MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptococcus infantarius subsp. infantarius CJ18 chromosome

Total Repeats: 8993

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016826	T	7	7	73	79	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016826	T	6	6	123	128	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016826	AAT	2	6	168	173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016826	A	7	7	1581	1587	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016826	GTT	2	6	1606	1611	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016826	AAC	2	6	1612	1617	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_016826	CTA	5	15	1673	1687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_016826	ATC	2	6	2899	2904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_016826	CTTTT	2	10	2911	2920	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_016826	ATG	2	6	3127	3132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016826	AGAT	2	8	3158	3165	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016826	T	6	6	4110	4115	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016826	TAA	2	6	4165	4170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016826	CTAA	2	8	5291	5298	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_016826	T	6	6	5328	5333	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016826	A	6	6	5358	5363	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016826	ATTT	2	8	5953	5960	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016826	AGG	2	6	9525	9530	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016826	TCTA	2	8	10095	10102	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_016826	TAG	2	6	10107	10112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016826	AG	3	6	10118	10123	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016826	CT	3	6	10130	10135	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_016826	TTA	2	6	10138	10143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016826	AACA	2	8	10153	10160	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_016826	A	7	7	10183	10189	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016826	AGG	2	6	10981	10986	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016826	GTTA	2	8	14111	14118	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016826	ATA	2	6	16101	16106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016826	A	6	6	16121	16126	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016826	AAG	2	6	16132	16137	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016826	CTTT	2	8	16148	16155	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_016826	T	9	9	16153	16161	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016826	AGT	2	6	16177	16182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016826	ATA	2	6	16189	16194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016826	TTA	2	6	16210	16215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016826	GCT	2	6	16216	16221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_016826	A	7	7	16248	16254	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016826	A	7	7	16258	16264	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016826	TGT	2	6	16305	16310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016826	AGC	2	6	16315	16320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_016826	A	7	7	16340	16346	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016826	A	6	6	16351	16356	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016826	CTT	2	6	16357	16362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_016826	TGT	2	6	16398	16403	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016826	A	6	6	16452	16457	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016826	GA	3	6	16507	16512	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016826	CAAAC	2	10	16539	16548	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
48	NC_016826	GGC	2	6	16650	16655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_016826	CTA	2	6	16747	16752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_016826	TAG	2	6	16840	16845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016826	CGA	2	6	16895	16900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_016826	GCA	2	6	16969	16974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_016826	CGC	2	6	17016	17021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_016826	GTGA	2	8	17022	17029	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016826	TGT	2	6	17055	17060	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016826	AGA	2	6	17064	17069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016826	GT	3	6	17072	17077	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016826	CA	3	6	17092	17097	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_016826	CAG	2	6	17138	17143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_016826	AGCG	2	8	17193	17200	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
61	NC_016826	TAA	2	6	17210	17215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016826	AT	3	6	17322	17327	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_016826	GGA	2	6	17328	17333	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016826	CT	3	6	17353	17358	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_016826	GAA	2	6	17592	17597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_016826	TTC	2	6	17645	17650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_016826	GGT	2	6	17666	17671	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016826	GTC	2	6	17680	17685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_016826	TCGTG	2	10	17689	17698	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
70	NC_016826	CAT	2	6	17748	17753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_016826	TAA	2	6	17783	17788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016826	GGA	2	6	17792	17797	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016826	ATC	2	6	17816	17821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_016826	AC	3	6	17843	17848	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_016826	TGGT	2	8	17858	17865	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_016826	GCAA	2	8	17890	17897	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_016826	CGC	2	6	17982	17987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_016826	AC	3	6	18012	18017	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_016826	CAC	2	6	18027	18032	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_016826	AGCC	2	8	18075	18082	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
81	NC_016826	GAT	2	6	18098	18103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_016826	CCT	2	6	18154	18159	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_016826	AGG	2	6	18255	18260	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_016826	GTAA	2	8	18349	18356	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_016826	ATAG	2	8	18363	18370	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_016826	GTTAA	2	10	18436	18445	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_016826	ACG	2	6	18499	18504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_016826	TAG	2	6	18670	18675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_016826	GCGA	2	8	18678	18685	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
90	NC_016826	GAC	2	6	18744	18749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_016826	AGA	2	6	18758	18763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016826	AG	3	6	18786	18791	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_016826	TCG	2	6	18861	18866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_016826	GGA	2	6	18874	18879	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_016826	CT	3	6	18900	18905	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_016826	GGGAG	2	10	18955	18964	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
97	NC_016826	ACA	2	6	18992	18997	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_016826	ATG	2	6	19059	19064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_016826	TC	3	6	19278	19283	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_016826	TTGA	2	8	19339	19346	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_016826	ACC	2	6	19457	19462	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_016826	AT	3	6	19478	19483	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_016826	AGC	2	6	19537	19542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_016826	ATTC	2	8	19544	19551	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_016826	TG	3	6	19666	19671	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_016826	AAG	2	6	19672	19677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_016826	GAG	2	6	19687	19692	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_016826	TCC	2	6	19790	19795	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_016826	GA	3	6	19817	19822	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_016826	ACA	2	6	19843	19848	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_016826	TA	3	6	19871	19876	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_016826	CTAA	2	8	19898	19905	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_016826	GA	3	6	20112	20117	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_016826	CT	3	6	20228	20233	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_016826	GAT	2	6	20246	20251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_016826	CGG	2	6	20337	20342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_016826	GA	3	6	20435	20440	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016826	TAGG	2	8	20553	20560	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_016826	GTT	2	6	20597	20602	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_016826	TAC	2	6	20607	20612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_016826	CCT	2	6	20695	20700	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_016826	GGT	2	6	20831	20836	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_016826	TCG	2	6	20946	20951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_016826	CGT	2	6	21026	21031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_016826	AGGGA	2	10	21164	21173	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
126	NC_016826	GA	3	6	21250	21255	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_016826	AAGTGT	2	12	21276	21287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_016826	ACTAAT	2	12	21305	21316	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_016826	A	6	6	21334	21339	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_016826	AT	3	6	21381	21386	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_016826	AATC	2	8	21409	21416	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_016826	TA	3	6	21624	21629	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_016826	ACC	2	6	21828	21833	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_016826	CGT	2	6	21865	21870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_016826	ATG	2	6	21987	21992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_016826	CGC	2	6	22217	22222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_016826	GAT	2	6	22227	22232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_016826	AT	3	6	22231	22236	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_016826	GGA	2	6	22345	22350	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
140	NC_016826	GCGT	2	8	22404	22411	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
141	NC_016826	TCC	2	6	22428	22433	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
142	NC_016826	AGC	2	6	22458	22463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_016826	TCG	2	6	22472	22477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_016826	CGG	2	6	22575	22580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_016826	TAA	2	6	22610	22615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_016826	TGT	2	6	22657	22662	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
147	NC_016826	TTTTTA	2	12	22688	22699	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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164	NC_016826	A	6	6	27336	27341	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_016826	A	7	7	27346	27352	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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173	NC_016826	A	7	7	30549	30555	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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