MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. SL1344

Total Repeats: 13795

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12002	NC_016810	GCGCT	2	10	4233998	4234007	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
12003	NC_016810	CCA	2	6	4234086	4234091	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12004	NC_016810	CA	3	6	4234098	4234103	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12005	NC_016810	CGG	2	6	4234107	4234112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12006	NC_016810	TAA	2	6	4234164	4234169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12007	NC_016810	C	6	6	4234190	4234195	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
12008	NC_016810	AGC	2	6	4234247	4234252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12009	NC_016810	ATT	2	6	4234265	4234270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12010	NC_016810	CAG	2	6	4236764	4236769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12011	NC_016810	TTG	2	6	4236840	4236845	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12012	NC_016810	A	6	6	4236852	4236857	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12014	NC_016810	CTAT	2	8	4236962	4236969	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12015	NC_016810	TGC	2	6	4236991	4236996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12016	NC_016810	GCA	2	6	4237000	4237005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12017	NC_016810	GGTC	2	8	4238472	4238479	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
12018	NC_016810	CTG	2	6	4238504	4238509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12021	NC_016810	GGA	2	6	4238741	4238746	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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12023	NC_016810	ATGA	2	8	4246385	4246392	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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12042	NC_016810	TCC	2	6	4269369	4269374	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12043	NC_016810	GAG	2	6	4269381	4269386	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12044	NC_016810	GT	5	10	4269411	4269420	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12045	NC_016810	AT	4	8	4270304	4270311	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12046	NC_016810	CT	3	6	4270329	4270334	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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12048	NC_016810	A	6	6	4270451	4270456	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12049	NC_016810	ATA	2	6	4271592	4271597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12050	NC_016810	A	8	8	4271627	4271634	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12051	NC_016810	A	6	6	4271658	4271663	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12052	NC_016810	TATCAA	2	12	4271695	4271706	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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12055	NC_016810	TTC	2	6	4272961	4272966	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12057	NC_016810	TTA	2	6	4273017	4273022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12061	NC_016810	TCGT	2	8	4274267	4274274	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
12062	NC_016810	GGC	2	6	4274857	4274862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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12099	NC_016810	ATT	2	6	4284759	4284764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12100	NC_016810	CG	3	6	4284767	4284772	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12101	NC_016810	TAA	2	6	4287665	4287670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12106	NC_016810	T	7	7	4287832	4287838	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12107	NC_016810	TTAA	2	8	4287905	4287912	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12108	NC_016810	AAT	2	6	4287961	4287966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12111	NC_016810	TGA	2	6	4288627	4288632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12112	NC_016810	T	7	7	4288638	4288644	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12113	NC_016810	AGC	2	6	4288659	4288664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12124	NC_016810	GCCAG	2	10	4293602	4293611	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
12125	NC_016810	CCTGA	2	10	4293641	4293650	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
12126	NC_016810	CAG	2	6	4293658	4293663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12128	NC_016810	GCC	2	6	4294808	4294813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12129	NC_016810	T	7	7	4294858	4294864	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12130	NC_016810	TCA	2	6	4294903	4294908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12131	NC_016810	CAACA	2	10	4294909	4294918	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
12132	NC_016810	TAT	2	6	4295946	4295951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12133	NC_016810	T	6	6	4295961	4295966	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12134	NC_016810	GTTA	2	8	4296910	4296917	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12135	NC_016810	CT	3	6	4296920	4296925	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12136	NC_016810	TGG	2	6	4296947	4296952	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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12248	NC_016810	AGCGTT	2	12	4354718	4354729	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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12252	NC_016810	A	6	6	4356617	4356622	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12256	NC_016810	GCC	2	6	4359449	4359454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12257	NC_016810	GAA	2	6	4359556	4359561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12258	NC_016810	TTA	2	6	4359573	4359578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12259	NC_016810	GCGCT	2	10	4359643	4359652	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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