MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. RKS5078 chromosome

Total Repeats: 18925

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_016831	T	6	6	1428176	1428181	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6002	NC_016831	AAT	2	6	1429253	1429258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6003	NC_016831	CTTT	2	8	1429327	1429334	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6004	NC_016831	GCC	2	6	1429380	1429385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6005	NC_016831	TAT	2	6	1430676	1430681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6006	NC_016831	CGC	2	6	1430711	1430716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6007	NC_016831	CCT	2	6	1430720	1430725	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6008	NC_016831	CCG	2	6	1430795	1430800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6009	NC_016831	TTGC	2	8	1430802	1430809	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6010	NC_016831	GAA	2	6	1430836	1430841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6011	NC_016831	AAC	2	6	1430853	1430858	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6012	NC_016831	A	6	6	1437570	1437575	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6013	NC_016831	CG	3	6	1437576	1437581	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6014	NC_016831	TAT	2	6	1437680	1437685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6015	NC_016831	ATG	2	6	1437724	1437729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6016	NC_016831	AATG	2	8	1437742	1437749	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6017	NC_016831	CGT	2	6	1437763	1437768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6018	NC_016831	TGC	3	9	1437784	1437792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6019	NC_016831	TGC	2	6	1437860	1437865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6020	NC_016831	CCG	2	6	1437892	1437897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6021	NC_016831	T	6	6	1437909	1437914	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6022	NC_016831	GCC	2	6	1439383	1439388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6023	NC_016831	GC	3	6	1439408	1439413	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6024	NC_016831	GCT	2	6	1440919	1440924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6025	NC_016831	CAA	2	6	1441021	1441026	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6026	NC_016831	CAT	2	6	1441897	1441902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6027	NC_016831	CCT	2	6	1441967	1441972	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6028	NC_016831	AAT	2	6	1441986	1441991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6029	NC_016831	GGC	2	6	1442006	1442011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6030	NC_016831	GAGT	2	8	1442016	1442023	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6031	NC_016831	AGT	2	6	1442095	1442100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6032	NC_016831	GTT	2	6	1442104	1442109	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6033	NC_016831	TA	3	6	1442158	1442163	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6034	NC_016831	CTG	2	6	1442279	1442284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6035	NC_016831	ATT	2	6	1442294	1442299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6036	NC_016831	GCG	2	6	1442320	1442325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6037	NC_016831	CCT	2	6	1442733	1442738	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6038	NC_016831	ACA	2	6	1442795	1442800	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6039	NC_016831	TTG	2	6	1442890	1442895	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6040	NC_016831	TAA	2	6	1442902	1442907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6041	NC_016831	CTT	2	6	1442922	1442927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6042	NC_016831	ATA	2	6	1442975	1442980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6043	NC_016831	TAAT	2	8	1442988	1442995	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6044	NC_016831	ATG	3	9	1443011	1443019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6045	NC_016831	AGG	2	6	1443077	1443082	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6046	NC_016831	TC	3	6	1443321	1443326	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6047	NC_016831	CTT	2	6	1443334	1443339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6048	NC_016831	T	7	7	1443367	1443373	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6049	NC_016831	AT	3	6	1443402	1443407	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6050	NC_016831	ATTT	2	8	1443458	1443465	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6051	NC_016831	ATC	2	6	1443483	1443488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6052	NC_016831	TTA	2	6	1443557	1443562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6053	NC_016831	ACT	2	6	1443608	1443613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6054	NC_016831	TAC	2	6	1443746	1443751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6055	NC_016831	CGG	2	6	1443762	1443767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6056	NC_016831	A	6	6	1443789	1443794	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6057	NC_016831	GGAA	2	8	1443845	1443852	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6058	NC_016831	GAAA	2	8	1443856	1443863	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6059	NC_016831	GCC	2	6	1443865	1443870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6060	NC_016831	TCC	2	6	1443874	1443879	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6061	NC_016831	ACC	2	6	1443912	1443917	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6062	NC_016831	GAC	2	6	1443922	1443927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6063	NC_016831	TGTT	2	8	1444036	1444043	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6064	NC_016831	GAA	2	6	1444072	1444077	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6065	NC_016831	T	6	6	1444148	1444153	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6066	NC_016831	ACA	2	6	1444180	1444185	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6067	NC_016831	A	6	6	1444185	1444190	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6068	NC_016831	TCA	2	6	1444197	1444202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6069	NC_016831	AT	3	6	1444282	1444287	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6070	NC_016831	AAT	2	6	1444298	1444303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6071	NC_016831	AGTATA	2	12	1444354	1444365	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6072	NC_016831	AAT	2	6	1444425	1444430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6073	NC_016831	ATT	2	6	1444442	1444447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6074	NC_016831	CAT	2	6	1444450	1444455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6075	NC_016831	ACG	2	6	1444462	1444467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6076	NC_016831	TCTT	2	8	1446686	1446693	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6077	NC_016831	AGC	2	6	1446701	1446706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6078	NC_016831	GGC	2	6	1446712	1446717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6079	NC_016831	C	8	8	1447300	1447307	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6080	NC_016831	GCG	2	6	1447458	1447463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6081	NC_016831	TGC	2	6	1447519	1447524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6082	NC_016831	C	7	7	1447613	1447619	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6083	NC_016831	TC	3	6	1447734	1447739	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6084	NC_016831	GCT	3	9	1447768	1447776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6085	NC_016831	GCC	2	6	1447808	1447813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6086	NC_016831	GCC	2	6	1447820	1447825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6087	NC_016831	GCC	3	9	1447877	1447885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6088	NC_016831	T	6	6	1447893	1447898	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6089	NC_016831	GGT	2	6	1447911	1447916	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6090	NC_016831	GCTG	2	8	1447972	1447979	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6091	NC_016831	ATCGG	2	10	1448099	1448108	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
6092	NC_016831	CGC	2	6	1448162	1448167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6093	NC_016831	ATG	2	6	1448932	1448937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6094	NC_016831	ATA	2	6	1448946	1448951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6095	NC_016831	A	7	7	1449020	1449026	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6096	NC_016831	GTT	2	6	1450709	1450714	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6097	NC_016831	CTT	2	6	1452292	1452297	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6098	NC_016831	GTT	2	6	1452299	1452304	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6099	NC_016831	ATT	2	6	1452381	1452386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6100	NC_016831	T	6	6	1452385	1452390	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6101	NC_016831	CAC	2	6	1452483	1452488	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6102	NC_016831	AG	3	6	1456071	1456076	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6103	NC_016831	AGC	2	6	1458542	1458547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6104	NC_016831	AAT	2	6	1458558	1458563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6105	NC_016831	GAT	2	6	1459937	1459942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6106	NC_016831	ACA	2	6	1459943	1459948	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6107	NC_016831	CTT	2	6	1459992	1459997	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6108	NC_016831	AT	3	6	1460062	1460067	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6109	NC_016831	AATT	2	8	1460079	1460086	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6110	NC_016831	ATTA	2	8	1460090	1460097	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6111	NC_016831	TTG	2	6	1460129	1460134	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6112	NC_016831	A	6	6	1460183	1460188	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6113	NC_016831	GTC	2	6	1460194	1460199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6114	NC_016831	CTAC	2	8	1461008	1461015	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6115	NC_016831	ATGC	2	8	1461050	1461057	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6116	NC_016831	CCGG	2	8	1463514	1463521	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6117	NC_016831	TA	3	6	1463548	1463553	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6118	NC_016831	AGT	2	6	1464329	1464334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6119	NC_016831	AAT	2	6	1464465	1464470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6120	NC_016831	TCA	3	9	1464473	1464481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6121	NC_016831	AGGA	2	8	1465129	1465136	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6122	NC_016831	T	6	6	1466960	1466965	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6123	NC_016831	CAG	2	6	1466966	1466971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6124	NC_016831	TAA	2	6	1467017	1467022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6125	NC_016831	TTG	2	6	1467028	1467033	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6126	NC_016831	ACCG	2	8	1467081	1467088	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6127	NC_016831	GCA	2	6	1467108	1467113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6128	NC_016831	TTC	2	6	1467114	1467119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6129	NC_016831	CCTT	2	8	1468647	1468654	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6130	NC_016831	GAA	2	6	1470094	1470099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6131	NC_016831	GT	3	6	1470108	1470113	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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6261	NC_016831	ATCA	2	8	1502034	1502041	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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6263	NC_016831	GATT	2	8	1502075	1502082	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6264	NC_016831	CGC	2	6	1502090	1502095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6265	NC_016831	GAT	2	6	1502097	1502102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6267	NC_016831	CAATA	2	10	1502255	1502264	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
6268	NC_016831	GAT	2	6	1502268	1502273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6274	NC_016831	A	8	8	1505364	1505371	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6280	NC_016831	A	6	6	1506668	1506673	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6281	NC_016831	GAATA	2	10	1507823	1507832	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
6282	NC_016831	TCC	2	6	1508845	1508850	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6283	NC_016831	CT	3	6	1508960	1508965	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6284	NC_016831	GA	3	6	1509086	1509091	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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