MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shigella sonnei 53G

Total Repeats: 14019

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_016822	A	7	7	4806881	4806887	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13502	NC_016822	ATG	2	6	4806892	4806897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13503	NC_016822	TGA	2	6	4806903	4806908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13504	NC_016822	ATTT	2	8	4806950	4806957	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13505	NC_016822	AGG	2	6	4807064	4807069	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13506	NC_016822	AAT	2	6	4807073	4807078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13507	NC_016822	AGC	2	6	4808628	4808633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13508	NC_016822	TAA	2	6	4809633	4809638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13509	NC_016822	GGC	2	6	4809643	4809648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13510	NC_016822	GCC	2	6	4809653	4809658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13511	NC_016822	CAT	2	6	4810821	4810826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13512	NC_016822	GCA	2	6	4810846	4810851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13513	NC_016822	TCC	2	6	4811834	4811839	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13514	NC_016822	ATG	2	6	4811888	4811893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13515	NC_016822	TAT	2	6	4811913	4811918	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13516	NC_016822	TCA	2	6	4811963	4811968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13517	NC_016822	AAG	2	6	4811992	4811997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13518	NC_016822	TGC	2	6	4812009	4812014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13519	NC_016822	TCG	2	6	4812907	4812912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13520	NC_016822	GACT	2	8	4812920	4812927	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13521	NC_016822	AAC	2	6	4812945	4812950	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13522	NC_016822	ACAG	2	8	4812951	4812958	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13523	NC_016822	GAA	2	6	4812965	4812970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13524	NC_016822	A	7	7	4812969	4812975	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13525	NC_016822	TAA	2	6	4815114	4815119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13526	NC_016822	AGA	2	6	4816192	4816197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13527	NC_016822	AG	3	6	4816244	4816249	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13528	NC_016822	GGA	2	6	4816256	4816261	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13529	NC_016822	TTAA	2	8	4816269	4816276	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13530	NC_016822	ACTT	2	8	4817186	4817193	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13531	NC_016822	AGTA	2	8	4817196	4817203	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13532	NC_016822	GCATC	2	10	4817661	4817670	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
13533	NC_016822	TGA	2	6	4817694	4817699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13534	NC_016822	AAG	2	6	4817714	4817719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13535	NC_016822	ATC	2	6	4819683	4819688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13536	NC_016822	GAAA	2	8	4819697	4819704	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
13537	NC_016822	CTTA	2	8	4819720	4819727	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13538	NC_016822	GAA	2	6	4819737	4819742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13539	NC_016822	ATG	2	6	4819766	4819771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13540	NC_016822	CATT	2	8	4819790	4819797	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13541	NC_016822	TAAA	2	8	4820665	4820672	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13542	NC_016822	TAA	2	6	4820708	4820713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13543	NC_016822	TAA	2	6	4820723	4820728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13544	NC_016822	T	6	6	4820735	4820740	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13545	NC_016822	AAATA	2	10	4820789	4820798	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
13546	NC_016822	ATT	2	6	4821780	4821785	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13547	NC_016822	TGT	2	6	4821799	4821804	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13548	NC_016822	CTT	2	6	4822373	4822378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13549	NC_016822	AATG	2	8	4822493	4822500	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13550	NC_016822	AAT	2	6	4822541	4822546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13551	NC_016822	A	7	7	4822561	4822567	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13552	NC_016822	ATA	2	6	4822632	4822637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13553	NC_016822	CAG	2	6	4822674	4822679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13554	NC_016822	TAA	2	6	4822946	4822951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13555	NC_016822	G	6	6	4822986	4822991	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13556	NC_016822	TG	3	6	4824387	4824392	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13557	NC_016822	GAA	2	6	4824416	4824421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13558	NC_016822	CTG	2	6	4824493	4824498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13559	NC_016822	AT	3	6	4824554	4824559	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13560	NC_016822	CAA	2	6	4824631	4824636	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13561	NC_016822	CA	3	6	4825356	4825361	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13562	NC_016822	ACC	2	6	4825365	4825370	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13563	NC_016822	GTT	2	6	4831384	4831389	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13564	NC_016822	T	9	9	4831410	4831418	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13565	NC_016822	TC	3	6	4831442	4831447	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13566	NC_016822	A	6	6	4831477	4831482	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13567	NC_016822	CTG	2	6	4831485	4831490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13568	NC_016822	TGAG	2	8	4831543	4831550	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
13569	NC_016822	TGG	2	6	4831589	4831594	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13570	NC_016822	AAT	2	6	4831639	4831644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13571	NC_016822	TGG	2	6	4831647	4831652	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13572	NC_016822	AG	3	6	4831656	4831661	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13573	NC_016822	TTTA	2	8	4831662	4831669	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13574	NC_016822	A	6	6	4831680	4831685	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13575	NC_016822	AGA	2	6	4831726	4831731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13576	NC_016822	TAT	2	6	4832305	4832310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13577	NC_016822	T	6	6	4832469	4832474	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13578	NC_016822	T	6	6	4832520	4832525	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13579	NC_016822	AAT	3	9	4832544	4832552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13580	NC_016822	CGA	2	6	4832558	4832563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13581	NC_016822	CGC	2	6	4833577	4833582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13582	NC_016822	CAA	2	6	4838260	4838265	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13583	NC_016822	AAT	2	6	4838274	4838279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13584	NC_016822	A	6	6	4838379	4838384	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13585	NC_016822	CGC	2	6	4839813	4839818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13586	NC_016822	CAA	2	6	4839841	4839846	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13587	NC_016822	A	7	7	4840417	4840423	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13588	NC_016822	CT	3	6	4840487	4840492	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13589	NC_016822	A	6	6	4841883	4841888	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13590	NC_016822	GTA	2	6	4841951	4841956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13591	NC_016822	TAAA	2	8	4842012	4842019	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13592	NC_016822	A	6	6	4842017	4842022	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13593	NC_016822	CGC	2	6	4843051	4843056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13594	NC_016822	T	6	6	4845285	4845290	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13595	NC_016822	CGTTT	2	10	4845291	4845300	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
13596	NC_016822	CGC	2	6	4845339	4845344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13597	NC_016822	GTA	2	6	4845364	4845369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13598	NC_016822	ACA	2	6	4845389	4845394	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13599	NC_016822	TTGGG	2	10	4845397	4845406	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
13600	NC_016822	TA	4	8	4845422	4845429	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13601	NC_016822	T	7	7	4845456	4845462	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13602	NC_016822	T	6	6	4845523	4845528	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13603	NC_016822	CAA	2	6	4845552	4845557	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13604	NC_016822	ACA	2	6	4845560	4845565	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13605	NC_016822	GACA	2	8	4845570	4845577	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13606	NC_016822	GAA	2	6	4847316	4847321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13607	NC_016822	TTGG	2	8	4848770	4848777	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13608	NC_016822	AT	3	6	4848785	4848790	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13609	NC_016822	TGT	2	6	4849814	4849819	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13610	NC_016822	GTT	2	6	4849830	4849835	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13611	NC_016822	ATT	2	6	4849838	4849843	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13612	NC_016822	TAT	2	6	4849915	4849920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13613	NC_016822	ATT	2	6	4849942	4849947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13614	NC_016822	TTA	2	6	4849957	4849962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13615	NC_016822	GCG	2	6	4849966	4849971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13616	NC_016822	T	6	6	4849973	4849978	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13617	NC_016822	TTA	2	6	4850114	4850119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13618	NC_016822	TGG	2	6	4852902	4852907	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13619	NC_016822	GCG	2	6	4852953	4852958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13620	NC_016822	CAA	2	6	4852976	4852981	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13621	NC_016822	TCA	2	6	4853047	4853052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13622	NC_016822	TTA	2	6	4853489	4853494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13623	NC_016822	TTA	2	6	4853535	4853540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13624	NC_016822	TGT	2	6	4855224	4855229	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13625	NC_016822	AAT	2	6	4855260	4855265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13626	NC_016822	TTTCAC	2	12	4855291	4855302	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13627	NC_016822	AACG	2	8	4855357	4855364	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13628	NC_016822	AGA	2	6	4855805	4855810	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13629	NC_016822	GAC	2	6	4855840	4855845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13630	NC_016822	CAT	2	6	4855866	4855871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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