MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shigella sonnei 53G

Total Repeats: 14019

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_016822	TAA	2	6	2456132	2456137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7002	NC_016822	ACT	2	6	2456149	2456154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7003	NC_016822	CAT	2	6	2468987	2468992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7004	NC_016822	TAAT	2	8	2469033	2469040	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7005	NC_016822	TAA	2	6	2469307	2469312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7006	NC_016822	TGA	2	6	2469316	2469321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7007	NC_016822	CAT	2	6	2469341	2469346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7008	NC_016822	GAA	2	6	2469365	2469370	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7009	NC_016822	CTG	2	6	2469874	2469879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7010	NC_016822	CGC	2	6	2469917	2469922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7011	NC_016822	CGC	2	6	2470030	2470035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7012	NC_016822	AAC	2	6	2471900	2471905	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7013	NC_016822	AAT	2	6	2471911	2471916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7014	NC_016822	ATTA	2	8	2471962	2471969	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7015	NC_016822	TTA	2	6	2471975	2471980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7016	NC_016822	GGC	2	6	2472011	2472016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7017	NC_016822	CGT	2	6	2472035	2472040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7018	NC_016822	CG	3	6	2473735	2473740	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7019	NC_016822	AAT	3	9	2473747	2473755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7020	NC_016822	CAA	2	6	2475537	2475542	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7021	NC_016822	A	7	7	2476647	2476653	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7022	NC_016822	A	6	6	2476678	2476683	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7023	NC_016822	TTA	2	6	2477827	2477832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7024	NC_016822	T	6	6	2477859	2477864	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7025	NC_016822	AAT	2	6	2477930	2477935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7026	NC_016822	ATT	2	6	2478024	2478029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7027	NC_016822	CAT	2	6	2478796	2478801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7028	NC_016822	GCA	2	6	2478821	2478826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7029	NC_016822	AAT	3	9	2478840	2478848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7030	NC_016822	CAAAA	2	10	2478900	2478909	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
7031	NC_016822	ATC	2	6	2478940	2478945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7032	NC_016822	TTTA	2	8	2478952	2478959	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7033	NC_016822	TCAT	2	8	2478966	2478973	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7034	NC_016822	T	8	8	2479022	2479029	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7035	NC_016822	CTT	2	6	2479033	2479038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7036	NC_016822	AC	3	6	2479040	2479045	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7037	NC_016822	ATT	2	6	2479050	2479055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7038	NC_016822	AAT	2	6	2479101	2479106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7039	NC_016822	AATT	2	8	2479146	2479153	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7040	NC_016822	GAT	2	6	2479222	2479227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7041	NC_016822	ATC	2	6	2479250	2479255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7042	NC_016822	GCG	2	6	2482742	2482747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7043	NC_016822	ATT	2	6	2482776	2482781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7044	NC_016822	TC	3	6	2485802	2485807	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7045	NC_016822	CCG	2	6	2485827	2485832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7046	NC_016822	ATC	2	6	2485837	2485842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7047	NC_016822	CCG	2	6	2487869	2487874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7048	NC_016822	AAT	2	6	2490745	2490750	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7049	NC_016822	A	6	6	2490814	2490819	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7050	NC_016822	TGA	2	6	2490832	2490837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7051	NC_016822	CTT	2	6	2490857	2490862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7052	NC_016822	CAT	2	6	2490878	2490883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7053	NC_016822	TTG	2	6	2490985	2490990	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7054	NC_016822	CGT	2	6	2491100	2491105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7055	NC_016822	TGG	2	6	2491145	2491150	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7056	NC_016822	TGG	2	6	2491160	2491165	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7057	NC_016822	CGT	2	6	2491193	2491198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7058	NC_016822	GACACT	2	12	2491214	2491225	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
7059	NC_016822	GCT	2	6	2491241	2491246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7060	NC_016822	GC	3	6	2491259	2491264	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7061	NC_016822	AC	3	6	2491297	2491302	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7062	NC_016822	CAT	2	6	2491454	2491459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7063	NC_016822	ACAG	2	8	2493461	2493468	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7064	NC_016822	CAT	2	6	2499618	2499623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7065	NC_016822	T	7	7	2501204	2501210	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7066	NC_016822	CAC	2	6	2501211	2501216	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7067	NC_016822	AGCC	2	8	2501240	2501247	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7068	NC_016822	T	6	6	2501249	2501254	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7069	NC_016822	TTCAA	2	10	2501320	2501329	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
7070	NC_016822	GAA	2	6	2501357	2501362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7071	NC_016822	CGC	2	6	2504958	2504963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7072	NC_016822	CAT	2	6	2510093	2510098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7073	NC_016822	TA	3	6	2510101	2510106	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7074	NC_016822	TCTT	2	8	2510144	2510151	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
7075	NC_016822	TTA	2	6	2510188	2510193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7076	NC_016822	TGA	2	6	2510196	2510201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7077	NC_016822	ATA	2	6	2510202	2510207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7078	NC_016822	TAA	2	6	2510229	2510234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7079	NC_016822	AAT	2	6	2510278	2510283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7080	NC_016822	TATAA	2	10	2510289	2510298	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
7081	NC_016822	AAC	2	6	2510345	2510350	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7082	NC_016822	CAA	2	6	2510362	2510367	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7083	NC_016822	TA	3	6	2510383	2510388	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7084	NC_016822	TGA	2	6	2510417	2510422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7085	NC_016822	TAA	2	6	2510464	2510469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7086	NC_016822	TCCT	2	8	2510604	2510611	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7087	NC_016822	TA	4	8	2510688	2510695	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7088	NC_016822	AGC	2	6	2510704	2510709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7089	NC_016822	TAC	2	6	2510716	2510721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7090	NC_016822	GCG	2	6	2513079	2513084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7091	NC_016822	GCG	2	6	2513247	2513252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7092	NC_016822	AC	3	6	2513288	2513293	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7093	NC_016822	GTA	2	6	2514743	2514748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7094	NC_016822	TTA	2	6	2515403	2515408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7095	NC_016822	GGT	2	6	2515424	2515429	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7096	NC_016822	CTA	2	6	2515483	2515488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7097	NC_016822	CCA	2	6	2515530	2515535	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7098	NC_016822	CAG	2	6	2515559	2515564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7099	NC_016822	TTAT	2	8	2518310	2518317	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7100	NC_016822	GA	3	6	2518338	2518343	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7101	NC_016822	TAAAT	2	10	2518387	2518396	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
7102	NC_016822	CA	3	6	2518408	2518413	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7103	NC_016822	TTA	2	6	2518414	2518419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7104	NC_016822	A	6	6	2518532	2518537	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7105	NC_016822	TCA	2	6	2522786	2522791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7106	NC_016822	CTC	2	6	2528005	2528010	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7107	NC_016822	T	6	6	2528061	2528066	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7108	NC_016822	ACA	2	6	2528077	2528082	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7109	NC_016822	GTA	2	6	2529403	2529408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7110	NC_016822	A	6	6	2530073	2530078	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7111	NC_016822	CTT	2	6	2530108	2530113	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7112	NC_016822	AAT	2	6	2530115	2530120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7113	NC_016822	A	6	6	2530130	2530135	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7114	NC_016822	AC	3	6	2530139	2530144	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7115	NC_016822	AC	3	6	2530154	2530159	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7116	NC_016822	ATA	3	9	2530164	2530172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7117	NC_016822	ATC	2	6	2530182	2530187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7118	NC_016822	TTTA	2	8	2530248	2530255	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7119	NC_016822	ATG	2	6	2530698	2530703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7120	NC_016822	A	6	6	2531487	2531492	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7121	NC_016822	GTTAA	2	10	2531535	2531544	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
7122	NC_016822	ACA	2	6	2531586	2531591	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7123	NC_016822	GGAA	2	8	2531631	2531638	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7124	NC_016822	TAT	2	6	2539312	2539317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7125	NC_016822	AATGG	2	10	2539325	2539334	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
7126	NC_016822	ATT	2	6	2545028	2545033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7127	NC_016822	ATG	2	6	2545048	2545053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7128	NC_016822	TAC	2	6	2546399	2546404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7129	NC_016822	A	8	8	2546405	2546412	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7130	NC_016822	ACTA	2	8	2546773	2546780	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7131	NC_016822	GTT	2	6	2546790	2546795	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7264	NC_016822	GCAG	2	8	2591059	2591066	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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7393	NC_016822	GTCAG	2	10	2625499	2625508	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
7394	NC_016822	ACG	2	6	2625719	2625724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7395	NC_016822	AAAC	2	8	2625726	2625733	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
7396	NC_016822	ACA	2	6	2625759	2625764	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7397	NC_016822	CTG	2	6	2625775	2625780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7398	NC_016822	GTT	2	6	2625781	2625786	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7399	NC_016822	CAGC	2	8	2625790	2625797	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7400	NC_016822	CAT	2	6	2625930	2625935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7401	NC_016822	ACGC	2	8	2625969	2625976	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7402	NC_016822	GAT	3	9	2626027	2626035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7420	NC_016822	T	6	6	2626887	2626892	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7425	NC_016822	ATCA	2	8	2627708	2627715	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7426	NC_016822	TCAA	2	8	2627746	2627753	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7427	NC_016822	ATG	2	6	2627798	2627803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7430	NC_016822	ACG	2	6	2627912	2627917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7432	NC_016822	ACA	2	6	2628073	2628078	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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