MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. RKS5078 chromosome

Total Repeats: 18925

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_016831	TGA	2	6	1560231	1560236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6502	NC_016831	CTTC	2	8	1561144	1561151	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6503	NC_016831	GTA	2	6	1561219	1561224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6504	NC_016831	GGC	2	6	1562738	1562743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6505	NC_016831	CAT	2	6	1562772	1562777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6506	NC_016831	ATT	2	6	1562814	1562819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6507	NC_016831	TGG	2	6	1562898	1562903	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6508	NC_016831	GCGG	2	8	1562918	1562925	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6509	NC_016831	T	8	8	1562980	1562987	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6510	NC_016831	AAT	2	6	1562994	1562999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6511	NC_016831	GCC	2	6	1563052	1563057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6512	NC_016831	GCG	2	6	1563095	1563100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6513	NC_016831	GCT	3	9	1563114	1563122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6514	NC_016831	GAT	2	6	1563148	1563153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6515	NC_016831	CTG	3	9	1563163	1563171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6516	NC_016831	GC	3	6	1563179	1563184	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6517	NC_016831	CCTG	2	8	1563297	1563304	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6518	NC_016831	CCCG	2	8	1563324	1563331	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6519	NC_016831	ATT	2	6	1563339	1563344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6520	NC_016831	CT	3	6	1563366	1563371	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6521	NC_016831	GTG	2	6	1563406	1563411	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6522	NC_016831	CGG	2	6	1563447	1563452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6523	NC_016831	ACT	2	6	1563524	1563529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6524	NC_016831	TTTA	2	8	1563533	1563540	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6525	NC_016831	ATC	2	6	1563563	1563568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6526	NC_016831	A	7	7	1563571	1563577	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6527	NC_016831	CGCC	2	8	1563636	1563643	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6528	NC_016831	GCC	2	6	1563678	1563683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6529	NC_016831	GGT	2	6	1563750	1563755	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6530	NC_016831	CG	3	6	1563778	1563783	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6531	NC_016831	GTG	2	6	1563800	1563805	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6532	NC_016831	CGC	2	6	1563812	1563817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6533	NC_016831	CTGCC	2	10	1563824	1563833	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
6534	NC_016831	CTA	2	6	1563850	1563855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6535	NC_016831	CGC	2	6	1563955	1563960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6536	NC_016831	GTC	2	6	1563963	1563968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6537	NC_016831	CGC	2	6	1564010	1564015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6538	NC_016831	GC	3	6	1564115	1564120	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6539	NC_016831	GC	3	6	1564130	1564135	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6540	NC_016831	GCG	2	6	1564290	1564295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6541	NC_016831	GGC	2	6	1564358	1564363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6542	NC_016831	CGGT	2	8	1564365	1564372	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6543	NC_016831	TCCGC	2	10	1564413	1564422	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
6544	NC_016831	TGG	2	6	1564425	1564430	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6545	NC_016831	GGCG	2	8	1564453	1564460	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6546	NC_016831	TAA	2	6	1564510	1564515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6547	NC_016831	GC	4	8	1564517	1564524	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6548	NC_016831	CAT	2	6	1564550	1564555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6549	NC_016831	A	6	6	1567533	1567538	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6550	NC_016831	GGC	2	6	1569565	1569570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6551	NC_016831	TGGC	2	8	1569579	1569586	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6552	NC_016831	CAT	2	6	1569615	1569620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6553	NC_016831	CAA	2	6	1569754	1569759	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6554	NC_016831	TTA	2	6	1569802	1569807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6555	NC_016831	AT	3	6	1569862	1569867	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6556	NC_016831	T	6	6	1569881	1569886	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6557	NC_016831	T	6	6	1569985	1569990	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6558	NC_016831	AGCA	2	8	1569992	1569999	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6559	NC_016831	TGTAA	2	10	1570207	1570216	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
6560	NC_016831	ACA	2	6	1570219	1570224	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6561	NC_016831	TCT	2	6	1570251	1570256	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6562	NC_016831	TAT	2	6	1570829	1570834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6563	NC_016831	ATA	2	6	1571375	1571380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6564	NC_016831	AGG	2	6	1571384	1571389	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6565	NC_016831	GT	3	6	1572292	1572297	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6566	NC_016831	T	6	6	1572305	1572310	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6567	NC_016831	T	6	6	1572330	1572335	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6568	NC_016831	TGA	2	6	1573023	1573028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6569	NC_016831	TAA	2	6	1573046	1573051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6570	NC_016831	GGCT	2	8	1573212	1573219	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6571	NC_016831	T	6	6	1573313	1573318	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6572	NC_016831	TGA	2	6	1574542	1574547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6573	NC_016831	ATC	2	6	1575114	1575119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6574	NC_016831	TTC	2	6	1575147	1575152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6575	NC_016831	CA	3	6	1575203	1575208	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6576	NC_016831	TAG	2	6	1575216	1575221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6577	NC_016831	T	6	6	1575236	1575241	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6578	NC_016831	ACA	2	6	1575263	1575268	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6579	NC_016831	CGC	2	6	1575675	1575680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6580	NC_016831	CAG	2	6	1575681	1575686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6581	NC_016831	GGC	2	6	1575706	1575711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6582	NC_016831	GAT	2	6	1576546	1576551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6583	NC_016831	CA	3	6	1576567	1576572	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6584	NC_016831	GC	3	6	1576747	1576752	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6585	NC_016831	ATG	2	6	1576766	1576771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6586	NC_016831	ATT	2	6	1576779	1576784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6587	NC_016831	AGC	2	6	1576878	1576883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6588	NC_016831	AAG	2	6	1576954	1576959	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6589	NC_016831	CTA	2	6	1577172	1577177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6590	NC_016831	AAC	2	6	1577296	1577301	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6591	NC_016831	AAG	2	6	1580051	1580056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6592	NC_016831	A	6	6	1584023	1584028	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6593	NC_016831	TGG	2	6	1585776	1585781	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6594	NC_016831	TTTA	2	8	1585821	1585828	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6595	NC_016831	TTCG	2	8	1585838	1585845	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6596	NC_016831	TCG	2	6	1585854	1585859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6597	NC_016831	ACG	2	6	1585869	1585874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6598	NC_016831	CAA	2	6	1585929	1585934	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6599	NC_016831	TCT	2	6	1585942	1585947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6600	NC_016831	A	7	7	1586048	1586054	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6601	NC_016831	TATT	2	8	1586080	1586087	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6602	NC_016831	GAAA	2	8	1586106	1586113	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6603	NC_016831	TC	3	6	1586118	1586123	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6604	NC_016831	AC	4	8	1586156	1586163	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6605	NC_016831	ATT	2	6	1586181	1586186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6606	NC_016831	TAA	2	6	1586220	1586225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6607	NC_016831	AAT	2	6	1586232	1586237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6608	NC_016831	TCA	2	6	1586241	1586246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6609	NC_016831	AATAA	2	10	1586266	1586275	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
6610	NC_016831	ATA	2	6	1586311	1586316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6611	NC_016831	TAA	2	6	1586324	1586329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6612	NC_016831	AAAT	2	8	1586330	1586337	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6613	NC_016831	AAG	2	6	1586393	1586398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6614	NC_016831	GGC	2	6	1586420	1586425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6615	NC_016831	GCC	2	6	1586436	1586441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6616	NC_016831	CAG	2	6	1586449	1586454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6617	NC_016831	AGA	2	6	1587169	1587174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6618	NC_016831	TTAT	2	8	1587236	1587243	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6619	NC_016831	CTG	2	6	1587320	1587325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6620	NC_016831	CA	3	6	1587360	1587365	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6621	NC_016831	ACC	2	6	1587482	1587487	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6622	NC_016831	TCG	2	6	1587514	1587519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6623	NC_016831	GAT	2	6	1587546	1587551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6624	NC_016831	A	6	6	1587557	1587562	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6625	NC_016831	T	7	7	1590312	1590318	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6626	NC_016831	ATC	2	6	1590358	1590363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6627	NC_016831	AGG	2	6	1590395	1590400	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6628	NC_016831	AAT	2	6	1590405	1590410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6629	NC_016831	CGACG	2	10	1591138	1591147	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
6630	NC_016831	AAT	2	6	1591207	1591212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6632	NC_016831	GAGT	2	8	1591237	1591244	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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