MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shigella sonnei 53G

Total Repeats: 14019

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_016822	AAT	2	6	3962353	3962358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11002	NC_016822	TGGC	2	8	3962957	3962964	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11003	NC_016822	CCA	2	6	3963053	3963058	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11004	NC_016822	T	8	8	3963113	3963120	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11005	NC_016822	TC	3	6	3963212	3963217	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11006	NC_016822	CG	3	6	3963220	3963225	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11007	NC_016822	CAC	2	6	3967627	3967632	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11008	NC_016822	CAA	2	6	3967634	3967639	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11009	NC_016822	TCA	2	6	3967708	3967713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11010	NC_016822	TAA	2	6	3967768	3967773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11011	NC_016822	TCC	2	6	3967795	3967800	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11012	NC_016822	ATC	2	6	3967861	3967866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11013	NC_016822	ATT	2	6	3968683	3968688	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11014	NC_016822	A	6	6	3968735	3968740	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11015	NC_016822	AGT	2	6	3968776	3968781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11016	NC_016822	ATA	2	6	3968801	3968806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11017	NC_016822	GCA	2	6	3968814	3968819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11018	NC_016822	AT	3	6	3968823	3968828	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11019	NC_016822	A	7	7	3968857	3968863	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11020	NC_016822	TTA	2	6	3968949	3968954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11021	NC_016822	T	8	8	3969000	3969007	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11022	NC_016822	TTAA	2	8	3969881	3969888	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11023	NC_016822	CGC	2	6	3969896	3969901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11024	NC_016822	ATTG	2	8	3969915	3969922	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11025	NC_016822	ATAA	2	8	3969923	3969930	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11026	NC_016822	GAT	2	6	3969954	3969959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11027	NC_016822	TG	3	6	3969962	3969967	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11028	NC_016822	AGCA	2	8	3970035	3970042	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11029	NC_016822	AAT	2	6	3970043	3970048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11030	NC_016822	TAA	2	6	3970083	3970088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11031	NC_016822	AT	3	6	3970102	3970107	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11032	NC_016822	AT	3	6	3970135	3970140	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11033	NC_016822	TAA	2	6	3970150	3970155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11034	NC_016822	T	7	7	3970175	3970181	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11035	NC_016822	ATTT	2	8	3971633	3971640	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11036	NC_016822	A	6	6	3971650	3971655	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11037	NC_016822	TATAA	2	10	3971735	3971744	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
11038	NC_016822	ATA	2	6	3971757	3971762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11039	NC_016822	TAT	2	6	3971777	3971782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11040	NC_016822	TAA	2	6	3971785	3971790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11041	NC_016822	GGT	2	6	3973241	3973246	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11042	NC_016822	TGC	2	6	3973278	3973283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11043	NC_016822	CAT	2	6	3973306	3973311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11044	NC_016822	A	6	6	3973312	3973317	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11045	NC_016822	AATC	2	8	3973342	3973349	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11046	NC_016822	GCG	2	6	3973423	3973428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11047	NC_016822	TGAAAA	2	12	3973448	3973459	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11048	NC_016822	ACA	2	6	3973460	3973465	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11049	NC_016822	T	6	6	3973511	3973516	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11050	NC_016822	TAA	2	6	3973524	3973529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11051	NC_016822	CCA	2	6	3973556	3973561	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11052	NC_016822	CGA	2	6	3973605	3973610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11053	NC_016822	CAGC	2	8	3975289	3975296	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11054	NC_016822	CTG	2	6	3975307	3975312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11055	NC_016822	AGG	2	6	3975333	3975338	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11056	NC_016822	TGC	2	6	3978159	3978164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11057	NC_016822	ATG	2	6	3978184	3978189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11058	NC_016822	GAT	2	6	3978930	3978935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11059	NC_016822	ATG	2	6	3978964	3978969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11060	NC_016822	TGA	2	6	3979007	3979012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11061	NC_016822	AAT	2	6	3979303	3979308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11062	NC_016822	TTC	2	6	3979348	3979353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11063	NC_016822	CAT	2	6	3980436	3980441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11064	NC_016822	GCA	2	6	3980461	3980466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11065	NC_016822	TTAC	2	8	3981009	3981016	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11066	NC_016822	GAA	2	6	3981057	3981062	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11067	NC_016822	CCTTT	2	10	3981730	3981739	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
11068	NC_016822	A	7	7	3981809	3981815	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11069	NC_016822	TC	3	6	3981817	3981822	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11070	NC_016822	CCT	2	6	3981872	3981877	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11071	NC_016822	CATG	2	8	3983257	3983264	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11072	NC_016822	T	6	6	3983277	3983282	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11073	NC_016822	ATG	2	6	3984678	3984683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11074	NC_016822	T	6	6	3984732	3984737	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11075	NC_016822	GTG	2	6	3986929	3986934	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11076	NC_016822	AGG	2	6	3986936	3986941	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11077	NC_016822	AAG	2	6	3986986	3986991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11078	NC_016822	TGGC	2	8	3987000	3987007	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11079	NC_016822	TGC	2	6	3987039	3987044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11081	NC_016822	T	7	7	3987826	3987832	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11082	NC_016822	A	7	7	3987867	3987873	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11083	NC_016822	GAAGC	2	10	3987904	3987913	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
11084	NC_016822	TG	3	6	3989332	3989337	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11085	NC_016822	GAAAA	2	10	3989366	3989375	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
11086	NC_016822	A	6	6	3989372	3989377	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11087	NC_016822	CCG	2	6	3991856	3991861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11088	NC_016822	TAA	2	6	3991914	3991919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11089	NC_016822	GC	3	6	3992020	3992025	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11090	NC_016822	GGA	2	6	3992031	3992036	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11091	NC_016822	TTA	2	6	3992080	3992085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11092	NC_016822	GCG	2	6	3992133	3992138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11093	NC_016822	AGA	2	6	3992227	3992232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11094	NC_016822	ACGT	2	8	3992346	3992353	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11095	NC_016822	CAA	2	6	3992354	3992359	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11096	NC_016822	GGGC	2	8	4000009	4000016	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
11097	NC_016822	CTT	2	6	4000749	4000754	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11098	NC_016822	CCT	2	6	4000757	4000762	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11099	NC_016822	T	7	7	4000810	4000816	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11100	NC_016822	GTA	2	6	4000845	4000850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11101	NC_016822	CAA	2	6	4000851	4000856	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11102	NC_016822	TAC	2	6	4000867	4000872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11103	NC_016822	TCA	2	6	4000898	4000903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11104	NC_016822	TAC	2	6	4000910	4000915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11105	NC_016822	ATCG	2	8	4000934	4000941	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11106	NC_016822	AGA	2	6	4000953	4000958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11107	NC_016822	TCAC	2	8	4006771	4006778	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
11108	NC_016822	TCA	2	6	4006781	4006786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11109	NC_016822	ATG	2	6	4006831	4006836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11111	NC_016822	CAT	3	9	4008482	4008490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11112	NC_016822	GGC	2	6	4008504	4008509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11113	NC_016822	TGC	2	6	4008530	4008535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11114	NC_016822	A	8	8	4008568	4008575	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11115	NC_016822	ACCTG	2	10	4008662	4008671	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
11116	NC_016822	GCC	2	6	4009144	4009149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11117	NC_016822	TACT	2	8	4009214	4009221	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11118	NC_016822	CTT	2	6	4009224	4009229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11119	NC_016822	T	6	6	4012256	4012261	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11120	NC_016822	CA	3	6	4012284	4012289	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11121	NC_016822	A	6	6	4012309	4012314	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11122	NC_016822	T	8	8	4012319	4012326	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11123	NC_016822	GTC	2	6	4012438	4012443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11124	NC_016822	GC	3	6	4014280	4014285	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11125	NC_016822	ACC	2	6	4014357	4014362	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11126	NC_016822	A	6	6	4014445	4014450	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11127	NC_016822	GTT	2	6	4014468	4014473	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11128	NC_016822	CGG	2	6	4014494	4014499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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11130	NC_016822	TGG	2	6	4014541	4014546	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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11132	NC_016822	CGT	2	6	4014624	4014629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11133	NC_016822	TTG	2	6	4014700	4014705	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11134	NC_016822	CTA	2	6	4014737	4014742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11135	NC_016822	TGG	2	6	4014762	4014767	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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11139	NC_016822	GCG	2	6	4015081	4015086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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11257	NC_016822	TAT	2	6	4052589	4052594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11258	NC_016822	T	6	6	4052635	4052640	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11264	NC_016822	TTTC	2	8	4052817	4052824	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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