MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. SL1344

Total Repeats: 13795

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_016810	GC	3	6	1287398	1287403	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3502	NC_016810	AGCC	2	8	1287404	1287411	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3503	NC_016810	TA	3	6	1287429	1287434	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3504	NC_016810	TTC	2	6	1287490	1287495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3505	NC_016810	G	7	7	1287515	1287521	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3506	NC_016810	AT	3	6	1287528	1287533	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3507	NC_016810	AAAT	2	8	1287563	1287570	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3508	NC_016810	A	6	6	1287665	1287670	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3509	NC_016810	AAT	2	6	1287946	1287951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3510	NC_016810	AGT	2	6	1287995	1288000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3511	NC_016810	ATAA	2	8	1288019	1288026	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3512	NC_016810	CCT	2	6	1288297	1288302	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3513	NC_016810	TA	4	8	1288305	1288312	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3514	NC_016810	T	6	6	1288358	1288363	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3515	NC_016810	TAA	3	9	1288388	1288396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3516	NC_016810	T	6	6	1288419	1288424	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3517	NC_016810	GTTA	2	8	1288445	1288452	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3518	NC_016810	T	7	7	1288456	1288462	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3519	NC_016810	TC	3	6	1288474	1288479	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3520	NC_016810	ATTCT	2	10	1288518	1288527	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
3521	NC_016810	TATAA	2	10	1288528	1288537	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3522	NC_016810	TGT	2	6	1288545	1288550	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3524	NC_016810	CAT	2	6	1288604	1288609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3525	NC_016810	TGT	2	6	1288812	1288817	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3527	NC_016810	GTA	2	6	1288945	1288950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3530	NC_016810	ATA	2	6	1289078	1289083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3531	NC_016810	AGT	2	6	1289084	1289089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3533	NC_016810	ATT	2	6	1289113	1289118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3534	NC_016810	TTA	2	6	1289132	1289137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3535	NC_016810	CTT	2	6	1289718	1289723	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3536	NC_016810	CCTG	2	8	1289739	1289746	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3537	NC_016810	TC	3	6	1289752	1289757	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3538	NC_016810	CT	3	6	1289767	1289772	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3539	NC_016810	AGGT	2	8	1289852	1289859	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3540	NC_016810	AGGA	2	8	1289867	1289874	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3541	NC_016810	TCA	2	6	1289946	1289951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3544	NC_016810	T	6	6	1290040	1290045	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3550	NC_016810	TTA	2	6	1290265	1290270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3552	NC_016810	TTA	2	6	1290320	1290325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3555	NC_016810	TAA	2	6	1290699	1290704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3559	NC_016810	TGA	2	6	1290871	1290876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3561	NC_016810	GTA	2	6	1291320	1291325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3562	NC_016810	TAT	2	6	1291362	1291367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3563	NC_016810	TGA	2	6	1291391	1291396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3565	NC_016810	GAA	2	6	1291494	1291499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3570	NC_016810	CAGT	2	8	1291751	1291758	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3571	NC_016810	GCC	2	6	1291797	1291802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3599	NC_016810	ATG	2	6	1295877	1295882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3600	NC_016810	TTCTG	2	10	1295904	1295913	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
3601	NC_016810	T	6	6	1295920	1295925	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3602	NC_016810	AGG	2	6	1295957	1295962	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3603	NC_016810	CTC	2	6	1302142	1302147	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3604	NC_016810	TAA	2	6	1302149	1302154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3605	NC_016810	TTC	2	6	1302500	1302505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3608	NC_016810	TATAA	2	10	1302646	1302655	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3609	NC_016810	ATC	2	6	1302658	1302663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3610	NC_016810	AAGA	2	8	1302669	1302676	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3611	NC_016810	T	7	7	1303381	1303387	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3612	NC_016810	CAAT	2	8	1303411	1303418	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3613	NC_016810	A	6	6	1303421	1303426	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3614	NC_016810	ACT	3	9	1304282	1304290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3620	NC_016810	CCCT	2	8	1305930	1305937	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3621	NC_016810	CCAT	2	8	1305993	1306000	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3622	NC_016810	ACTC	2	8	1306098	1306105	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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3625	NC_016810	TA	3	6	1306141	1306146	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3628	NC_016810	TAA	2	6	1306659	1306664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3629	NC_016810	AGG	2	6	1306693	1306698	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3630	NC_016810	GAG	2	6	1307260	1307265	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3631	NC_016810	GA	3	6	1307358	1307363	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3632	NC_016810	CGT	2	6	1308098	1308103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3633	NC_016810	CGG	2	6	1308107	1308112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3634	NC_016810	TC	3	6	1308384	1308389	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3635	NC_016810	TGA	2	6	1308426	1308431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3672	NC_016810	TTAA	2	8	1316816	1316823	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3673	NC_016810	AAAAT	2	10	1316846	1316855	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3761	NC_016810	GA	3	6	1348489	1348494	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3762	NC_016810	GGT	2	6	1348524	1348529	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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