MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shigella sonnei 53G

Total Repeats: 14019

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_016822	A	6	6	1941794	1941799	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5502	NC_016822	ATAAAA	2	12	1941817	1941828	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5503	NC_016822	AGT	2	6	1941852	1941857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5504	NC_016822	TGA	2	6	1941860	1941865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5505	NC_016822	CGC	2	6	1941898	1941903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5506	NC_016822	CCACC	2	10	1941921	1941930	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
5507	NC_016822	GGA	2	6	1941932	1941937	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5508	NC_016822	ATGA	2	8	1941984	1941991	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5509	NC_016822	TTC	2	6	1942053	1942058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5510	NC_016822	ATT	2	6	1942141	1942146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5511	NC_016822	CGA	2	6	1942211	1942216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5512	NC_016822	ATG	2	6	1942225	1942230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5513	NC_016822	AGTTA	2	10	1942270	1942279	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
5514	NC_016822	GAAAA	2	10	1943777	1943786	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
5515	NC_016822	A	7	7	1943783	1943789	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5516	NC_016822	AT	3	6	1943809	1943814	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5517	NC_016822	TCCT	2	8	1943857	1943864	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5518	NC_016822	ACA	2	6	1944211	1944216	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5519	NC_016822	TTA	2	6	1944265	1944270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5520	NC_016822	TGT	2	6	1945469	1945474	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5521	NC_016822	CAGA	2	8	1945546	1945553	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5522	NC_016822	TGA	2	6	1945562	1945567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5523	NC_016822	CAA	2	6	1946356	1946361	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5524	NC_016822	ACC	2	6	1946362	1946367	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5525	NC_016822	ATGA	2	8	1946399	1946406	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5526	NC_016822	A	7	7	1946448	1946454	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5527	NC_016822	TCAT	2	8	1946460	1946467	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5528	NC_016822	CAT	2	6	1946502	1946507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5529	NC_016822	CAT	2	6	1946556	1946561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5530	NC_016822	CTGC	2	8	1946661	1946668	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5531	NC_016822	CAC	2	6	1946690	1946695	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5532	NC_016822	GTG	2	6	1946755	1946760	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5533	NC_016822	TGG	2	6	1946763	1946768	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5534	NC_016822	TCGC	2	8	1946808	1946815	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5535	NC_016822	AAT	2	6	1946848	1946853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5536	NC_016822	TCA	2	6	1946863	1946868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5537	NC_016822	ACC	2	6	1946887	1946892	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5538	NC_016822	A	7	7	1946928	1946934	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5539	NC_016822	GTA	2	6	1948515	1948520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5540	NC_016822	TGC	2	6	1948810	1948815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5541	NC_016822	ATG	2	6	1948835	1948840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5542	NC_016822	A	7	7	1949573	1949579	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5543	NC_016822	CCG	2	6	1949580	1949585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5544	NC_016822	TCTG	2	8	1949941	1949948	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5545	NC_016822	GCA	2	6	1949990	1949995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5546	NC_016822	T	6	6	1950025	1950030	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5547	NC_016822	AAC	2	6	1950116	1950121	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5548	NC_016822	CTGTTT	2	12	1950137	1950148	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5549	NC_016822	GCA	2	6	1950770	1950775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5550	NC_016822	TTC	2	6	1950793	1950798	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5551	NC_016822	TCA	2	6	1950803	1950808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5552	NC_016822	GTC	2	6	1950856	1950861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5553	NC_016822	AT	3	6	1950970	1950975	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5554	NC_016822	TCCA	2	8	1951044	1951051	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5555	NC_016822	GCA	2	6	1951073	1951078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5556	NC_016822	CAA	2	6	1951155	1951160	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5557	NC_016822	CCG	2	6	1951226	1951231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5558	NC_016822	ATC	2	6	1951246	1951251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5559	NC_016822	AGCC	2	8	1951267	1951274	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5560	NC_016822	TGA	2	6	1951915	1951920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5561	NC_016822	ACCGC	2	10	1952158	1952167	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
5562	NC_016822	TGC	2	6	1952326	1952331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5563	NC_016822	ATG	2	6	1952351	1952356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5564	NC_016822	TCT	2	6	1953095	1953100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5565	NC_016822	CTC	2	6	1953116	1953121	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5566	NC_016822	CCT	2	6	1953183	1953188	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5567	NC_016822	TCCT	2	8	1953254	1953261	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5568	NC_016822	ACA	2	6	1953608	1953613	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5569	NC_016822	TTA	2	6	1953662	1953667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5570	NC_016822	CAGA	2	8	1953691	1953698	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5571	NC_016822	TGA	2	6	1953707	1953712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5572	NC_016822	TCC	2	6	1954865	1954870	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5573	NC_016822	AC	3	6	1957528	1957533	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5574	NC_016822	TA	3	6	1957541	1957546	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5575	NC_016822	T	6	6	1958067	1958072	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5576	NC_016822	CAT	3	9	1958077	1958085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5577	NC_016822	TAA	2	6	1958140	1958145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5578	NC_016822	AAC	2	6	1958155	1958160	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5579	NC_016822	CCA	2	6	1958164	1958169	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5580	NC_016822	AGCC	2	8	1958222	1958229	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5581	NC_016822	GTT	2	6	1958253	1958258	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5582	NC_016822	TAG	2	6	1958538	1958543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5583	NC_016822	CAAA	2	8	1959865	1959872	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5584	NC_016822	CG	3	6	1959879	1959884	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5585	NC_016822	TCCG	2	8	1959966	1959973	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5586	NC_016822	AT	3	6	1960033	1960038	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5587	NC_016822	TA	3	6	1960073	1960078	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5588	NC_016822	TG	3	6	1960125	1960130	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5589	NC_016822	ACC	2	6	1960148	1960153	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5590	NC_016822	GGT	2	6	1960164	1960169	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5591	NC_016822	TTAAAT	2	12	1960234	1960245	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5592	NC_016822	TG	3	6	1960284	1960289	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5593	NC_016822	GGC	2	6	1960301	1960306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5594	NC_016822	GCTG	2	8	1960319	1960326	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5595	NC_016822	CAA	2	6	1960471	1960476	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5596	NC_016822	TGA	2	6	1960489	1960494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5597	NC_016822	TAA	2	6	1961751	1961756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5598	NC_016822	TTAA	2	8	1961807	1961814	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5599	NC_016822	GAA	2	6	1962136	1962141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5600	NC_016822	TCA	2	6	1962156	1962161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5601	NC_016822	A	6	6	1962192	1962197	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5602	NC_016822	TCCT	2	8	1962258	1962265	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5603	NC_016822	ACA	2	6	1962612	1962617	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5604	NC_016822	TTA	2	6	1962666	1962671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5605	NC_016822	CAGA	2	8	1962695	1962702	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5606	NC_016822	TGA	2	6	1962711	1962716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5607	NC_016822	TCA	2	6	1965817	1965822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5608	NC_016822	TCTG	2	8	1965831	1965838	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5609	NC_016822	TAA	2	6	1965862	1965867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5610	NC_016822	TTG	2	6	1965915	1965920	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5611	NC_016822	AC	3	6	1966791	1966796	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5612	NC_016822	ATT	2	6	1968137	1968142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5613	NC_016822	AAT	2	6	1968143	1968148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5614	NC_016822	TCCT	2	8	1969193	1969200	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5615	NC_016822	ACA	2	6	1969547	1969552	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5616	NC_016822	TTA	2	6	1969601	1969606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5617	NC_016822	CAGA	2	8	1969630	1969637	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5618	NC_016822	TGA	2	6	1969646	1969651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5619	NC_016822	AGA	2	6	1970442	1970447	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5620	NC_016822	CAT	2	6	1970562	1970567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5621	NC_016822	ATC	2	6	1970590	1970595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5622	NC_016822	GT	3	6	1970649	1970654	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5623	NC_016822	TTA	2	6	1970672	1970677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5624	NC_016822	GCA	2	6	1970709	1970714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5625	NC_016822	CGC	2	6	1970733	1970738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5626	NC_016822	CTG	2	6	1970771	1970776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5627	NC_016822	TTC	2	6	1973494	1973499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5628	NC_016822	GTG	2	6	1973505	1973510	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5629	NC_016822	GATCG	2	10	1973536	1973545	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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5631	NC_016822	GTC	2	6	1973606	1973611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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