MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shigella sonnei 53G

Total Repeats: 14019

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10002	NC_016822	ATT	2	6	3585381	3585386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10003	NC_016822	AAAG	2	8	3585396	3585403	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
10004	NC_016822	TGC	2	6	3585422	3585427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10005	NC_016822	ATG	2	6	3585447	3585452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10006	NC_016822	CCT	2	6	3585497	3585502	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10007	NC_016822	A	6	6	3586201	3586206	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10008	NC_016822	TGC	2	6	3586224	3586229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10009	NC_016822	ATG	2	6	3586249	3586254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10010	NC_016822	A	6	6	3587026	3587031	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10011	NC_016822	AGG	2	6	3587048	3587053	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10012	NC_016822	ATTA	2	8	3587625	3587632	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10013	NC_016822	AGA	2	6	3587651	3587656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10014	NC_016822	ATA	2	6	3587683	3587688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10015	NC_016822	TTC	2	6	3587708	3587713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10016	NC_016822	AG	3	6	3587784	3587789	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10017	NC_016822	ATA	2	6	3587831	3587836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10018	NC_016822	CTT	2	6	3587838	3587843	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10019	NC_016822	TAAT	2	8	3587854	3587861	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10020	NC_016822	ATTC	2	8	3587871	3587878	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10021	NC_016822	CAA	2	6	3588062	3588067	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10022	NC_016822	CCG	2	6	3588076	3588081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10023	NC_016822	TTA	2	6	3588089	3588094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10024	NC_016822	CTTT	2	8	3588126	3588133	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
10025	NC_016822	TCAT	2	8	3588155	3588162	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10026	NC_016822	CCG	2	6	3588189	3588194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10027	NC_016822	CTTT	2	8	3588239	3588246	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
10028	NC_016822	CGT	2	6	3588256	3588261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10029	NC_016822	TCAT	2	8	3588268	3588275	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10030	NC_016822	CCG	2	6	3588302	3588307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10031	NC_016822	T	6	6	3588314	3588319	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10032	NC_016822	CTTT	2	8	3588352	3588359	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
10033	NC_016822	CGT	2	6	3588369	3588374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10035	NC_016822	CTC	2	6	3588396	3588401	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10036	NC_016822	CCG	2	6	3588415	3588420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10037	NC_016822	TCAT	2	8	3588482	3588489	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10038	NC_016822	AGC	2	6	3588517	3588522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10039	NC_016822	CG	3	6	3588612	3588617	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10040	NC_016822	CGG	2	6	3588672	3588677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10041	NC_016822	CT	3	6	3588682	3588687	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10042	NC_016822	C	7	7	3588708	3588714	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10043	NC_016822	TCC	2	6	3588754	3588759	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10044	NC_016822	GAC	3	9	3588784	3588792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10045	NC_016822	GCG	2	6	3588796	3588801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10046	NC_016822	GC	3	6	3588820	3588825	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10047	NC_016822	GC	3	6	3588840	3588845	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10048	NC_016822	ACG	2	6	3590084	3590089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10049	NC_016822	TC	3	6	3590992	3590997	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10050	NC_016822	TTG	2	6	3590998	3591003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10051	NC_016822	TTTA	2	8	3593134	3593141	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10052	NC_016822	TAT	3	9	3593165	3593173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10053	NC_016822	TTAT	2	8	3593184	3593191	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10054	NC_016822	TTTA	2	8	3593196	3593203	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10055	NC_016822	AGC	2	6	3593238	3593243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10056	NC_016822	AAT	3	9	3593249	3593257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10057	NC_016822	ATT	2	6	3593296	3593301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10058	NC_016822	GC	3	6	3593324	3593329	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10059	NC_016822	TTACC	2	10	3593349	3593358	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
10060	NC_016822	GGC	2	6	3593360	3593365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10061	NC_016822	ATTT	2	8	3593446	3593453	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10062	NC_016822	TAA	2	6	3593478	3593483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10063	NC_016822	CTGG	2	8	3593487	3593494	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10064	NC_016822	TAA	2	6	3595153	3595158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10065	NC_016822	TGCATT	2	12	3595159	3595170	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10066	NC_016822	CAT	2	6	3596730	3596735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10067	NC_016822	A	6	6	3597272	3597277	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10068	NC_016822	TCA	2	6	3597284	3597289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10069	NC_016822	A	7	7	3599815	3599821	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10070	NC_016822	TTG	2	6	3599851	3599856	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10071	NC_016822	CCT	2	6	3599879	3599884	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10072	NC_016822	AGG	2	6	3599886	3599891	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10073	NC_016822	CAG	2	6	3599928	3599933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10074	NC_016822	TGA	2	6	3599940	3599945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10075	NC_016822	CAGA	2	8	3599959	3599966	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10076	NC_016822	GAT	2	6	3600081	3600086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10077	NC_016822	AGA	2	6	3602385	3602390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10078	NC_016822	AACGC	2	10	3602406	3602415	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
10079	NC_016822	GTC	2	6	3603290	3603295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10080	NC_016822	A	7	7	3603327	3603333	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10081	NC_016822	CGC	2	6	3607020	3607025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10082	NC_016822	TG	3	6	3608881	3608886	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10083	NC_016822	CAA	2	6	3608906	3608911	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10084	NC_016822	GGA	2	6	3608915	3608920	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10085	NC_016822	TGC	2	6	3609866	3609871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10086	NC_016822	CAA	2	6	3611245	3611250	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10087	NC_016822	CAA	2	6	3611296	3611301	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10088	NC_016822	TGC	2	6	3611315	3611320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10089	NC_016822	ACC	2	6	3611322	3611327	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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10091	NC_016822	TGC	2	6	3613350	3613355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10093	NC_016822	CT	3	6	3613408	3613413	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10094	NC_016822	ATT	2	6	3613435	3613440	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10095	NC_016822	AAC	2	6	3613462	3613467	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10096	NC_016822	ACT	2	6	3613472	3613477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10097	NC_016822	AAGCG	2	10	3614590	3614599	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
10098	NC_016822	GCA	2	6	3614617	3614622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10099	NC_016822	TC	3	6	3615900	3615905	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10100	NC_016822	GTT	2	6	3615928	3615933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10101	NC_016822	A	7	7	3615973	3615979	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10102	NC_016822	TA	3	6	3616005	3616010	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10103	NC_016822	GTA	2	6	3617936	3617941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10105	NC_016822	TCA	2	6	3617980	3617985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10106	NC_016822	AAC	3	9	3618047	3618055	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10107	NC_016822	A	6	6	3618084	3618089	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10108	NC_016822	TGAA	2	8	3619023	3619030	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10109	NC_016822	C	6	6	3619076	3619081	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10110	NC_016822	CTTTCT	2	12	3621253	3621264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10111	NC_016822	TCT	2	6	3621301	3621306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10112	NC_016822	CG	3	6	3621370	3621375	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10113	NC_016822	TCAT	2	8	3621394	3621401	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10114	NC_016822	CAA	2	6	3621404	3621409	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10115	NC_016822	TGC	2	6	3621430	3621435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10116	NC_016822	A	6	6	3621446	3621451	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10117	NC_016822	TA	3	6	3621775	3621780	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10118	NC_016822	A	6	6	3623270	3623275	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10119	NC_016822	AATT	2	8	3623298	3623305	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10120	NC_016822	GCG	2	6	3623377	3623382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10121	NC_016822	TTCC	2	8	3626094	3626101	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10122	NC_016822	A	7	7	3628099	3628105	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10123	NC_016822	A	6	6	3628141	3628146	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10124	NC_016822	TA	3	6	3628166	3628171	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10125	NC_016822	T	6	6	3628220	3628225	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10126	NC_016822	CGA	2	6	3628312	3628317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10127	NC_016822	CGA	2	6	3628335	3628340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10128	NC_016822	GCT	2	6	3628349	3628354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10130	NC_016822	CTG	2	6	3628412	3628417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10263	NC_016822	ATAC	2	8	3691562	3691569	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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