MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shigella sonnei 53G

Total Repeats: 14019

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10502	NC_016822	TTC	2	6	3761098	3761103	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10503	NC_016822	AGA	3	9	3761110	3761118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10504	NC_016822	TCC	2	6	3761153	3761158	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10505	NC_016822	CGA	2	6	3761169	3761174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10506	NC_016822	T	6	6	3761188	3761193	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10507	NC_016822	GAA	2	6	3761194	3761199	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10508	NC_016822	GTGTT	2	10	3761203	3761212	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
10509	NC_016822	AAG	2	6	3761281	3761286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10510	NC_016822	ACA	2	6	3763354	3763359	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10511	NC_016822	ATT	2	6	3764195	3764200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10512	NC_016822	ATGT	2	8	3764224	3764231	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10513	NC_016822	ATTA	2	8	3764236	3764243	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10514	NC_016822	ATAA	2	8	3764260	3764267	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10515	NC_016822	ACCC	2	8	3764325	3764332	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
10516	NC_016822	ACAT	2	8	3764349	3764356	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10517	NC_016822	ATA	2	6	3764395	3764400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10518	NC_016822	TGC	2	6	3764405	3764410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10519	NC_016822	TGC	2	6	3764417	3764422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10520	NC_016822	ATG	2	6	3764442	3764447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10521	NC_016822	AC	3	6	3765627	3765632	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10522	NC_016822	AT	3	6	3765662	3765667	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10523	NC_016822	CAAAA	2	10	3765704	3765713	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
10524	NC_016822	ATT	2	6	3765727	3765732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10525	NC_016822	A	6	6	3765786	3765791	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10526	NC_016822	GAA	2	6	3765803	3765808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10527	NC_016822	ATTGA	2	10	3765845	3765854	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
10528	NC_016822	AAT	2	6	3765868	3765873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10529	NC_016822	CAA	2	6	3765909	3765914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10530	NC_016822	TTCAA	2	10	3765942	3765951	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
10531	NC_016822	GA	3	6	3767189	3767194	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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10533	NC_016822	GTT	2	6	3769917	3769922	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10535	NC_016822	CTTA	2	8	3769983	3769990	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10536	NC_016822	TAA	2	6	3770416	3770421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10537	NC_016822	CA	3	6	3770430	3770435	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10538	NC_016822	A	8	8	3772266	3772273	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10539	NC_016822	ATG	2	6	3772322	3772327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10540	NC_016822	TAA	2	6	3772388	3772393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10541	NC_016822	A	7	7	3772392	3772398	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10542	NC_016822	CCG	2	6	3772399	3772404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10543	NC_016822	GGC	2	6	3772413	3772418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10544	NC_016822	TAT	2	6	3773284	3773289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10545	NC_016822	TACA	2	8	3773324	3773331	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10546	NC_016822	TAT	2	6	3773341	3773346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10547	NC_016822	GCA	2	6	3773412	3773417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10549	NC_016822	T	6	6	3773710	3773715	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10550	NC_016822	GAA	2	6	3774340	3774345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10551	NC_016822	A	7	7	3774395	3774401	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10552	NC_016822	TACAT	2	10	3777060	3777069	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
10553	NC_016822	CGG	2	6	3780272	3780277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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10555	NC_016822	GCG	2	6	3781895	3781900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10556	NC_016822	GC	3	6	3782605	3782610	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10557	NC_016822	CGC	2	6	3784748	3784753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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10560	NC_016822	CG	3	6	3787535	3787540	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10561	NC_016822	AACA	2	8	3788133	3788140	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
10562	NC_016822	A	7	7	3788147	3788153	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10563	NC_016822	AT	3	6	3788223	3788228	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10566	NC_016822	CT	3	6	3789614	3789619	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10567	NC_016822	T	6	6	3789667	3789672	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10568	NC_016822	TA	3	6	3789748	3789753	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10569	NC_016822	AGAAA	2	10	3789814	3789823	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
10570	NC_016822	T	6	6	3792774	3792779	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10571	NC_016822	T	6	6	3792795	3792800	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10572	NC_016822	T	6	6	3792808	3792813	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10573	NC_016822	CTT	2	6	3795052	3795057	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10574	NC_016822	TA	3	6	3795070	3795075	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10575	NC_016822	TAA	2	6	3795100	3795105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10576	NC_016822	ATTA	2	8	3795240	3795247	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10577	NC_016822	AT	3	6	3795248	3795253	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10578	NC_016822	CTT	2	6	3795521	3795526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10579	NC_016822	CCCG	2	8	3795530	3795537	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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10581	NC_016822	CAT	2	6	3795636	3795641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10583	NC_016822	TCA	2	6	3795654	3795659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10584	NC_016822	CCCGG	2	10	3798122	3798131	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
10585	NC_016822	ATTC	2	8	3799851	3799858	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10586	NC_016822	GCATC	2	10	3800633	3800642	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
10587	NC_016822	AG	3	6	3805162	3805167	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10588	NC_016822	AG	3	6	3805648	3805653	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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10591	NC_016822	CAC	2	6	3805761	3805766	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10592	NC_016822	CTG	2	6	3805816	3805821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10596	NC_016822	ATG	2	6	3805944	3805949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10597	NC_016822	CTG	2	6	3805998	3806003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10598	NC_016822	ACC	2	6	3806275	3806280	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10599	NC_016822	ATC	2	6	3806331	3806336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10602	NC_016822	TGA	2	6	3806467	3806472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10603	NC_016822	GCG	2	6	3806520	3806525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10604	NC_016822	GCCA	2	8	3806593	3806600	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10605	NC_016822	TCA	2	6	3806624	3806629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10606	NC_016822	CTG	2	6	3806733	3806738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10607	NC_016822	GCG	2	6	3806752	3806757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10608	NC_016822	TTG	2	6	3806803	3806808	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10609	NC_016822	T	7	7	3806840	3806846	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10610	NC_016822	ACG	2	6	3808227	3808232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10611	NC_016822	T	6	6	3808261	3808266	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10612	NC_016822	ATT	2	6	3808270	3808275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10613	NC_016822	A	7	7	3808288	3808294	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10614	NC_016822	ACTA	2	8	3811613	3811620	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10615	NC_016822	TTG	2	6	3813087	3813092	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10617	NC_016822	TAC	2	6	3814768	3814773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10618	NC_016822	AG	3	6	3814809	3814814	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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10620	NC_016822	GC	3	6	3814941	3814946	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10621	NC_016822	ACC	2	6	3814956	3814961	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10622	NC_016822	A	6	6	3814996	3815001	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10623	NC_016822	GCC	2	6	3815013	3815018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10624	NC_016822	ATC	3	9	3815029	3815037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10626	NC_016822	GC	3	6	3815101	3815106	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10627	NC_016822	GCG	2	6	3816715	3816720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10628	NC_016822	ATC	2	6	3816746	3816751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10629	NC_016822	GGAT	2	8	3816866	3816873	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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10631	NC_016822	T	6	6	3816931	3816936	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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