MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shigella sonnei 53G

Total Repeats: 14019

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_016822	GCAGT	2	10	577574	577583	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1502	NC_016822	TAA	2	6	577588	577593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_016822	GC	3	6	577612	577617	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1504	NC_016822	TGCAAA	2	12	577629	577640	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1505	NC_016822	AAT	2	6	577649	577654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_016822	AT	3	6	577662	577667	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_016822	CAAT	2	8	577673	577680	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1508	NC_016822	TGG	2	6	577743	577748	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_016822	AAT	2	6	583048	583053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_016822	T	6	6	583060	583065	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_016822	TTTG	2	8	583067	583074	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_016822	TGA	2	6	583086	583091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_016822	GGAA	2	8	583128	583135	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_016822	ATTA	2	8	587187	587194	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_016822	ATT	2	6	588579	588584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_016822	TTA	2	6	589587	589592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_016822	CAGC	2	8	589679	589686	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1518	NC_016822	TCA	2	6	589779	589784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1519	NC_016822	ATT	2	6	589912	589917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_016822	GGA	2	6	589937	589942	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_016822	GA	3	6	592745	592750	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_016822	GTTAA	2	10	594838	594847	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_016822	GTT	2	6	594883	594888	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_016822	AAC	2	6	594949	594954	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1525	NC_016822	G	6	6	597073	597078	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_016822	TCC	2	6	597111	597116	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1527	NC_016822	CGC	2	6	597197	597202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1528	NC_016822	TTTA	2	8	598558	598565	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_016822	CT	3	6	601640	601645	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1530	NC_016822	AATA	2	8	601735	601742	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_016822	TAG	2	6	601754	601759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_016822	CTGT	2	8	601760	601767	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1533	NC_016822	TA	3	6	601771	601776	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_016822	ACT	2	6	602682	602687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1535	NC_016822	TTC	2	6	602701	602706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1536	NC_016822	T	6	6	602731	602736	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_016822	GTAT	2	8	602739	602746	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_016822	T	7	7	602761	602767	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_016822	T	6	6	602834	602839	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_016822	CCAT	2	8	602871	602878	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1541	NC_016822	TATT	2	8	602890	602897	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_016822	ATG	2	6	602938	602943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_016822	TCAG	2	8	604430	604437	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1544	NC_016822	GTT	2	6	604536	604541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_016822	GCAG	2	8	604569	604576	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1546	NC_016822	CGC	2	6	604646	604651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1547	NC_016822	GGA	2	6	604775	604780	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_016822	TTC	2	6	605411	605416	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1549	NC_016822	TGC	2	6	605420	605425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1550	NC_016822	TTC	2	6	605437	605442	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1551	NC_016822	ATG	2	6	605451	605456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_016822	ATG	3	9	605492	605500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_016822	GCC	2	6	607118	607123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1554	NC_016822	GGC	2	6	607136	607141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1555	NC_016822	T	6	6	607142	607147	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_016822	CAGG	2	8	607178	607185	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1557	NC_016822	AT	3	6	607742	607747	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_016822	GACT	2	8	607822	607829	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1559	NC_016822	T	6	6	607831	607836	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_016822	CGC	2	6	609141	609146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1561	NC_016822	AAACG	2	10	609201	609210	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
1562	NC_016822	AAT	2	6	609212	609217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_016822	GCA	2	6	609221	609226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1564	NC_016822	GTC	2	6	609748	609753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1565	NC_016822	GGC	2	6	609806	609811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1566	NC_016822	ATG	2	6	609827	609832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_016822	ACTG	2	8	609835	609842	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1568	NC_016822	CATA	2	8	610788	610795	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1569	NC_016822	CTAT	2	8	610805	610812	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1570	NC_016822	A	6	6	610821	610826	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_016822	GGCG	2	8	610848	610855	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1572	NC_016822	TGA	2	6	610856	610861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_016822	CAT	2	6	618269	618274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1574	NC_016822	TGT	2	6	618427	618432	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_016822	TGT	2	6	618450	618455	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_016822	G	6	6	618500	618505	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1577	NC_016822	ATTT	2	8	618572	618579	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1578	NC_016822	T	6	6	618596	618601	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1579	NC_016822	ATTT	2	8	618602	618609	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_016822	T	6	6	618622	618627	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_016822	TAAT	2	8	618703	618710	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_016822	GGA	2	6	621102	621107	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_016822	TGC	2	6	622497	622502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1584	NC_016822	ATG	2	6	622522	622527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_016822	CTT	2	6	623749	623754	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1586	NC_016822	T	8	8	624153	624160	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1587	NC_016822	ATTTG	2	10	624564	624573	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_016822	AAT	2	6	624597	624602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1589	NC_016822	CGT	2	6	624603	624608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1590	NC_016822	AGG	2	6	624631	624636	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1591	NC_016822	T	7	7	625433	625439	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_016822	TG	3	6	625476	625481	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1593	NC_016822	CG	3	6	625482	625487	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1594	NC_016822	AAG	2	6	625547	625552	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_016822	A	7	7	625803	625809	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_016822	T	6	6	627264	627269	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_016822	CAGA	2	8	627272	627279	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1598	NC_016822	GTAA	2	8	627281	627288	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_016822	TTA	2	6	627289	627294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_016822	GCGT	2	8	628267	628274	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1601	NC_016822	TCAAT	2	10	628306	628315	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1602	NC_016822	TTG	2	6	628319	628324	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_016822	AGC	2	6	628383	628388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1604	NC_016822	TTG	3	9	628413	628421	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_016822	ATA	2	6	629457	629462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_016822	A	7	7	629466	629472	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_016822	AAT	2	6	629477	629482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_016822	GGAAC	2	10	629496	629505	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1609	NC_016822	AAAG	2	8	629596	629603	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_016822	TAT	2	6	629640	629645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_016822	GAG	2	6	630381	630386	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_016822	CGTAA	2	10	630704	630713	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1613	NC_016822	T	6	6	630745	630750	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_016822	A	6	6	632044	632049	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_016822	CTA	2	6	632055	632060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1616	NC_016822	GGCA	2	8	632077	632084	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1617	NC_016822	ATC	2	6	637193	637198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1618	NC_016822	CGC	2	6	637207	637212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1619	NC_016822	A	6	6	637264	637269	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_016822	A	7	7	637331	637337	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_016822	TCC	2	6	640240	640245	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1622	NC_016822	GGT	2	6	642881	642886	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_016822	GCATA	2	10	642898	642907	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1624	NC_016822	ATG	2	6	642955	642960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_016822	ATT	2	6	642966	642971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_016822	AGCAA	2	10	643005	643014	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
1627	NC_016822	TAT	3	9	643030	643038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_016822	ATATT	2	10	644627	644636	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_016822	TAT	2	6	644676	644681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_016822	CATT	2	8	644728	644735	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1631	NC_016822	AATG	2	8	644737	644744	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_016822	TCA	2	6	647506	647511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1633	NC_016822	ATA	2	6	647512	647517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1634	NC_016822	A	6	6	647517	647522	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1635	NC_016822	ATT	2	6	647547	647552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1636	NC_016822	T	6	6	649721	649726	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1637	NC_016822	GAAA	2	8	651458	651465	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1638	NC_016822	ACC	2	6	651493	651498	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1912	NC_016822	GA	3	6	754789	754794	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1913	NC_016822	ATT	2	6	754807	754812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1914	NC_016822	GCA	2	6	755312	755317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1945	NC_016822	TAA	2	6	770377	770382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1987	NC_016822	GC	3	6	781066	781071	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1988	NC_016822	CTG	2	6	781424	781429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1989	NC_016822	T	7	7	782993	782999	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1998	NC_016822	T	6	6	784548	784553	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1999	NC_016822	TG	3	6	784569	784574	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2000	NC_016822	GAA	2	6	784626	784631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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