MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shigella sonnei 53G

Total Repeats: 14019

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_016822	A	7	7	4141761	4141767	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11502	NC_016822	TAA	2	6	4141777	4141782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11503	NC_016822	ATTT	2	8	4146108	4146115	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11504	NC_016822	TCC	2	6	4146820	4146825	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11505	NC_016822	ATTA	2	8	4150146	4150153	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11506	NC_016822	AAAT	2	8	4150161	4150168	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11507	NC_016822	CAT	2	6	4150915	4150920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11508	NC_016822	GCA	2	6	4150940	4150945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11509	NC_016822	T	7	7	4152328	4152334	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11510	NC_016822	CGAT	2	8	4152341	4152348	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11511	NC_016822	CCTG	2	8	4153813	4153820	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11512	NC_016822	TA	3	6	4153845	4153850	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11513	NC_016822	TAAT	3	12	4153857	4153868	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11514	NC_016822	ACA	2	6	4154363	4154368	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11515	NC_016822	TGG	2	6	4154421	4154426	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11516	NC_016822	TAT	2	6	4154485	4154490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11517	NC_016822	TGG	2	6	4154501	4154506	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11518	NC_016822	CTG	2	6	4155855	4155860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11519	NC_016822	TAT	2	6	4155917	4155922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11520	NC_016822	CCTG	2	8	4155927	4155934	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11521	NC_016822	TAT	2	6	4155943	4155948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11522	NC_016822	TCCT	2	8	4155989	4155996	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11523	NC_016822	ACA	2	6	4156343	4156348	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11524	NC_016822	TTA	2	6	4156397	4156402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11525	NC_016822	CAGA	2	8	4156426	4156433	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11526	NC_016822	TGA	2	6	4156442	4156447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11527	NC_016822	A	7	7	4158457	4158463	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11528	NC_016822	TTGG	2	8	4158482	4158489	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11529	NC_016822	AAT	2	6	4158498	4158503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11530	NC_016822	ATAA	2	8	4158571	4158578	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11531	NC_016822	TCCA	2	8	4158944	4158951	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
11532	NC_016822	CCTT	2	8	4158967	4158974	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11533	NC_016822	GGC	2	6	4159919	4159924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11534	NC_016822	TTA	2	6	4162004	4162009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11535	NC_016822	T	7	7	4162032	4162038	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11536	NC_016822	ATA	2	6	4162050	4162055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11537	NC_016822	TAA	2	6	4162066	4162071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11538	NC_016822	TCT	2	6	4162072	4162077	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11539	NC_016822	AT	3	6	4162097	4162102	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11540	NC_016822	T	7	7	4162116	4162122	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11541	NC_016822	GAA	2	6	4162139	4162144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11542	NC_016822	TTA	2	6	4162151	4162156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11543	NC_016822	CAGA	2	8	4162212	4162219	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11544	NC_016822	AGG	2	6	4162309	4162314	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11545	NC_016822	TTC	2	6	4162542	4162547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11546	NC_016822	ATA	2	6	4162554	4162559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11547	NC_016822	CGAT	2	8	4162575	4162582	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11548	NC_016822	TATT	2	8	4162583	4162590	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11549	NC_016822	A	7	7	4162606	4162612	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11550	NC_016822	TAA	2	6	4162887	4162892	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11551	NC_016822	TAC	2	6	4162997	4163002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11552	NC_016822	CAA	2	6	4163067	4163072	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11553	NC_016822	TCA	2	6	4163116	4163121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11554	NC_016822	CTC	2	6	4163451	4163456	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11555	NC_016822	GATTC	2	10	4163554	4163563	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
11556	NC_016822	AT	3	6	4163615	4163620	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11557	NC_016822	A	6	6	4163691	4163696	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11558	NC_016822	T	6	6	4163713	4163718	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11559	NC_016822	ACA	2	6	4163728	4163733	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11560	NC_016822	GT	3	6	4163836	4163841	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11561	NC_016822	T	7	7	4163852	4163858	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11562	NC_016822	TC	3	6	4165616	4165621	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11563	NC_016822	ATG	2	6	4165657	4165662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11564	NC_016822	GAA	2	6	4165673	4165678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11565	NC_016822	TAA	2	6	4166386	4166391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11566	NC_016822	TCA	2	6	4167230	4167235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11567	NC_016822	TCTG	2	8	4167244	4167251	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11568	NC_016822	TAA	2	6	4167275	4167280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11569	NC_016822	TTG	2	6	4167328	4167333	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11570	NC_016822	AGGA	2	8	4167682	4167689	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11571	NC_016822	ATT	2	6	4167718	4167723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11572	NC_016822	GTAA	2	8	4167745	4167752	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11573	NC_016822	CTA	2	6	4171184	4171189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11574	NC_016822	AAT	2	6	4171215	4171220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11575	NC_016822	AAT	2	6	4171987	4171992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11576	NC_016822	ATA	2	6	4172022	4172027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11577	NC_016822	AAT	2	6	4172037	4172042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11578	NC_016822	TCAT	2	8	4172050	4172057	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11579	NC_016822	TTA	2	6	4172161	4172166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11580	NC_016822	CG	3	6	4173608	4173613	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11581	NC_016822	GTTT	2	8	4173705	4173712	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
11582	NC_016822	CTG	2	6	4175412	4175417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11583	NC_016822	TTCG	2	8	4175526	4175533	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11584	NC_016822	T	6	6	4175604	4175609	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11585	NC_016822	AGCGA	2	10	4175663	4175672	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
11586	NC_016822	GA	3	6	4175671	4175676	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11587	NC_016822	T	6	6	4175772	4175777	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11588	NC_016822	TCGAC	2	10	4175823	4175832	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
11589	NC_016822	GCG	2	6	4175894	4175899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11590	NC_016822	AC	3	6	4175919	4175924	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11591	NC_016822	CA	3	6	4175925	4175930	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11592	NC_016822	T	7	7	4175998	4176004	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11593	NC_016822	T	7	7	4176020	4176026	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11594	NC_016822	TGGC	2	8	4176037	4176044	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11595	NC_016822	T	7	7	4176115	4176121	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11596	NC_016822	CTG	2	6	4176206	4176211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11597	NC_016822	T	7	7	4176229	4176235	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11598	NC_016822	TTTG	2	8	4176240	4176247	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
11599	NC_016822	GGA	2	6	4176338	4176343	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11600	NC_016822	A	6	6	4176410	4176415	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11601	NC_016822	A	6	6	4176417	4176422	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11602	NC_016822	ACA	2	6	4176458	4176463	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11603	NC_016822	GGCAAA	2	12	4178117	4178128	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
11604	NC_016822	AGAA	2	8	4183642	4183649	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11605	NC_016822	A	6	6	4183722	4183727	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11606	NC_016822	GAG	2	6	4183757	4183762	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11607	NC_016822	TGG	2	6	4183968	4183973	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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11609	NC_016822	ACA	2	6	4184024	4184029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11613	NC_016822	GCA	2	6	4184342	4184347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11614	NC_016822	TGG	2	6	4184451	4184456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11615	NC_016822	GA	4	8	4184469	4184476	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11616	NC_016822	ACA	2	6	4184507	4184512	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11617	NC_016822	GGC	2	6	4184579	4184584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11618	NC_016822	ATA	2	6	4184806	4184811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11619	NC_016822	GCA	2	6	4184825	4184830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11620	NC_016822	TGG	2	6	4184934	4184939	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11621	NC_016822	GA	4	8	4184952	4184959	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11622	NC_016822	ACA	2	6	4184990	4184995	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11623	NC_016822	AAC	2	6	4185020	4185025	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11624	NC_016822	ACA	2	6	4185054	4185059	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11625	NC_016822	GGC	2	6	4185062	4185067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11626	NC_016822	ATA	2	6	4185289	4185294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11627	NC_016822	GCA	2	6	4185308	4185313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11628	NC_016822	TGG	2	6	4185417	4185422	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11629	NC_016822	GA	4	8	4185435	4185442	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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11631	NC_016822	ACA	2	6	4185473	4185478	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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