MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. RKS5078 chromosome

Total Repeats: 18925

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_016831	CAT	2	6	1876807	1876812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8002	NC_016831	TTC	2	6	1876823	1876828	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8003	NC_016831	CTG	2	6	1877209	1877214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8004	NC_016831	CTT	2	6	1877215	1877220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8005	NC_016831	GTG	2	6	1877221	1877226	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8006	NC_016831	TCC	2	6	1877273	1877278	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8007	NC_016831	CCT	2	6	1877361	1877366	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8008	NC_016831	CTTT	2	8	1877396	1877403	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8009	NC_016831	CAA	2	6	1877405	1877410	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8010	NC_016831	GGTT	2	8	1877436	1877443	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8011	NC_016831	AT	3	6	1877472	1877477	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8012	NC_016831	ATT	3	9	1877515	1877523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8013	NC_016831	ATAAC	2	10	1877560	1877569	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
8014	NC_016831	ATTTT	2	10	1877586	1877595	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8015	NC_016831	T	6	6	1877592	1877597	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8016	NC_016831	T	7	7	1877610	1877616	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8017	NC_016831	AT	5	10	1877671	1877680	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8018	NC_016831	TCA	2	6	1877691	1877696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8019	NC_016831	GCA	2	6	1877761	1877766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8020	NC_016831	CCT	2	6	1877778	1877783	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8021	NC_016831	C	6	6	1877806	1877811	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
8022	NC_016831	TCGCA	2	10	1877866	1877875	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
8023	NC_016831	A	7	7	1877875	1877881	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8024	NC_016831	CAA	2	6	1877900	1877905	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8025	NC_016831	T	6	6	1877923	1877928	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8026	NC_016831	AGGG	2	8	1877965	1877972	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
8027	NC_016831	ATC	2	6	1877982	1877987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8028	NC_016831	TGG	2	6	1878001	1878006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8029	NC_016831	T	6	6	1878040	1878045	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8030	NC_016831	ATT	2	6	1878049	1878054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8031	NC_016831	CGT	2	6	1878069	1878074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8032	NC_016831	ATGT	2	8	1878228	1878235	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8033	NC_016831	AT	3	6	1878261	1878266	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8034	NC_016831	T	6	6	1878288	1878293	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8035	NC_016831	TTC	2	6	1878361	1878366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8036	NC_016831	TAA	2	6	1878500	1878505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8037	NC_016831	TCA	2	6	1878536	1878541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8038	NC_016831	TGC	2	6	1878545	1878550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8039	NC_016831	TCA	2	6	1878614	1878619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8040	NC_016831	CGCCA	2	10	1878629	1878638	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
8041	NC_016831	CCAGCG	2	12	1878657	1878668	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
8042	NC_016831	GT	3	6	1878714	1878719	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8043	NC_016831	GTT	2	6	1878732	1878737	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8044	NC_016831	GCCA	2	8	1878770	1878777	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8045	NC_016831	CTC	2	6	1878787	1878792	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8046	NC_016831	GCC	2	6	1878848	1878853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8047	NC_016831	CCT	2	6	1878864	1878869	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8048	NC_016831	CCT	2	6	1878885	1878890	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8049	NC_016831	GCG	2	6	1878963	1878968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8050	NC_016831	GTC	2	6	1879022	1879027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8051	NC_016831	CGG	2	6	1879137	1879142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8052	NC_016831	TG	3	6	1879191	1879196	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8053	NC_016831	GT	3	6	1879241	1879246	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8054	NC_016831	TCG	2	6	1879251	1879256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8055	NC_016831	CAC	2	6	1879268	1879273	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8056	NC_016831	CCG	2	6	1879420	1879425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8057	NC_016831	TGG	2	6	1879465	1879470	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8058	NC_016831	CTG	2	6	1879520	1879525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8059	NC_016831	GCC	2	6	1879550	1879555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8060	NC_016831	GT	3	6	1879624	1879629	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8061	NC_016831	GTC	2	6	1879635	1879640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8062	NC_016831	GAACC	2	10	1879668	1879677	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
8063	NC_016831	CAG	2	6	1879718	1879723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8064	NC_016831	CGG	2	6	1879784	1879789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8065	NC_016831	TGC	2	6	1879851	1879856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8066	NC_016831	TCAC	2	8	1879881	1879888	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
8067	NC_016831	GGC	2	6	1879909	1879914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8068	NC_016831	TAT	2	6	1879918	1879923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8069	NC_016831	GCT	2	6	1879948	1879953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8070	NC_016831	ACGGT	2	10	1880028	1880037	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
8071	NC_016831	TG	3	6	1880097	1880102	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8072	NC_016831	CGTC	2	8	1880139	1880146	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8073	NC_016831	TGT	2	6	1880157	1880162	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8074	NC_016831	CAG	2	6	1880236	1880241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8075	NC_016831	CAT	2	6	1880242	1880247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8076	NC_016831	CCG	2	6	1880255	1880260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8077	NC_016831	GCCC	2	8	1880266	1880273	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
8078	NC_016831	TG	3	6	1880274	1880279	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8079	NC_016831	CGT	2	6	1880302	1880307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8080	NC_016831	TCCG	2	8	1880327	1880334	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8081	NC_016831	TCC	2	6	1880457	1880462	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8082	NC_016831	CCG	2	6	1880470	1880475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8083	NC_016831	CCA	2	6	1880536	1880541	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8084	NC_016831	CTG	2	6	1880574	1880579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8085	NC_016831	CGT	2	6	1880639	1880644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8086	NC_016831	CCG	2	6	1880665	1880670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8087	NC_016831	TCA	2	6	1880685	1880690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8088	NC_016831	CGT	3	9	1880726	1880734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8089	NC_016831	TGC	2	6	1880739	1880744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8090	NC_016831	CCG	2	6	1880791	1880796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8091	NC_016831	GTC	2	6	1880829	1880834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8092	NC_016831	TCC	2	6	1880836	1880841	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8093	NC_016831	CAT	2	6	1880878	1880883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8094	NC_016831	TCA	2	6	1880920	1880925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8095	NC_016831	GCA	2	6	1880959	1880964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8096	NC_016831	GCT	2	6	1881046	1881051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8097	NC_016831	TCA	2	6	1881069	1881074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8098	NC_016831	GCCT	2	8	1881094	1881101	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8099	NC_016831	GCG	2	6	1881152	1881157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8100	NC_016831	CGG	2	6	1881184	1881189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8101	NC_016831	GCG	2	6	1881345	1881350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8102	NC_016831	GCC	2	6	1881369	1881374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8103	NC_016831	CCGT	2	8	1881426	1881433	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8104	NC_016831	GCG	2	6	1881468	1881473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8105	NC_016831	CGTC	2	8	1881488	1881495	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8106	NC_016831	CGG	2	6	1881530	1881535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8107	NC_016831	GCG	2	6	1881538	1881543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8108	NC_016831	CACC	2	8	1881590	1881597	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
8109	NC_016831	TCG	2	6	1881616	1881621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8110	NC_016831	GCT	2	6	1881661	1881666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8111	NC_016831	GC	3	6	1881706	1881711	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8112	NC_016831	GCCA	2	8	1881720	1881727	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8113	NC_016831	CCAG	2	8	1881857	1881864	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8114	NC_016831	AAC	2	6	1881870	1881875	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8115	NC_016831	GCT	2	6	1881905	1881910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8116	NC_016831	CGGGC	2	10	1881938	1881947	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
8117	NC_016831	CAG	2	6	1881986	1881991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8118	NC_016831	GC	3	6	1882054	1882059	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8119	NC_016831	CCG	2	6	1882072	1882077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8120	NC_016831	GTC	2	6	1882112	1882117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8121	NC_016831	CGC	2	6	1882124	1882129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8122	NC_016831	ATATCT	2	12	1882143	1882154	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8123	NC_016831	T	6	6	1882166	1882171	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8124	NC_016831	TAA	2	6	1882200	1882205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8125	NC_016831	TA	3	6	1882212	1882217	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8126	NC_016831	CAG	2	6	1882284	1882289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8127	NC_016831	ATA	2	6	1882324	1882329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8128	NC_016831	GTT	2	6	1882371	1882376	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8129	NC_016831	TA	3	6	1882377	1882382	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8130	NC_016831	TGA	2	6	1882386	1882391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8131	NC_016831	ATT	2	6	1882429	1882434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8132	NC_016831	TTA	2	6	1882465	1882470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8133	NC_016831	TCATA	2	10	1882521	1882530	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
8134	NC_016831	CAC	2	6	1882549	1882554	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8135	NC_016831	TCA	2	6	1882777	1882782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8140	NC_016831	AT	3	6	1882948	1882953	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8141	NC_016831	ATTTT	2	10	1882979	1882988	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8145	NC_016831	ATC	2	6	1883356	1883361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8147	NC_016831	AGC	2	6	1883389	1883394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8154	NC_016831	CCTC	2	8	1884138	1884145	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
8155	NC_016831	TCCGT	2	10	1884166	1884175	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
8156	NC_016831	CGC	2	6	1884279	1884284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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8158	NC_016831	CCG	2	6	1884302	1884307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8159	NC_016831	TGA	2	6	1884390	1884395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8161	NC_016831	CGCC	2	8	1884442	1884449	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
8162	NC_016831	CCA	2	6	1884469	1884474	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8163	NC_016831	TCC	2	6	1884513	1884518	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8164	NC_016831	TCCG	2	8	1884599	1884606	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8165	NC_016831	GTC	2	6	1884639	1884644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8248	NC_016831	ACAGT	2	10	1889628	1889637	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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8251	NC_016831	TAA	2	6	1889695	1889700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8252	NC_016831	ACT	2	6	1889721	1889726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8254	NC_016831	TACA	2	8	1890344	1890351	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8255	NC_016831	CT	3	6	1890415	1890420	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8256	NC_016831	ATG	2	6	1890468	1890473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8257	NC_016831	ATA	2	6	1890503	1890508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8258	NC_016831	ATTT	2	8	1890516	1890523	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8259	NC_016831	TACT	2	8	1890541	1890548	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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