MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptococcus infantarius subsp. infantarius CJ18 chromosome

Total Repeats: 8993

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_016826	ATC	3	9	165622	165630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1002	NC_016826	CCTT	2	8	165639	165646	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1003	NC_016826	TAA	2	6	165677	165682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_016826	TTAATT	2	12	165729	165740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_016826	GGA	2	6	165741	165746	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_016826	AGG	2	6	165762	165767	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_016826	T	6	6	165821	165826	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_016826	TTTGA	2	10	165833	165842	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_016826	ATT	2	6	165851	165856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_016826	CAG	2	6	165900	165905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1011	NC_016826	CTT	2	6	165945	165950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1012	NC_016826	GCAA	2	8	165967	165974	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1013	NC_016826	TGA	2	6	165984	165989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_016826	GTC	2	6	166003	166008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1015	NC_016826	GA	3	6	166047	166052	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_016826	ATT	2	6	166087	166092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_016826	ATA	2	6	166195	166200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_016826	AGTAG	2	10	166585	166594	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_016826	CTG	2	6	167378	167383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1020	NC_016826	GAAA	2	8	167400	167407	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_016826	A	7	7	168390	168396	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_016826	T	6	6	168831	168836	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_016826	TTG	2	6	169197	169202	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_016826	CATT	2	8	169243	169250	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1025	NC_016826	CTT	2	6	169292	169297	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1026	NC_016826	TCCA	2	8	169303	169310	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1027	NC_016826	TGT	2	6	169340	169345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_016826	CAT	2	6	169358	169363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1029	NC_016826	CAA	2	6	169370	169375	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1030	NC_016826	TTG	2	6	169446	169451	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_016826	TG	3	6	169605	169610	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_016826	CAG	2	6	169616	169621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1033	NC_016826	TAT	2	6	169658	169663	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_016826	CCA	2	6	169705	169710	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1035	NC_016826	TTG	2	6	169722	169727	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_016826	CAG	2	6	169784	169789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1037	NC_016826	GTA	2	6	169800	169805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_016826	GTAG	2	8	169884	169891	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_016826	TAG	2	6	169942	169947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_016826	CAA	2	6	169961	169966	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1041	NC_016826	CTG	2	6	170004	170009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1042	NC_016826	AAT	2	6	170097	170102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_016826	GCT	2	6	170125	170130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1044	NC_016826	T	7	7	170177	170183	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_016826	T	6	6	170236	170241	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_016826	TAAA	2	8	170248	170255	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_016826	A	7	7	170276	170282	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_016826	A	6	6	170301	170306	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_016826	TA	3	6	170331	170336	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_016826	AGG	3	9	170377	170385	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_016826	TTA	2	6	170394	170399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_016826	TAT	2	6	170411	170416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_016826	TTA	2	6	170434	170439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_016826	T	6	6	170490	170495	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_016826	ATA	3	9	170583	170591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_016826	TA	3	6	170602	170607	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_016826	GAA	2	6	171368	171373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_016826	TGG	2	6	171398	171403	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_016826	GAA	2	6	171480	171485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_016826	CTT	2	6	172220	172225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1061	NC_016826	TGA	2	6	172251	172256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_016826	T	6	6	172270	172275	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_016826	ATA	2	6	172339	172344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_016826	AGA	2	6	172367	172372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_016826	T	7	7	174629	174635	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_016826	T	7	7	174660	174666	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_016826	AAT	2	6	174692	174697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_016826	ATTT	2	8	174706	174713	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_016826	A	6	6	176070	176075	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_016826	TAA	2	6	176119	176124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_016826	ACG	2	6	177344	177349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1072	NC_016826	T	6	6	177356	177361	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_016826	TCA	2	6	177368	177373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1074	NC_016826	TTAC	2	8	177384	177391	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1075	NC_016826	CTTT	2	8	178203	178210	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1076	NC_016826	T	7	7	178213	178219	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_016826	TATCA	2	10	178228	178237	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1078	NC_016826	CAAA	2	8	178238	178245	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1079	NC_016826	AACT	2	8	178247	178254	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1080	NC_016826	CAA	2	6	178255	178260	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1081	NC_016826	A	8	8	178266	178273	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_016826	GTC	2	6	178292	178297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1086	NC_016826	A	6	6	178380	178385	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1088	NC_016826	TAT	2	6	178424	178429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_016826	A	7	7	178438	178444	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_016826	A	6	6	178452	178457	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1093	NC_016826	TGA	2	6	181438	181443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1095	NC_016826	A	8	8	182407	182414	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_016826	A	7	7	182417	182423	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_016826	AAAG	2	8	182427	182434	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_016826	AAAATT	2	12	182442	182453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1101	NC_016826	TTTG	2	8	182546	182553	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_016826	T	6	6	182557	182562	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_016826	GAG	2	6	182578	182583	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_016826	ATTT	2	8	184434	184441	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_016826	T	6	6	184470	184475	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_016826	CAAAG	2	10	184511	184520	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
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1108	NC_016826	AATTT	2	10	185029	185038	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_016826	AGG	2	6	185061	185066	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_016826	ATT	2	6	185068	185073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_016826	TTGA	2	8	187107	187114	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_016826	CTC	2	6	187143	187148	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1113	NC_016826	TTTTA	2	10	187164	187173	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_016826	TTG	3	9	188495	188503	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_016826	TC	3	6	188521	188526	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1116	NC_016826	T	6	6	188534	188539	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_016826	CAC	2	6	188622	188627	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1118	NC_016826	CCAC	2	8	189753	189760	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
1119	NC_016826	A	6	6	189843	189848	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_016826	TA	4	8	189897	189904	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_016826	ATT	2	6	189972	189977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_016826	CGA	2	6	189983	189988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1123	NC_016826	CTT	2	6	189998	190003	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1124	NC_016826	TAG	2	6	190006	190011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_016826	GATT	2	8	190099	190106	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_016826	AGT	2	6	190161	190166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_016826	TGA	2	6	190178	190183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_016826	ATG	2	6	190218	190223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_016826	CCT	2	6	190263	190268	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1130	NC_016826	CAC	2	6	190307	190312	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1131	NC_016826	AGC	2	6	190329	190334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1132	NC_016826	TG	3	6	190363	190368	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_016826	AAG	2	6	190397	190402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_016826	CTT	2	6	190471	190476	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1135	NC_016826	GCA	2	6	190492	190497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1137	NC_016826	GTG	2	6	190942	190947	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1275	NC_016826	TAAAA	2	10	222203	222212	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1277	NC_016826	T	7	7	222242	222248	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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