MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. SL1344

Total Repeats: 13795

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_016810	TCA	2	6	184617	184622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_016810	TGC	2	6	184633	184638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
503	NC_016810	AAC	2	6	184641	184646	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
504	NC_016810	GGT	2	6	184652	184657	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
505	NC_016810	CTG	2	6	184706	184711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
506	NC_016810	CGG	2	6	184736	184741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_016810	ACC	2	6	184800	184805	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
508	NC_016810	TGG	2	6	184867	184872	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
509	NC_016810	GTC	2	6	184875	184880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
510	NC_016810	CGG	2	6	184885	184890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_016810	GAGC	2	8	184960	184967	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
512	NC_016810	CATC	2	8	184987	184994	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
513	NC_016810	TGGC	2	8	185115	185122	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
514	NC_016810	CG	3	6	185164	185169	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
515	NC_016810	GCC	2	6	185349	185354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
516	NC_016810	CA	3	6	185424	185429	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
517	NC_016810	TC	3	6	185469	185474	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
518	NC_016810	TGCC	2	8	185504	185511	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
519	NC_016810	T	6	6	185681	185686	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_016810	T	6	6	185694	185699	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_016810	CTA	2	6	185764	185769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_016810	ACT	2	6	185770	185775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_016810	CAA	2	6	185807	185812	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
524	NC_016810	GAG	2	6	185839	185844	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
525	NC_016810	CTATA	2	10	189361	189370	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
526	NC_016810	TAA	2	6	189378	189383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_016810	TAC	2	6	189414	189419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
528	NC_016810	TCT	2	6	189478	189483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
529	NC_016810	T	7	7	189518	189524	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_016810	CT	3	6	189964	189969	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
531	NC_016810	T	6	6	190060	190065	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_016810	T	6	6	190078	190083	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_016810	TTA	2	6	190089	190094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_016810	TTGA	2	8	190136	190143	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
535	NC_016810	CAA	2	6	190172	190177	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
536	NC_016810	GTG	2	6	194189	194194	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
537	NC_016810	CCT	2	6	195001	195006	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
538	NC_016810	A	7	7	195902	195908	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
539	NC_016810	CAT	2	6	195917	195922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
540	NC_016810	ATT	2	6	195951	195956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_016810	GGA	2	6	195973	195978	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
542	NC_016810	CGA	2	6	196379	196384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
543	NC_016810	TAT	2	6	196389	196394	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_016810	TATTG	2	10	196422	196431	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
545	NC_016810	GCC	2	6	198172	198177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
546	NC_016810	T	6	6	200633	200638	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_016810	TG	3	6	200666	200671	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
548	NC_016810	TCA	2	6	200676	200681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
549	NC_016810	GAAT	2	8	200710	200717	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
550	NC_016810	GCG	2	6	200754	200759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
551	NC_016810	TTA	2	6	200760	200765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_016810	ATT	2	6	202127	202132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_016810	AT	3	6	202139	202144	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_016810	AAGT	2	8	202161	202168	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
555	NC_016810	GCTTC	2	10	203903	203912	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
556	NC_016810	TGA	2	6	208332	208337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
557	NC_016810	CCA	2	6	208370	208375	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
558	NC_016810	GAT	2	6	209023	209028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
559	NC_016810	GAA	2	6	209040	209045	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
560	NC_016810	AT	4	8	209079	209086	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_016810	ATT	2	6	209094	209099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_016810	GTTT	2	8	209109	209116	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
563	NC_016810	GCT	2	6	209163	209168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
564	NC_016810	AAT	2	6	209181	209186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_016810	T	8	8	209192	209199	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_016810	A	6	6	209204	209209	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_016810	GT	3	6	209224	209229	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
568	NC_016810	A	7	7	209238	209244	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_016810	CAT	2	6	209253	209258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
570	NC_016810	GGA	2	6	209277	209282	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
571	NC_016810	GAC	2	6	209741	209746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
572	NC_016810	T	6	6	209768	209773	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_016810	CTT	2	6	211410	211415	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
574	NC_016810	TGA	2	6	212378	212383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
575	NC_016810	GCGCT	2	10	212396	212405	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
576	NC_016810	CGCGT	2	10	212448	212457	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
577	NC_016810	G	6	6	213328	213333	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
578	NC_016810	TAA	2	6	215293	215298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_016810	AG	3	6	215343	215348	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
580	NC_016810	CAT	2	6	215370	215375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
581	NC_016810	CGC	2	6	215379	215384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
582	NC_016810	AACG	2	8	216383	216390	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
583	NC_016810	ACGC	2	8	216984	216991	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
584	NC_016810	TAA	2	6	217004	217009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_016810	GA	3	6	220843	220848	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
586	NC_016810	TCT	3	9	220851	220859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
587	NC_016810	GTC	2	6	220860	220865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
588	NC_016810	GAA	2	6	220871	220876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
589	NC_016810	TCC	2	6	223550	223555	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
590	NC_016810	ATAA	2	8	223556	223563	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
591	NC_016810	TTA	2	6	223578	223583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_016810	CCTT	2	8	223586	223593	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
593	NC_016810	CGA	2	6	223653	223658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
594	NC_016810	TGC	2	6	223673	223678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
595	NC_016810	TAA	3	9	223684	223692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_016810	TCA	2	6	223718	223723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
597	NC_016810	CAATAT	2	12	229777	229788	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
598	NC_016810	CTGTC	2	10	229844	229853	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
599	NC_016810	AAG	2	6	229890	229895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
600	NC_016810	GC	3	6	229939	229944	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
601	NC_016810	TGA	2	6	229997	230002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
602	NC_016810	AAT	2	6	230025	230030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_016810	TAA	3	9	230119	230127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_016810	ATA	2	6	230148	230153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NC_016810	ATT	2	6	230158	230163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_016810	T	6	6	230162	230167	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_016810	TAA	2	6	230175	230180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_016810	A	6	6	230179	230184	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_016810	AAAT	2	8	230196	230203	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_016810	A	8	8	230222	230229	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_016810	T	6	6	230242	230247	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_016810	T	8	8	230249	230256	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
613	NC_016810	AAAT	2	8	230274	230281	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_016810	TA	3	6	230297	230302	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_016810	T	7	7	230324	230330	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_016810	T	7	7	230353	230359	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_016810	CTTG	2	8	230371	230378	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
618	NC_016810	TTTG	2	8	230380	230387	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
619	NC_016810	T	6	6	230388	230393	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_016810	TAT	2	6	230410	230415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
621	NC_016810	TAAA	2	8	230434	230441	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_016810	A	6	6	230439	230444	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_016810	TTAT	2	8	230496	230503	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
624	NC_016810	GTT	2	6	230510	230515	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
625	NC_016810	CTT	2	6	230518	230523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
626	NC_016810	ATATA	2	10	230557	230566	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_016810	CTA	2	6	230570	230575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_016810	TG	3	6	230605	230610	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
629	NC_016810	TAA	2	6	230638	230643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
630	NC_016810	ATC	2	6	231221	231226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
631	NC_016810	GAT	2	6	231246	231251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
632	NC_016810	A	7	7	231261	231267	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_016810	TA	3	6	231273	231278	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_016810	A	9	9	237146	237154	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
635	NC_016810	GGC	2	6	237161	237166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
636	NC_016810	GTT	2	6	237186	237191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
637	NC_016810	TCT	2	6	238650	238655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
638	NC_016810	C	6	6	245967	245972	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
639	NC_016810	TGCTC	2	10	246045	246054	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
640	NC_016810	AGG	2	6	246057	246062	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
641	NC_016810	CGG	2	6	247229	247234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
642	NC_016810	AT	3	6	247260	247265	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
643	NC_016810	AC	3	6	247305	247310	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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652	NC_016810	CT	3	6	252953	252958	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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688	NC_016810	T	6	6	276000	276005	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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770	NC_016810	GT	4	8	292888	292895	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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982	NC_016810	ATT	2	6	347528	347533	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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