MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shigella sonnei 53G

Total Repeats: 14019

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_016822	AAT	2	6	1274231	1274236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3502	NC_016822	GAT	2	6	1274281	1274286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3503	NC_016822	ATC	2	6	1274331	1274336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3504	NC_016822	TA	3	6	1274342	1274347	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3505	NC_016822	TGA	2	6	1274362	1274367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3506	NC_016822	TTG	2	6	1274414	1274419	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3507	NC_016822	TGAATT	2	12	1274431	1274442	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3508	NC_016822	ATG	2	6	1274444	1274449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3509	NC_016822	TGA	2	6	1274453	1274458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3510	NC_016822	T	6	6	1274471	1274476	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3511	NC_016822	TTAA	2	8	1274513	1274520	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3512	NC_016822	TAAT	2	8	1274533	1274540	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3513	NC_016822	ATGA	2	8	1274547	1274554	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3514	NC_016822	TTA	2	6	1274584	1274589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3515	NC_016822	AGA	2	6	1274642	1274647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3516	NC_016822	ACA	2	6	1274669	1274674	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3517	NC_016822	CTG	2	6	1274705	1274710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3518	NC_016822	AATT	2	8	1274820	1274827	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3519	NC_016822	GA	3	6	1274948	1274953	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3520	NC_016822	ATG	2	6	1275971	1275976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3521	NC_016822	T	6	6	1278535	1278540	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3522	NC_016822	CAA	2	6	1278544	1278549	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3523	NC_016822	T	6	6	1278557	1278562	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3524	NC_016822	CAC	2	6	1278565	1278570	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3525	NC_016822	AGCC	2	8	1278571	1278578	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3526	NC_016822	TTC	2	6	1278596	1278601	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3527	NC_016822	AGG	2	6	1278684	1278689	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3528	NC_016822	ACG	2	6	1281392	1281397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3529	NC_016822	ATT	2	6	1281435	1281440	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3530	NC_016822	AATC	2	8	1281454	1281461	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3531	NC_016822	AT	3	6	1281539	1281544	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3532	NC_016822	CATTAA	2	12	1281556	1281567	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3533	NC_016822	TTG	2	6	1281573	1281578	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3534	NC_016822	CTTT	2	8	1281580	1281587	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3535	NC_016822	TGT	2	6	1281602	1281607	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3536	NC_016822	ATT	2	6	1281657	1281662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3537	NC_016822	GAT	2	6	1281670	1281675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3538	NC_016822	ATTT	2	8	1281687	1281694	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3539	NC_016822	ATT	2	6	1281720	1281725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3540	NC_016822	TGCT	2	8	1281739	1281746	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3541	NC_016822	CAAAA	2	10	1281785	1281794	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
3542	NC_016822	TG	3	6	1281833	1281838	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3543	NC_016822	CA	3	6	1281847	1281852	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3544	NC_016822	C	6	6	1281869	1281874	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3545	NC_016822	GGT	2	6	1281982	1281987	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3546	NC_016822	ATT	2	6	1282026	1282031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3547	NC_016822	T	6	6	1282030	1282035	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3548	NC_016822	TGGG	2	8	1282100	1282107	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
3549	NC_016822	GAT	2	6	1283160	1283165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3550	NC_016822	GAT	2	6	1287504	1287509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3551	NC_016822	T	6	6	1287522	1287527	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3552	NC_016822	CGG	2	6	1287540	1287545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3553	NC_016822	C	6	6	1287567	1287572	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3554	NC_016822	GCC	2	6	1289303	1289308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3555	NC_016822	CGC	2	6	1293974	1293979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3556	NC_016822	TG	3	6	1294006	1294011	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3557	NC_016822	GCA	2	6	1294012	1294017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3558	NC_016822	CAT	2	6	1294079	1294084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3559	NC_016822	TCA	2	6	1294523	1294528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3560	NC_016822	GCC	2	6	1294534	1294539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3561	NC_016822	TGC	2	6	1295054	1295059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3562	NC_016822	ATG	2	6	1295079	1295084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3563	NC_016822	ATG	2	6	1296447	1296452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3564	NC_016822	CAT	2	6	1296499	1296504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3565	NC_016822	A	7	7	1299953	1299959	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3566	NC_016822	TAA	2	6	1299981	1299986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3567	NC_016822	TTG	2	6	1300010	1300015	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3568	NC_016822	ATT	2	6	1300018	1300023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3569	NC_016822	CAA	2	6	1300040	1300045	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3570	NC_016822	A	6	6	1300679	1300684	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3571	NC_016822	TGA	2	6	1302484	1302489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3572	NC_016822	GCG	2	6	1302607	1302612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3573	NC_016822	GGTT	2	8	1302623	1302630	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3574	NC_016822	CAT	2	6	1304023	1304028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3575	NC_016822	ATG	2	6	1304039	1304044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3576	NC_016822	T	7	7	1304083	1304089	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3577	NC_016822	A	6	6	1304105	1304110	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3578	NC_016822	TAA	2	6	1304163	1304168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3579	NC_016822	T	6	6	1304171	1304176	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3580	NC_016822	AT	4	8	1304220	1304227	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3581	NC_016822	TAA	2	6	1304274	1304279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3582	NC_016822	ATT	2	6	1304296	1304301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3583	NC_016822	ATTT	2	8	1304380	1304387	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3584	NC_016822	GGA	2	6	1305513	1305518	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3585	NC_016822	CGC	2	6	1308089	1308094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3586	NC_016822	AAAG	2	8	1309847	1309854	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3587	NC_016822	GAT	2	6	1310734	1310739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3588	NC_016822	AT	3	6	1310891	1310896	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3589	NC_016822	GTC	2	6	1310942	1310947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3590	NC_016822	TA	3	6	1310973	1310978	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3591	NC_016822	TA	3	6	1310985	1310990	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3592	NC_016822	AT	3	6	1310994	1310999	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3593	NC_016822	CCT	2	6	1311081	1311086	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3594	NC_016822	AGT	2	6	1311170	1311175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3595	NC_016822	GTT	2	6	1311184	1311189	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3596	NC_016822	T	6	6	1311841	1311846	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3597	NC_016822	CAT	2	6	1311893	1311898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3598	NC_016822	T	6	6	1311976	1311981	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3599	NC_016822	AT	3	6	1312019	1312024	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3600	NC_016822	AGAT	2	8	1312066	1312073	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3601	NC_016822	AG	3	6	1312122	1312127	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3602	NC_016822	AAG	2	6	1312880	1312885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3603	NC_016822	TTG	2	6	1312935	1312940	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3604	NC_016822	A	6	6	1312983	1312988	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3605	NC_016822	ATC	2	6	1313077	1313082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3606	NC_016822	CTT	2	6	1313102	1313107	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3607	NC_016822	CA	3	6	1313140	1313145	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3608	NC_016822	AG	3	6	1313608	1313613	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3609	NC_016822	TTA	2	6	1313619	1313624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3610	NC_016822	ATA	3	9	1313638	1313646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3611	NC_016822	ATG	2	6	1313677	1313682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3612	NC_016822	AGA	2	6	1313690	1313695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3613	NC_016822	CTTT	3	12	1313699	1313710	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3614	NC_016822	TC	3	6	1313729	1313734	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3615	NC_016822	TTAT	2	8	1314565	1314572	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3616	NC_016822	GTT	2	6	1314625	1314630	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3617	NC_016822	AGTT	2	8	1314655	1314662	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3618	NC_016822	AAG	2	6	1314679	1314684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3619	NC_016822	TTACC	2	10	1315468	1315477	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
3620	NC_016822	GT	3	6	1315547	1315552	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3621	NC_016822	TAA	2	6	1315901	1315906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3622	NC_016822	GTTG	2	8	1315933	1315940	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3623	NC_016822	ATT	2	6	1315942	1315947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3624	NC_016822	TCAG	2	8	1316247	1316254	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3625	NC_016822	TCCT	2	8	1316949	1316956	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3626	NC_016822	ACA	2	6	1317303	1317308	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3627	NC_016822	TTA	2	6	1317357	1317362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3628	NC_016822	CAGA	2	8	1317386	1317393	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3629	NC_016822	TGA	2	6	1317402	1317407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3630	NC_016822	CAT	2	6	1318781	1318786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3631	NC_016822	GCA	2	6	1318806	1318811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3632	NC_016822	CGT	2	6	1318849	1318854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3633	NC_016822	ATC	2	6	1318901	1318906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3635	NC_016822	AAT	2	6	1319112	1319117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3636	NC_016822	A	6	6	1319146	1319151	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3637	NC_016822	TAAA	2	8	1319167	1319174	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3642	NC_016822	ACA	2	6	1319905	1319910	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3650	NC_016822	GAA	2	6	1320586	1320591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3684	NC_016822	A	6	6	1330964	1330969	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3894	NC_016822	TAAC	2	8	1395490	1395497	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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