MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. RKS5078 chromosome

Total Repeats: 18925

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_016831	CAG	2	6	1670742	1670747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7002	NC_016831	CGCA	2	8	1670827	1670834	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7003	NC_016831	AAC	2	6	1670869	1670874	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7004	NC_016831	ACT	2	6	1670984	1670989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7005	NC_016831	GGC	2	6	1671027	1671032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7006	NC_016831	ACGCG	2	10	1671126	1671135	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
7007	NC_016831	GAT	2	6	1671199	1671204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7008	NC_016831	GCTC	2	8	1671221	1671228	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7009	NC_016831	CTGG	2	8	1671231	1671238	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7010	NC_016831	CCG	2	6	1671281	1671286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7011	NC_016831	ATT	2	6	1671325	1671330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7012	NC_016831	TGG	2	6	1671362	1671367	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7013	NC_016831	TGGC	2	8	1671478	1671485	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7014	NC_016831	GC	3	6	1671491	1671496	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7015	NC_016831	CGC	3	9	1671494	1671502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7016	NC_016831	GCT	2	6	1673293	1673298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7017	NC_016831	CCTT	2	8	1673369	1673376	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7018	NC_016831	CA	3	6	1673451	1673456	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7019	NC_016831	T	7	7	1673462	1673468	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7020	NC_016831	AAT	2	6	1673479	1673484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7021	NC_016831	A	6	6	1673551	1673556	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7022	NC_016831	AAT	2	6	1673583	1673588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7023	NC_016831	AGG	2	6	1673591	1673596	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7024	NC_016831	CCG	2	6	1674572	1674577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7025	NC_016831	TGT	2	6	1676292	1676297	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7026	NC_016831	T	7	7	1676323	1676329	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7027	NC_016831	GGA	2	6	1676338	1676343	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7028	NC_016831	ATT	2	6	1676388	1676393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7029	NC_016831	CT	3	6	1676402	1676407	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7030	NC_016831	TCA	2	6	1676417	1676422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7031	NC_016831	CCG	2	6	1676466	1676471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7032	NC_016831	TTAT	2	8	1676516	1676523	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7033	NC_016831	AAC	2	6	1676524	1676529	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7034	NC_016831	TTA	2	6	1676563	1676568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7035	NC_016831	GC	3	6	1676570	1676575	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7036	NC_016831	TA	3	6	1676593	1676598	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7037	NC_016831	ATC	2	6	1676620	1676625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7038	NC_016831	TTC	2	6	1676644	1676649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7039	NC_016831	AAC	2	6	1676726	1676731	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7040	NC_016831	GCTT	2	8	1676735	1676742	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7041	NC_016831	A	6	6	1676771	1676776	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7042	NC_016831	TA	3	6	1676777	1676782	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7043	NC_016831	ATA	2	6	1676852	1676857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7044	NC_016831	ATTTA	2	10	1676892	1676901	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
7045	NC_016831	TGA	2	6	1676911	1676916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7046	NC_016831	ATA	2	6	1676955	1676960	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7047	NC_016831	TGT	2	6	1676970	1676975	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7048	NC_016831	GCC	2	6	1677091	1677096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7049	NC_016831	CTG	2	6	1677127	1677132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7050	NC_016831	CATG	2	8	1677156	1677163	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7051	NC_016831	TGAT	2	8	1680427	1680434	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7052	NC_016831	A	6	6	1680462	1680467	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7053	NC_016831	TAA	2	6	1680474	1680479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7054	NC_016831	CAA	2	6	1680493	1680498	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7055	NC_016831	GTG	2	6	1680608	1680613	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7056	NC_016831	TCAACG	2	12	1680934	1680945	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
7057	NC_016831	CTT	2	6	1680959	1680964	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7058	NC_016831	CA	3	6	1680977	1680982	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7059	NC_016831	CAA	2	6	1681117	1681122	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7060	NC_016831	AT	3	6	1681134	1681139	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7061	NC_016831	CTT	2	6	1681213	1681218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7062	NC_016831	AACA	2	8	1681398	1681405	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
7063	NC_016831	AG	4	8	1681420	1681427	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7064	NC_016831	AT	3	6	1681520	1681525	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7065	NC_016831	GTA	2	6	1681545	1681550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7066	NC_016831	GA	3	6	1681572	1681577	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7067	NC_016831	ATG	2	6	1681653	1681658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7069	NC_016831	GGC	2	6	1681732	1681737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7070	NC_016831	AAC	2	6	1681740	1681745	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7074	NC_016831	CGT	2	6	1681909	1681914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7077	NC_016831	TCAA	2	8	1682237	1682244	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7078	NC_016831	CTAA	2	8	1682264	1682271	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7079	NC_016831	AAAAG	2	10	1682272	1682281	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
7080	NC_016831	GTA	2	6	1682284	1682289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7085	NC_016831	TAA	2	6	1682616	1682621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7089	NC_016831	TAA	2	6	1682729	1682734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7093	NC_016831	TTA	2	6	1683692	1683697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7095	NC_016831	ATT	2	6	1683768	1683773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7097	NC_016831	T	6	6	1683923	1683928	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7098	NC_016831	TCA	2	6	1683987	1683992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7100	NC_016831	GC	3	6	1684035	1684040	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7101	NC_016831	GGC	2	6	1684056	1684061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7102	NC_016831	GCG	2	6	1684062	1684067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7103	NC_016831	TCG	2	6	1684150	1684155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7104	NC_016831	CCG	2	6	1684165	1684170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7105	NC_016831	CGA	2	6	1684177	1684182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7109	NC_016831	AATG	2	8	1684334	1684341	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7110	NC_016831	CTG	2	6	1684356	1684361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7111	NC_016831	GCT	2	6	1684418	1684423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7112	NC_016831	GC	3	6	1684430	1684435	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7113	NC_016831	GTT	2	6	1684626	1684631	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7116	NC_016831	CCGCG	2	10	1684748	1684757	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
7117	NC_016831	GCG	2	6	1684888	1684893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7118	NC_016831	CGG	2	6	1684910	1684915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7119	NC_016831	A	7	7	1684958	1684964	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7120	NC_016831	GAC	2	6	1686025	1686030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7121	NC_016831	A	8	8	1686044	1686051	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7122	NC_016831	T	6	6	1686061	1686066	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7123	NC_016831	GGCCT	2	10	1688134	1688143	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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7128	NC_016831	ATT	2	6	1689531	1689536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7129	NC_016831	TTAT	2	8	1695343	1695350	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7130	NC_016831	C	6	6	1695368	1695373	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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7132	NC_016831	TCC	2	6	1696504	1696509	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7133	NC_016831	CAT	2	6	1696717	1696722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7155	NC_016831	AAATG	2	10	1698156	1698165	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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7397	NC_016831	AAT	2	6	1722424	1722429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7398	NC_016831	TGG	2	6	1722435	1722440	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7399	NC_016831	TGC	2	6	1722500	1722505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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