MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptococcus infantarius subsp. infantarius CJ18 chromosome

Total Repeats: 8993

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_016826	ATTAT	2	10	253855	253864	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_016826	TTTA	2	8	253888	253895	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_016826	T	6	6	253936	253941	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_016826	TA	3	6	253967	253972	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_016826	AAAT	2	8	253986	253993	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_016826	ATT	2	6	254024	254029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_016826	TAA	2	6	254042	254047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_016826	AT	3	6	254061	254066	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_016826	A	6	6	254122	254127	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_016826	TA	3	6	254155	254160	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_016826	ATT	2	6	254200	254205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_016826	TGG	2	6	254209	254214	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_016826	AT	3	6	254262	254267	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_016826	ATG	2	6	254272	254277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_016826	AAT	2	6	254307	254312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_016826	ACTT	2	8	254336	254343	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1517	NC_016826	T	6	6	254359	254364	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_016826	CAT	2	6	254388	254393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1519	NC_016826	AT	3	6	254398	254403	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_016826	A	6	6	254902	254907	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_016826	TAC	2	6	255259	255264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1522	NC_016826	TA	4	8	255276	255283	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_016826	T	7	7	255442	255448	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_016826	TAGT	2	8	255477	255484	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_016826	TAT	2	6	255802	255807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_016826	A	7	7	255956	255962	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_016826	AGA	2	6	256015	256020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_016826	TTC	2	6	256036	256041	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1529	NC_016826	T	6	6	256047	256052	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_016826	AGA	2	6	256080	256085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_016826	A	6	6	256215	256220	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_016826	A	6	6	256223	256228	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_016826	GTT	2	6	256229	256234	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_016826	TGT	2	6	256270	256275	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_016826	AGC	2	6	256280	256285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1536	NC_016826	A	6	6	256306	256311	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_016826	A	6	6	256316	256321	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_016826	CTT	2	6	256322	256327	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1539	NC_016826	TGT	2	6	256363	256368	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_016826	GA	3	6	256471	256476	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_016826	CAAAC	2	10	256503	256512	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
1542	NC_016826	GGC	2	6	256614	256619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1543	NC_016826	CTA	2	6	256711	256716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1544	NC_016826	TAG	2	6	256804	256809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_016826	CGA	2	6	256859	256864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1546	NC_016826	GCA	2	6	256933	256938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1547	NC_016826	CGC	2	6	256980	256985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1548	NC_016826	GTGA	2	8	256986	256993	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_016826	TGT	2	6	257019	257024	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_016826	AGA	2	6	257028	257033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_016826	GT	3	6	257036	257041	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_016826	CA	3	6	257056	257061	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1553	NC_016826	CAG	2	6	257102	257107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1554	NC_016826	AGCG	2	8	257157	257164	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1555	NC_016826	TAA	2	6	257174	257179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_016826	AT	3	6	257286	257291	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_016826	GGA	2	6	257292	257297	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_016826	CT	3	6	257317	257322	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1559	NC_016826	GAA	2	6	257556	257561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_016826	TTC	2	6	257609	257614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1561	NC_016826	GGT	2	6	257630	257635	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_016826	GTC	2	6	257644	257649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1563	NC_016826	TCGTG	2	10	257653	257662	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1564	NC_016826	CAT	2	6	257712	257717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1565	NC_016826	TAA	2	6	257747	257752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_016826	GGA	2	6	257756	257761	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_016826	ATC	2	6	257780	257785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1568	NC_016826	AC	3	6	257807	257812	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1569	NC_016826	TGGT	2	8	257822	257829	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_016826	GCAA	2	8	257854	257861	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1571	NC_016826	CGC	2	6	257946	257951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1572	NC_016826	AC	3	6	257976	257981	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1573	NC_016826	CAC	2	6	257991	257996	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1574	NC_016826	AGCC	2	8	258039	258046	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1575	NC_016826	GAT	2	6	258062	258067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_016826	CCT	2	6	258118	258123	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1577	NC_016826	AGG	2	6	258219	258224	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1578	NC_016826	GTAA	2	8	258313	258320	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1579	NC_016826	ATAG	2	8	258327	258334	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_016826	GTTAA	2	10	258400	258409	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_016826	ACG	2	6	258463	258468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1582	NC_016826	TAG	2	6	258634	258639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_016826	GCGA	2	8	258642	258649	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1584	NC_016826	GAC	2	6	258708	258713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1585	NC_016826	AGA	2	6	258722	258727	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1586	NC_016826	AG	3	6	258750	258755	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1587	NC_016826	TCG	2	6	258825	258830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1588	NC_016826	GGA	2	6	258838	258843	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1589	NC_016826	CT	3	6	258864	258869	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1590	NC_016826	GGGAG	2	10	258919	258928	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
1591	NC_016826	ACA	2	6	258956	258961	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1592	NC_016826	ATG	2	6	259023	259028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1593	NC_016826	TC	3	6	259242	259247	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1594	NC_016826	TTGA	2	8	259303	259310	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_016826	ACC	2	6	259421	259426	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1596	NC_016826	AT	3	6	259442	259447	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_016826	AGC	2	6	259501	259506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1598	NC_016826	ATTC	2	8	259508	259515	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1599	NC_016826	TG	3	6	259630	259635	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_016826	AAG	2	6	259636	259641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_016826	GAG	2	6	259651	259656	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_016826	TCC	2	6	259754	259759	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1603	NC_016826	GA	3	6	259781	259786	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_016826	ACA	2	6	259807	259812	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1605	NC_016826	TA	3	6	259835	259840	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_016826	CTAA	2	8	259862	259869	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1607	NC_016826	GA	3	6	260076	260081	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_016826	CT	3	6	260192	260197	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1609	NC_016826	GAT	2	6	260210	260215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_016826	CGG	2	6	260301	260306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1611	NC_016826	GA	3	6	260399	260404	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_016826	TAGG	2	8	260517	260524	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_016826	GTT	2	6	260561	260566	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_016826	TAC	2	6	260571	260576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1615	NC_016826	CCT	2	6	260659	260664	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1616	NC_016826	GGT	2	6	260795	260800	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_016826	TCG	2	6	260910	260915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1618	NC_016826	CGT	2	6	260990	260995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1619	NC_016826	AGGGA	2	10	261128	261137	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_016826	GA	3	6	261214	261219	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_016826	AAGTGT	2	12	261240	261251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_016826	ACTAAT	2	12	261269	261280	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1623	NC_016826	A	6	6	261298	261303	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_016826	AT	3	6	261345	261350	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_016826	AATC	2	8	261373	261380	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1626	NC_016826	TGT	2	6	261623	261628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_016826	TAA	2	6	261659	261664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_016826	GGT	2	6	261736	261741	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_016826	TTA	2	6	261762	261767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_016826	CGG	2	6	261809	261814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1631	NC_016826	TAT	2	6	261842	261847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_016826	AT	3	6	261846	261851	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_016826	GGA	2	6	261852	261857	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1634	NC_016826	GCGT	2	8	261911	261918	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1635	NC_016826	TCC	2	6	261935	261940	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1637	NC_016826	AGC	2	6	261965	261970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1914	NC_016826	TC	3	6	323194	323199	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1915	NC_016826	TTGA	2	8	323255	323262	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1916	NC_016826	ACC	2	6	323373	323378	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1917	NC_016826	AT	3	6	323394	323399	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1925	NC_016826	ACA	2	6	323759	323764	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1929	NC_016826	CT	3	6	324144	324149	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1932	NC_016826	GA	3	6	324351	324356	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1933	NC_016826	TAGG	2	8	324469	324476	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1941	NC_016826	GA	3	6	325166	325171	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1942	NC_016826	AAGTGT	2	12	325192	325203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1945	NC_016826	AT	3	6	325297	325302	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1946	NC_016826	AATC	2	8	325325	325332	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1947	NC_016826	TA	3	6	325540	325545	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1948	NC_016826	ACC	2	6	325918	325923	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1950	NC_016826	ATG	2	6	326077	326082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1951	NC_016826	CAAAC	2	10	326281	326290	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
1952	NC_016826	GGC	2	6	326392	326397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1954	NC_016826	TAG	2	6	326581	326586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1959	NC_016826	TGT	2	6	326796	326801	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1976	NC_016826	GGA	2	6	327533	327538	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1977	NC_016826	ATC	2	6	327557	327562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1990	NC_016826	GTTAA	2	10	328177	328186	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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2000	NC_016826	GGGAG	2	10	328696	328705	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding

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