MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shigella sonnei 53G

Total Repeats: 14019

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8501	NC_016822	GGA	2	6	3007508	3007513	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8502	NC_016822	C	6	6	3007518	3007523	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
8503	NC_016822	TCA	2	6	3007558	3007563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8504	NC_016822	AC	5	10	3007637	3007646	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8505	NC_016822	GCT	2	6	3007662	3007667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8506	NC_016822	CGC	2	6	3007679	3007684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8507	NC_016822	TTTC	2	8	3007945	3007952	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8508	NC_016822	TCA	2	6	3007956	3007961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8509	NC_016822	GA	3	6	3007979	3007984	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8510	NC_016822	AAC	2	6	3007991	3007996	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8511	NC_016822	GTT	2	6	3008001	3008006	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8512	NC_016822	TCAC	2	8	3008103	3008110	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
8513	NC_016822	CCG	2	6	3008154	3008159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8514	NC_016822	TG	3	6	3008250	3008255	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8515	NC_016822	CTT	2	6	3008272	3008277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8516	NC_016822	TAAGG	2	10	3008278	3008287	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
8517	NC_016822	CTAC	2	8	3008383	3008390	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
8518	NC_016822	GT	3	6	3008426	3008431	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8519	NC_016822	ACG	2	6	3008527	3008532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8520	NC_016822	GT	3	6	3008595	3008600	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8521	NC_016822	ATG	2	6	3008620	3008625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8522	NC_016822	TCC	2	6	3008646	3008651	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8523	NC_016822	CCGG	2	8	3008682	3008689	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8524	NC_016822	CAA	2	6	3008698	3008703	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8525	NC_016822	GAC	2	6	3008759	3008764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8526	NC_016822	GCA	2	6	3008771	3008776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8527	NC_016822	TTC	2	6	3008847	3008852	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8528	NC_016822	GCC	2	6	3009090	3009095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8529	NC_016822	TCC	2	6	3009110	3009115	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8530	NC_016822	C	6	6	3009154	3009159	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
8531	NC_016822	TGCG	2	8	3009242	3009249	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8532	NC_016822	GCT	2	6	3009300	3009305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8533	NC_016822	CTT	2	6	3009325	3009330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8534	NC_016822	TCC	2	6	3009374	3009379	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8535	NC_016822	CTT	2	6	3009409	3009414	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8536	NC_016822	CTG	2	6	3009468	3009473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8537	NC_016822	TCG	2	6	3009543	3009548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8538	NC_016822	CTA	2	6	3009571	3009576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8539	NC_016822	AGT	2	6	3009668	3009673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8540	NC_016822	GCC	2	6	3009782	3009787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8541	NC_016822	CA	3	6	3009936	3009941	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8542	NC_016822	CGCTT	2	10	3009973	3009982	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
8543	NC_016822	GCG	2	6	3009990	3009995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8544	NC_016822	ATA	2	6	3010006	3010011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8545	NC_016822	ATTT	2	8	3010036	3010043	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8546	NC_016822	CCG	2	6	3010076	3010081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8547	NC_016822	CGG	2	6	3010085	3010090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8548	NC_016822	GTT	2	6	3010101	3010106	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8549	NC_016822	GTG	2	6	3010115	3010120	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8550	NC_016822	CTC	2	6	3012843	3012848	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8551	NC_016822	ATT	2	6	3012898	3012903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8552	NC_016822	GAAAA	2	10	3012928	3012937	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
8553	NC_016822	CTT	2	6	3014687	3014692	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8554	NC_016822	GGT	2	6	3017019	3017024	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8555	NC_016822	TCCT	2	8	3017490	3017497	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8556	NC_016822	ACA	2	6	3017844	3017849	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8557	NC_016822	TTA	2	6	3017898	3017903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8558	NC_016822	CAGA	2	8	3017927	3017934	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8559	NC_016822	TGA	2	6	3017943	3017948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8560	NC_016822	A	6	6	3018739	3018744	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8561	NC_016822	G	6	6	3020953	3020958	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
8562	NC_016822	GAG	2	6	3021006	3021011	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8563	NC_016822	T	7	7	3022973	3022979	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8564	NC_016822	GTG	2	6	3022980	3022985	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8565	NC_016822	GTTT	2	8	3023027	3023034	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
8566	NC_016822	GAG	2	6	3023108	3023113	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8567	NC_016822	TTA	2	6	3023127	3023132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8568	NC_016822	TGC	2	6	3023151	3023156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8569	NC_016822	ATG	2	6	3023176	3023181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8570	NC_016822	CTT	2	6	3024024	3024029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8571	NC_016822	GCC	2	6	3024303	3024308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8572	NC_016822	T	7	7	3024321	3024327	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8573	NC_016822	CAT	2	6	3029052	3029057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8574	NC_016822	GCA	2	6	3029077	3029082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8575	NC_016822	AAG	2	6	3029122	3029127	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8576	NC_016822	A	6	6	3031216	3031221	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8577	NC_016822	AAT	2	6	3031251	3031256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8578	NC_016822	ATG	2	6	3031275	3031280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8579	NC_016822	T	6	6	3031290	3031295	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8580	NC_016822	GAA	2	6	3031319	3031324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8581	NC_016822	AGA	2	6	3031326	3031331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8582	NC_016822	CTGA	2	8	3031798	3031805	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8583	NC_016822	T	6	6	3033691	3033696	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8584	NC_016822	GTG	2	6	3033814	3033819	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8585	NC_016822	TAC	2	6	3033866	3033871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8586	NC_016822	AGTC	2	8	3033878	3033885	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8587	NC_016822	CGGA	2	8	3033907	3033914	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8588	NC_016822	CAGG	2	8	3033961	3033968	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8589	NC_016822	CT	3	6	3033998	3034003	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8590	NC_016822	GA	3	6	3034033	3034038	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8591	NC_016822	TTA	2	6	3034053	3034058	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8592	NC_016822	GCT	2	6	3034060	3034065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8593	NC_016822	TCG	2	6	3034078	3034083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8594	NC_016822	T	6	6	3034094	3034099	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8595	NC_016822	CGC	2	6	3034338	3034343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8596	NC_016822	GAGG	2	8	3034348	3034355	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
8597	NC_016822	AAT	2	6	3034374	3034379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8598	NC_016822	CGT	2	6	3034878	3034883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8599	NC_016822	ATC	2	6	3034886	3034891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8600	NC_016822	T	8	8	3034986	3034993	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8601	NC_016822	CAG	2	6	3034995	3035000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8602	NC_016822	ATT	2	6	3035011	3035016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8603	NC_016822	TTG	2	6	3035027	3035032	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8604	NC_016822	A	6	6	3035770	3035775	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8605	NC_016822	T	6	6	3037230	3037235	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8606	NC_016822	TGATT	2	10	3037605	3037614	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
8607	NC_016822	GAT	2	6	3037658	3037663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8608	NC_016822	TCA	2	6	3037674	3037679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8609	NC_016822	A	6	6	3037743	3037748	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8610	NC_016822	TA	3	6	3039470	3039475	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8611	NC_016822	TTG	2	6	3040390	3040395	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8612	NC_016822	TGA	2	6	3040403	3040408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8613	NC_016822	ATA	2	6	3040449	3040454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8614	NC_016822	A	7	7	3040479	3040485	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8615	NC_016822	TAA	2	6	3041105	3041110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8616	NC_016822	ACC	2	6	3042381	3042386	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8617	NC_016822	ATG	2	6	3042387	3042392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8618	NC_016822	AAT	2	6	3042398	3042403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8619	NC_016822	GTA	3	9	3042411	3042419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8620	NC_016822	AAGA	2	8	3043270	3043277	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
8621	NC_016822	GCT	2	6	3043302	3043307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8622	NC_016822	AAC	2	6	3043321	3043326	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8623	NC_016822	TGA	2	6	3043361	3043366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8624	NC_016822	GA	3	6	3043404	3043409	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8625	NC_016822	GC	3	6	3044851	3044856	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8626	NC_016822	CCG	2	6	3044880	3044885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8627	NC_016822	CAG	2	6	3044897	3044902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8628	NC_016822	GTT	2	6	3044995	3045000	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8629	NC_016822	CA	3	6	3045006	3045011	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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8631	NC_016822	ACC	2	6	3045838	3045843	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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