MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shigella sonnei 53G

Total Repeats: 14019

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_016822	TCTG	2	8	4629740	4629747	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13002	NC_016822	TTA	2	6	4629763	4629768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13003	NC_016822	CCG	2	6	4630652	4630657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13004	NC_016822	CAT	2	6	4632205	4632210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13005	NC_016822	TTG	2	6	4632296	4632301	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13006	NC_016822	TTG	2	6	4632307	4632312	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13007	NC_016822	A	7	7	4632903	4632909	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13008	NC_016822	A	6	6	4633790	4633795	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13009	NC_016822	GAT	2	6	4633800	4633805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13010	NC_016822	TCT	2	6	4633816	4633821	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13011	NC_016822	TGCGC	2	10	4633833	4633842	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
13012	NC_016822	ACACA	2	10	4633854	4633863	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
13013	NC_016822	CGC	2	6	4633913	4633918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13014	NC_016822	TC	3	6	4633929	4633934	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13015	NC_016822	TAA	2	6	4636383	4636388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13016	NC_016822	CG	3	6	4636451	4636456	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13017	NC_016822	ATC	2	6	4636474	4636479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13018	NC_016822	TA	3	6	4636968	4636973	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13019	NC_016822	TA	3	6	4636989	4636994	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13020	NC_016822	GCC	2	6	4637639	4637644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13021	NC_016822	GTTT	2	8	4637655	4637662	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
13022	NC_016822	TC	3	6	4637667	4637672	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13023	NC_016822	TCA	2	6	4637674	4637679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13024	NC_016822	AGA	2	6	4639080	4639085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13025	NC_016822	CCT	2	6	4639348	4639353	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13026	NC_016822	TTG	2	6	4639971	4639976	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13027	NC_016822	ATA	2	6	4640044	4640049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13028	NC_016822	TAA	2	6	4640052	4640057	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13029	NC_016822	TAAA	2	8	4640066	4640073	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13030	NC_016822	TATT	2	8	4640093	4640100	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13031	NC_016822	AGG	2	6	4640180	4640185	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13032	NC_016822	A	6	6	4640198	4640203	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13033	NC_016822	AAAT	2	8	4640477	4640484	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13034	NC_016822	TTC	2	6	4641211	4641216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13035	NC_016822	TA	3	6	4641234	4641239	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13036	NC_016822	T	6	6	4641265	4641270	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13037	NC_016822	AT	3	6	4641296	4641301	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13038	NC_016822	TG	3	6	4641315	4641320	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13039	NC_016822	T	6	6	4641322	4641327	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13040	NC_016822	TCG	2	6	4641333	4641338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13041	NC_016822	TAA	2	6	4641380	4641385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13042	NC_016822	ATT	2	6	4641387	4641392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13043	NC_016822	TGT	2	6	4641464	4641469	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13044	NC_016822	CCT	2	6	4641495	4641500	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13045	NC_016822	ATAAC	2	10	4641516	4641525	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
13046	NC_016822	AT	3	6	4641532	4641537	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13047	NC_016822	AAT	2	6	4641544	4641549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13048	NC_016822	A	6	6	4641586	4641591	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13049	NC_016822	AACCA	2	10	4641594	4641603	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
13050	NC_016822	AGT	2	6	4642615	4642620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13051	NC_016822	CAC	2	6	4642627	4642632	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13052	NC_016822	ATT	2	6	4642676	4642681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13053	NC_016822	GAT	2	6	4642989	4642994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13054	NC_016822	TACA	2	8	4643087	4643094	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13055	NC_016822	AAAG	2	8	4643107	4643114	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
13056	NC_016822	TCC	2	6	4644130	4644135	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13057	NC_016822	GCG	2	6	4646790	4646795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13058	NC_016822	CTT	2	6	4646953	4646958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13059	NC_016822	ACC	2	6	4646977	4646982	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13060	NC_016822	GTC	2	6	4648250	4648255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13061	NC_016822	GAT	2	6	4648276	4648281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13062	NC_016822	T	7	7	4648281	4648287	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13063	NC_016822	GTT	2	6	4648294	4648299	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13064	NC_016822	GA	3	6	4648306	4648311	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13065	NC_016822	TAA	2	6	4648312	4648317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13066	NC_016822	T	6	6	4648377	4648382	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13067	NC_016822	TAA	2	6	4648392	4648397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13068	NC_016822	ATT	2	6	4648415	4648420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13069	NC_016822	ATC	3	9	4648947	4648955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13070	NC_016822	TAA	2	6	4648967	4648972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13071	NC_016822	ATC	2	6	4649014	4649019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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13074	NC_016822	TAA	2	6	4649125	4649130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13075	NC_016822	TAA	2	6	4649160	4649165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13076	NC_016822	T	6	6	4649169	4649174	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13077	NC_016822	A	7	7	4649179	4649185	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13078	NC_016822	ATC	2	6	4649216	4649221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13079	NC_016822	TCA	2	6	4649229	4649234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13080	NC_016822	TCCT	2	8	4649251	4649258	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13081	NC_016822	CAA	2	6	4649296	4649301	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13082	NC_016822	T	7	7	4650097	4650103	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13083	NC_016822	TGC	2	6	4650131	4650136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13085	NC_016822	AGC	2	6	4650164	4650169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13087	NC_016822	TGAA	2	8	4653892	4653899	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13088	NC_016822	GTTT	2	8	4653953	4653960	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
13089	NC_016822	CG	3	6	4654012	4654017	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13090	NC_016822	T	7	7	4654038	4654044	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13093	NC_016822	A	6	6	4654659	4654664	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13094	NC_016822	TCT	2	6	4654737	4654742	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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13098	NC_016822	GCT	2	6	4654844	4654849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13099	NC_016822	CGA	2	6	4654878	4654883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13100	NC_016822	CAT	2	6	4654912	4654917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13101	NC_016822	AAG	2	6	4654927	4654932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13102	NC_016822	GAA	3	9	4654941	4654949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13103	NC_016822	GTG	2	6	4654958	4654963	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13104	NC_016822	GCG	2	6	4655014	4655019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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13106	NC_016822	ATTG	2	8	4655121	4655128	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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13108	NC_016822	AATT	2	8	4655233	4655240	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13109	NC_016822	ATT	2	6	4655255	4655260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13110	NC_016822	CAGG	2	8	4655384	4655391	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13111	NC_016822	GCT	2	6	4657431	4657436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13112	NC_016822	TGC	2	6	4657448	4657453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13113	NC_016822	ATG	2	6	4657473	4657478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13114	NC_016822	TCTT	2	8	4658234	4658241	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
13115	NC_016822	ATA	2	6	4658281	4658286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13116	NC_016822	TC	3	6	4658293	4658298	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13117	NC_016822	TCA	2	6	4658334	4658339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13118	NC_016822	CAT	2	6	4658376	4658381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13119	NC_016822	CT	4	8	4658409	4658416	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13120	NC_016822	GATG	2	8	4658423	4658430	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
13121	NC_016822	ATA	2	6	4658560	4658565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13122	NC_016822	GGT	2	6	4658627	4658632	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13123	NC_016822	AAT	2	6	4658643	4658648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13124	NC_016822	ATA	3	9	4658659	4658667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13125	NC_016822	TGG	2	6	4658693	4658698	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13126	NC_016822	TTA	2	6	4658828	4658833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13127	NC_016822	ATGC	2	8	4658919	4658926	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13128	NC_016822	GCA	2	6	4658954	4658959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13130	NC_016822	TTAA	2	8	4659101	4659108	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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