MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. SL1344

Total Repeats: 13795

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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9002	NC_016810	ATT	2	6	3157295	3157300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9003	NC_016810	CCT	2	6	3157309	3157314	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9004	NC_016810	GCC	2	6	3159097	3159102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9005	NC_016810	AAT	2	6	3159128	3159133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9006	NC_016810	TTA	2	6	3159143	3159148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9007	NC_016810	TAAA	2	8	3159256	3159263	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9008	NC_016810	GTAGC	2	10	3159274	3159283	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
9009	NC_016810	A	7	7	3161125	3161131	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9010	NC_016810	TCT	2	6	3162328	3162333	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9011	NC_016810	GCGATC	2	12	3162386	3162397	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9012	NC_016810	A	6	6	3162476	3162481	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9013	NC_016810	CAA	2	6	3162488	3162493	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9014	NC_016810	AGC	2	6	3162536	3162541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9015	NC_016810	TCG	2	6	3162550	3162555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9016	NC_016810	GTC	2	6	3162572	3162577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9017	NC_016810	GACG	2	8	3162626	3162633	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
9018	NC_016810	AGC	2	6	3162642	3162647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9019	NC_016810	TCG	2	6	3162656	3162661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9020	NC_016810	GTC	2	6	3162678	3162683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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9022	NC_016810	T	7	7	3162733	3162739	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9023	NC_016810	GTC	2	6	3162746	3162751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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9026	NC_016810	GC	3	6	3164297	3164302	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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9034	NC_016810	CAT	2	6	3174133	3174138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9035	NC_016810	GGCG	2	8	3179306	3179313	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
9036	NC_016810	GAA	2	6	3179314	3179319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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9039	NC_016810	A	8	8	3179430	3179437	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9040	NC_016810	CG	3	6	3179442	3179447	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9041	NC_016810	CAC	2	6	3181160	3181165	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9042	NC_016810	GC	3	6	3181205	3181210	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9043	NC_016810	AAT	2	6	3181240	3181245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9044	NC_016810	CT	3	6	3181349	3181354	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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9054	NC_016810	A	6	6	3184736	3184741	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9055	NC_016810	T	6	6	3184820	3184825	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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9062	NC_016810	TTA	2	6	3186531	3186536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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9064	NC_016810	TAT	2	6	3186569	3186574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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9067	NC_016810	CGC	2	6	3188120	3188125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9068	NC_016810	A	8	8	3191584	3191591	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9069	NC_016810	AAT	2	6	3191643	3191648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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9096	NC_016810	GAATT	2	10	3200964	3200973	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
9097	NC_016810	TGGC	2	8	3201106	3201113	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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9099	NC_016810	TAG	2	6	3202328	3202333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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9101	NC_016810	GATG	2	8	3203302	3203309	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
9102	NC_016810	T	6	6	3203852	3203857	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9103	NC_016810	CATC	2	8	3203896	3203903	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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9105	NC_016810	TG	3	6	3203955	3203960	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9106	NC_016810	ACA	2	6	3205519	3205524	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9107	NC_016810	G	6	6	3205571	3205576	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
9108	NC_016810	G	7	7	3205591	3205597	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
9109	NC_016810	AAC	2	6	3205619	3205624	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9110	NC_016810	A	6	6	3206615	3206620	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9111	NC_016810	CCACCG	2	12	3206625	3206636	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
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9113	NC_016810	GCCGG	2	10	3207413	3207422	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
9114	NC_016810	GAA	2	6	3207982	3207987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9115	NC_016810	TATT	2	8	3208002	3208009	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9116	NC_016810	TG	3	6	3208015	3208020	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9117	NC_016810	TCAG	2	8	3208048	3208055	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9118	NC_016810	TTTTAT	2	12	3208059	3208070	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9119	NC_016810	C	7	7	3208077	3208083	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
9120	NC_016810	GTC	2	6	3212452	3212457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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9122	NC_016810	CGAT	2	8	3213358	3213365	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9123	NC_016810	AAT	2	6	3213386	3213391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9124	NC_016810	ACAG	2	8	3213439	3213446	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
9125	NC_016810	AT	3	6	3213477	3213482	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9126	NC_016810	ATGT	2	8	3213491	3213498	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
9127	NC_016810	ATA	2	6	3213533	3213538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9128	NC_016810	AT	3	6	3213545	3213550	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9129	NC_016810	A	6	6	3213574	3213579	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9130	NC_016810	TAA	2	6	3213626	3213631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9131	NC_016810	CAT	2	6	3213644	3213649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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9133	NC_016810	A	6	6	3213663	3213668	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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9266	NC_016810	AGCGC	2	10	3249112	3249121	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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