MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shigella sonnei 53G

Total Repeats: 14019

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_016822	AG	3	6	1785884	1785889	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5002	NC_016822	TA	3	6	1785904	1785909	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_016822	TGTA	2	8	1785932	1785939	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_016822	CAT	2	6	1785945	1785950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5005	NC_016822	TAA	2	6	1785966	1785971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_016822	CA	3	6	1785980	1785985	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5007	NC_016822	CCT	2	6	1788280	1788285	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5008	NC_016822	TCT	2	6	1788290	1788295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5009	NC_016822	CAG	2	6	1788309	1788314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5010	NC_016822	TAT	2	6	1788332	1788337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5011	NC_016822	ATTAA	2	10	1788358	1788367	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5012	NC_016822	CA	3	6	1788370	1788375	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5013	NC_016822	TAAA	2	8	1788505	1788512	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5014	NC_016822	A	6	6	1788753	1788758	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5015	NC_016822	AGT	2	6	1789570	1789575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5016	NC_016822	CACG	2	8	1789580	1789587	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5017	NC_016822	GTT	2	6	1789628	1789633	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5018	NC_016822	AT	3	6	1789642	1789647	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5019	NC_016822	AAAT	2	8	1789654	1789661	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5020	NC_016822	CATC	2	8	1789668	1789675	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5021	NC_016822	ATT	2	6	1789708	1789713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5022	NC_016822	AAT	2	6	1789749	1789754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5023	NC_016822	TTA	2	6	1789755	1789760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5024	NC_016822	GTT	2	6	1789776	1789781	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5025	NC_016822	T	7	7	1789847	1789853	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5026	NC_016822	AAG	2	6	1789941	1789946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5027	NC_016822	GCG	2	6	1791652	1791657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5028	NC_016822	CCG	2	6	1791665	1791670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5029	NC_016822	CT	3	6	1792854	1792859	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5030	NC_016822	CCT	2	6	1792877	1792882	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5031	NC_016822	TCA	3	9	1792933	1792941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5032	NC_016822	CATAAC	3	18	1793013	1793030	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5033	NC_016822	TA	3	6	1793051	1793056	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5034	NC_016822	TAAA	2	8	1793079	1793086	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5035	NC_016822	TCA	2	6	1793089	1793094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5036	NC_016822	CAAT	2	8	1793129	1793136	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5037	NC_016822	CTG	2	6	1794845	1794850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5038	NC_016822	ATAA	2	8	1794860	1794867	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5039	NC_016822	TAA	2	6	1800139	1800144	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5040	NC_016822	ATA	2	6	1800164	1800169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5041	NC_016822	AGG	2	6	1800220	1800225	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_016822	ACC	3	9	1800264	1800272	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5043	NC_016822	ATATT	2	10	1800283	1800292	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_016822	A	6	6	1800304	1800309	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5045	NC_016822	TAT	2	6	1800310	1800315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5046	NC_016822	ATAA	2	8	1800333	1800340	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5047	NC_016822	T	6	6	1800405	1800410	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5048	NC_016822	TAACGG	2	12	1801850	1801861	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5049	NC_016822	TAA	2	6	1805126	1805131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5050	NC_016822	TATGAA	2	12	1805137	1805148	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5051	NC_016822	AAT	2	6	1805178	1805183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5052	NC_016822	GAA	2	6	1805205	1805210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5053	NC_016822	TTCC	2	8	1809249	1809256	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5054	NC_016822	A	6	6	1809315	1809320	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5055	NC_016822	GGCAT	2	10	1809355	1809364	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
5056	NC_016822	GCA	2	6	1809387	1809392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5057	NC_016822	TTA	2	6	1814470	1814475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5058	NC_016822	CCG	2	6	1814574	1814579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5059	NC_016822	TCG	2	6	1814597	1814602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5060	NC_016822	TGC	2	6	1814651	1814656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5061	NC_016822	AAC	2	6	1815398	1815403	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5062	NC_016822	TTAAA	2	10	1815986	1815995	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5063	NC_016822	AT	4	8	1816018	1816025	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5064	NC_016822	ATCAAT	2	12	1816041	1816052	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5065	NC_016822	CAC	2	6	1816058	1816063	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5066	NC_016822	AAT	3	9	1816064	1816072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5067	NC_016822	ATATCA	2	12	1816075	1816086	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5068	NC_016822	ATC	2	6	1816105	1816110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5069	NC_016822	AAC	2	6	1816127	1816132	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5070	NC_016822	TTC	2	6	1816484	1816489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5071	NC_016822	TGT	2	6	1816500	1816505	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5072	NC_016822	GAG	2	6	1816528	1816533	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5073	NC_016822	GTTTTT	2	12	1816730	1816741	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5074	NC_016822	GGAT	2	8	1816804	1816811	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5075	NC_016822	A	6	6	1816816	1816821	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5076	NC_016822	GAGT	2	8	1816822	1816829	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5077	NC_016822	TGA	2	6	1818702	1818707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5078	NC_016822	ACG	2	6	1818804	1818809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5079	NC_016822	T	6	6	1823498	1823503	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5080	NC_016822	AAT	2	6	1823588	1823593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5081	NC_016822	ACCT	2	8	1823610	1823617	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5082	NC_016822	CAC	2	6	1823637	1823642	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5083	NC_016822	A	7	7	1823660	1823666	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5084	NC_016822	AG	3	6	1823699	1823704	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5085	NC_016822	AAT	2	6	1824601	1824606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5086	NC_016822	A	6	6	1824655	1824660	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5087	NC_016822	ATAA	2	8	1824719	1824726	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5088	NC_016822	TAT	2	6	1824727	1824732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5089	NC_016822	TGC	2	6	1826006	1826011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5092	NC_016822	TGA	2	6	1826117	1826122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5093	NC_016822	CTG	2	6	1828529	1828534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5094	NC_016822	ATA	2	6	1828545	1828550	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5095	NC_016822	TTA	2	6	1828599	1828604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5096	NC_016822	GCT	2	6	1828670	1828675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5097	NC_016822	AAC	2	6	1828676	1828681	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5098	NC_016822	ACA	2	6	1828746	1828751	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5099	NC_016822	TAA	2	6	1828774	1828779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5100	NC_016822	ATA	2	6	1828808	1828813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5101	NC_016822	T	6	6	1828834	1828839	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5102	NC_016822	GAA	2	6	1828852	1828857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5103	NC_016822	CTA	2	6	1828866	1828871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5104	NC_016822	CTGGC	2	10	1828920	1828929	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
5105	NC_016822	ATATA	2	10	1829024	1829033	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5106	NC_016822	TACT	2	8	1829111	1829118	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5107	NC_016822	TAA	2	6	1829120	1829125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5109	NC_016822	AG	3	6	1829148	1829153	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5110	NC_016822	TCC	2	6	1829184	1829189	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5111	NC_016822	ATC	2	6	1829215	1829220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5113	NC_016822	ATA	2	6	1829250	1829255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5114	NC_016822	GTTA	2	8	1829344	1829351	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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5116	NC_016822	CCT	2	6	1829480	1829485	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5117	NC_016822	T	6	6	1829494	1829499	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5118	NC_016822	TG	3	6	1829509	1829514	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5119	NC_016822	ATTC	2	8	1830973	1830980	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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5121	NC_016822	CGC	2	6	1839613	1839618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5122	NC_016822	A	7	7	1839711	1839717	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5123	NC_016822	CTT	2	6	1839719	1839724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5124	NC_016822	AC	3	6	1840575	1840580	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5125	NC_016822	AAT	2	6	1840620	1840625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5126	NC_016822	ATA	2	6	1841737	1841742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5127	NC_016822	T	6	6	1841760	1841765	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5128	NC_016822	A	6	6	1841823	1841828	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5129	NC_016822	TAA	2	6	1841839	1841844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5130	NC_016822	ATT	2	6	1841877	1841882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5131	NC_016822	CTC	2	6	1841899	1841904	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5132	NC_016822	AAG	2	6	1843071	1843076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5133	NC_016822	A	6	6	1843099	1843104	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5134	NC_016822	TAA	2	6	1843115	1843120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5135	NC_016822	ATT	2	6	1843153	1843158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5136	NC_016822	TGA	2	6	1843179	1843184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5137	NC_016822	CCA	2	6	1843200	1843205	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5138	NC_016822	GCTTAT	2	12	1843217	1843228	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5139	NC_016822	TGA	2	6	1843294	1843299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5140	NC_016822	AT	3	6	1843303	1843308	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5141	NC_016822	ATT	2	6	1843331	1843336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5142	NC_016822	A	6	6	1843343	1843348	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5143	NC_016822	TAA	2	6	1843378	1843383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5144	NC_016822	CCT	2	6	1843384	1843389	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5145	NC_016822	C	6	6	1843586	1843591	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5146	NC_016822	CAT	2	6	1844348	1844353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5149	NC_016822	AGCC	2	8	1844403	1844410	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5150	NC_016822	GTC	2	6	1844436	1844441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5153	NC_016822	GTCAG	2	10	1844500	1844509	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
5154	NC_016822	GTT	2	6	1845824	1845829	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5162	NC_016822	CAT	2	6	1849069	1849074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5172	NC_016822	ATC	2	6	1853831	1853836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5183	NC_016822	CTGT	2	8	1855166	1855173	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5184	NC_016822	T	7	7	1855173	1855179	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5185	NC_016822	GCCA	2	8	1855207	1855214	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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5217	NC_016822	A	6	6	1861827	1861832	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5218	NC_016822	CAA	2	6	1861879	1861884	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5219	NC_016822	AAT	2	6	1861887	1861892	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5220	NC_016822	ATGA	2	8	1861911	1861918	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5221	NC_016822	CGT	2	6	1861985	1861990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5231	NC_016822	ATTT	2	8	1862299	1862306	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5246	NC_016822	ATC	2	6	1866304	1866309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5248	NC_016822	CGTTT	2	10	1866415	1866424	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
5249	NC_016822	TTA	2	6	1866442	1866447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5250	NC_016822	T	6	6	1866480	1866485	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5251	NC_016822	TCCT	2	8	1869011	1869018	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5252	NC_016822	ACA	2	6	1869365	1869370	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5253	NC_016822	TTA	2	6	1869419	1869424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5255	NC_016822	TGA	2	6	1869464	1869469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5257	NC_016822	AAT	2	6	1870631	1870636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5258	NC_016822	ACC	2	6	1870642	1870647	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5259	NC_016822	TGT	2	6	1870654	1870659	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5260	NC_016822	AGC	2	6	1870664	1870669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5262	NC_016822	GGC	2	6	1870730	1870735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5281	NC_016822	AATG	2	8	1874401	1874408	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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5393	NC_016822	TCTG	2	8	1905463	1905470	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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