831	CAT	2	6	2133450	2133455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9031	NC_016831	TGT	2	6	2133488	2133493	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9032	NC_016831	AG	3	6	2133589	2133594	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9033	NC_016831	TC	3	6	2137970	2137975	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9034	NC_016831	TC	3	6	2137979	2137984	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9035	NC_016831	CGAA	2	8	2138064	2138071	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
9036	NC_016831	GAT	2	6	2138073	2138078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9037	NC_016831	A	6	6	2141083	2141088	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9038	NC_016831	TTA	2	6	2141104	2141109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9039	NC_016831	A	7	7	2141169	2141175	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9040	NC_016831	CTA	2	6	2141255	2141260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9041	NC_016831	CTGC	2	8	2142216	2142223	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9042	NC_016831	A	6	6	2143913	2143918	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9043	NC_016831	TGTA	2	8	2143963	2143970	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
9044	NC_016831	AGG	2	6	2144010	2144015	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9045	NC_016831	CGG	2	6	2144257	2144262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9046	NC_016831	CTT	2	6	2144268	2144273	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9047	NC_016831	A	8	8	2146009	2146016	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9048	NC_016831	TTTTCA	2	12	2146036	2146047	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9049	NC_016831	ACC	2	6	2146574	2146579	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9050	NC_016831	AAGT	2	8	2146593	2146600	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
9051	NC_016831	AT	3	6	2146613	2146618	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9052	NC_016831	AAT	2	6	2146739	2146744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9053	NC_016831	ATT	2	6	2146773	2146778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9054	NC_016831	T	8	8	2146837	2146844	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9055	NC_016831	T	6	6	2146907	2146912	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9056	NC_016831	ATG	2	6	2147827	2147832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9057	NC_016831	ATA	2	6	2147987	2147992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9058	NC_016831	A	6	6	2148036	2148041	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9059	NC_016831	ATCT	2	8	2148620	2148627	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
9060	NC_016831	TA	3	6	2148737	2148742	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9061	NC_016831	CCTG	2	8	2148758	2148765	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9062	NC_016831	ATT	2	6	2148826	2148831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9063	NC_016831	TAA	2	6	2148834	2148839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9064	NC_016831	CA	3	6	2148846	2148851	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9065	NC_016831	TTAA	2	8	2148856	2148863	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9066	NC_016831	AAC	2	6	2148874	2148879	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9067	NC_016831	GGA	2	6	2151474	2151479	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9068	NC_016831	AGC	2	6	2154643	2154648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9069	NC_016831	ACC	2	6	2154686	2154691	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9070	NC_016831	CTCG	2	8	2154705	2154712	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9071	NC_016831	CG	3	6	2154763	2154768	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9072	NC_016831	T	6	6	2154775	2154780	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9073	NC_016831	AATT	2	8	2155232	2155239	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9074	NC_016831	AAT	2	6	2155240	2155245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9075	NC_016831	TGT	2	6	2155681	2155686	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9076	NC_016831	TGTT	2	8	2155755	2155762	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
9077	NC_016831	CGTC	2	8	2155776	2155783	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9078	NC_016831	CGG	2	6	2156814	2156819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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9081	NC_016831	CTG	2	6	2156990	2156995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9082	NC_016831	AATTA	2	10	2156996	2157005	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
9083	NC_016831	CGG	2	6	2157098	2157103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9084	NC_016831	TATGGA	2	12	2157115	2157126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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9088	NC_016831	AGG	2	6	2157264	2157269	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9089	NC_016831	CGCC	2	8	2157311	2157318	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
9090	NC_016831	ATG	2	6	2157344	2157349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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9092	NC_016831	GCC	2	6	2157381	2157386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9093	NC_016831	TGC	2	6	2157399	2157404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9094	NC_016831	TGG	2	6	2157418	2157423	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9095	NC_016831	GAGC	2	8	2157554	2157561	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
9096	NC_016831	AAT	2	6	2157581	2157586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9097	NC_016831	GCT	2	6	2157619	2157624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9098	NC_016831	GC	3	6	2157706	2157711	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9099	NC_016831	AGCC	2	8	2157731	2157738	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
9100	NC_016831	T	6	6	2157829	2157834	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9101	NC_016831	TCA	2	6	2157918	2157923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9102	NC_016831	CCT	2	6	2157955	2157960	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9103	NC_016831	CCT	2	6	2158018	2158023	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9104	NC_016831	CGG	2	6	2158058	2158063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9105	NC_016831	CCA	2	6	2158099	2158104	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9106	NC_016831	AGG	2	6	2158138	2158143	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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9109	NC_016831	CGC	2	6	2158259	2158264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9110	NC_016831	CCA	2	6	2158285	2158290	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9111	NC_016831	CGC	2	6	2158392	2158397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9112	NC_016831	TCG	2	6	2158404	2158409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9113	NC_016831	GTT	2	6	2158502	2158507	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9114	NC_016831	TCA	2	6	2158521	2158526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9115	NC_016831	CTG	2	6	2158544	2158549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9116	NC_016831	GCC	2	6	2158572	2158577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9117	NC_016831	AC	3	6	2158589	2158594	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9118	NC_016831	GGC	2	6	2158613	2158618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9119	NC_016831	GAT	2	6	2158637	2158642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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9121	NC_016831	ACC	2	6	2158707	2158712	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9122	NC_016831	T	6	6	2158717	2158722	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9123	NC_016831	CTT	2	6	2158810	2158815	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9124	NC_016831	ATC	2	6	2158845	2158850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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9126	NC_016831	GGC	2	6	2158910	2158915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9127	NC_016831	CAGCG	2	10	2158928	2158937	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
9128	NC_016831	T	6	6	2159013	2159018	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9129	NC_016831	GGC	2	6	2159032	2159037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9130	NC_016831	ACT	2	6	2160519	2160524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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9132	NC_016831	AATC	2	8	2160714	2160721	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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