MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. SL1344

Total Repeats: 13795

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_016810	AAAG	2	8	2499363	2499370	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
7002	NC_016810	A	7	7	2499402	2499408	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7003	NC_016810	GAT	2	6	2499425	2499430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7004	NC_016810	CGT	2	6	2499439	2499444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7005	NC_016810	TGG	2	6	2499829	2499834	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7006	NC_016810	CG	3	6	2499887	2499892	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7007	NC_016810	CCG	2	6	2499911	2499916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7008	NC_016810	GCCA	2	8	2499922	2499929	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7009	NC_016810	A	6	6	2499955	2499960	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7010	NC_016810	AAT	2	6	2500089	2500094	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7011	NC_016810	TTTA	2	8	2501464	2501471	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7012	NC_016810	CCAT	2	8	2502271	2502278	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
7013	NC_016810	CAA	2	6	2502385	2502390	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7014	NC_016810	ATTTTT	2	12	2502436	2502447	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7015	NC_016810	TTA	2	6	2502491	2502496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7016	NC_016810	CAG	2	6	2502509	2502514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7017	NC_016810	ATC	2	6	2502517	2502522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7018	NC_016810	GGC	2	6	2503487	2503492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7019	NC_016810	A	6	6	2503514	2503519	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7020	NC_016810	CCT	2	6	2503570	2503575	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7021	NC_016810	TCT	2	6	2503633	2503638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7022	NC_016810	TGC	2	6	2503639	2503644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7023	NC_016810	GTC	2	6	2503729	2503734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7024	NC_016810	TGA	2	6	2504747	2504752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7025	NC_016810	TCG	2	6	2504771	2504776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7026	NC_016810	TTA	2	6	2504790	2504795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7027	NC_016810	AAT	2	6	2504862	2504867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7028	NC_016810	ATG	2	6	2504883	2504888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7029	NC_016810	TGT	2	6	2504945	2504950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7030	NC_016810	GCC	2	6	2509412	2509417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7031	NC_016810	AAC	2	6	2509559	2509564	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7032	NC_016810	AAT	2	6	2509573	2509578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7033	NC_016810	GCA	2	6	2509626	2509631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7034	NC_016810	AAT	2	6	2509676	2509681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7035	NC_016810	CAC	2	6	2509690	2509695	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7036	NC_016810	TTC	2	6	2509758	2509763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7037	NC_016810	CCT	2	6	2509806	2509811	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7038	NC_016810	CTAT	2	8	2511282	2511289	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7039	NC_016810	TA	3	6	2511302	2511307	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7040	NC_016810	AAT	2	6	2511313	2511318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7041	NC_016810	GGC	2	6	2511333	2511338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7042	NC_016810	GAGT	2	8	2511343	2511350	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
7043	NC_016810	CCT	2	6	2511764	2511769	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7044	NC_016810	ATTTT	2	10	2511866	2511875	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
7045	NC_016810	T	7	7	2511872	2511878	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7046	NC_016810	AAT	2	6	2511940	2511945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7047	NC_016810	CTT	2	6	2511982	2511987	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7048	NC_016810	TGG	2	6	2512019	2512024	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7049	NC_016810	GCCT	2	8	2512032	2512039	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7050	NC_016810	ATG	2	6	2512107	2512112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7051	NC_016810	TGA	2	6	2512145	2512150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7052	NC_016810	AAGT	2	8	2512159	2512166	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7053	NC_016810	GAT	2	6	2512195	2512200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7054	NC_016810	ATT	2	6	2512248	2512253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7055	NC_016810	ATA	2	6	2513239	2513244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7056	NC_016810	T	6	6	2513303	2513308	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7057	NC_016810	CGG	2	6	2513316	2513321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7058	NC_016810	TCA	2	6	2513339	2513344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7059	NC_016810	AAT	2	6	2513503	2513508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7060	NC_016810	TAT	2	6	2513520	2513525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7061	NC_016810	CT	3	6	2513536	2513541	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7062	NC_016810	GTAAGT	2	12	2513550	2513561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7063	NC_016810	GA	3	6	2513588	2513593	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7064	NC_016810	CATTT	2	10	2513620	2513629	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
7065	NC_016810	TGA	2	6	2513661	2513666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7066	NC_016810	TGG	2	6	2515013	2515018	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7067	NC_016810	TTC	2	6	2515045	2515050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7068	NC_016810	A	6	6	2515085	2515090	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7069	NC_016810	ACTT	2	8	2515108	2515115	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7070	NC_016810	CAAA	2	8	2515139	2515146	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
7071	NC_016810	ATT	2	6	2515151	2515156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7072	NC_016810	CGA	2	6	2515197	2515202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7073	NC_016810	AAT	2	6	2515231	2515236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7074	NC_016810	AAAT	2	8	2515413	2515420	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7075	NC_016810	TGA	2	6	2515452	2515457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7076	NC_016810	AAT	2	6	2515504	2515509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7077	NC_016810	A	7	7	2515548	2515554	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7078	NC_016810	AC	3	6	2515635	2515640	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7079	NC_016810	CCA	2	6	2515668	2515673	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7080	NC_016810	AAC	3	9	2516708	2516716	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7081	NC_016810	TCA	2	6	2516751	2516756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7082	NC_016810	GCA	2	6	2516787	2516792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7083	NC_016810	TATT	2	8	2519907	2519914	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7084	NC_016810	A	6	6	2520936	2520941	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7085	NC_016810	GA	3	6	2521038	2521043	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7086	NC_016810	CCT	2	6	2521376	2521381	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7087	NC_016810	GAC	2	6	2522801	2522806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7088	NC_016810	TTTTCA	2	12	2522859	2522870	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7089	NC_016810	CAGTA	2	10	2522875	2522884	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
7090	NC_016810	TTA	2	6	2522929	2522934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7091	NC_016810	GT	4	8	2522937	2522944	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7092	NC_016810	T	7	7	2524260	2524266	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7093	NC_016810	CAT	2	6	2526478	2526483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7094	NC_016810	TA	3	6	2526484	2526489	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7095	NC_016810	AAT	2	6	2526499	2526504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7096	NC_016810	AGC	2	6	2526557	2526562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7097	NC_016810	CAAA	2	8	2526565	2526572	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
7098	NC_016810	TGG	2	6	2526654	2526659	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7099	NC_016810	CATGC	2	10	2526691	2526700	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
7100	NC_016810	TGG	2	6	2526772	2526777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7101	NC_016810	CATGC	2	10	2526809	2526818	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
7102	NC_016810	CAT	2	6	2526879	2526884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7103	NC_016810	AGT	2	6	2526984	2526989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7104	NC_016810	ATA	2	6	2527829	2527834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7105	NC_016810	CTGCC	2	10	2527847	2527856	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
7106	NC_016810	ACG	2	6	2529476	2529481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7107	NC_016810	AACA	2	8	2529482	2529489	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
7108	NC_016810	CA	3	6	2529543	2529548	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7109	NC_016810	AGG	2	6	2529590	2529595	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7110	NC_016810	CGG	2	6	2529600	2529605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7111	NC_016810	TCA	2	6	2529616	2529621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7112	NC_016810	ACT	2	6	2529629	2529634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7113	NC_016810	CCG	2	6	2529646	2529651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7114	NC_016810	AGG	2	6	2529711	2529716	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7115	NC_016810	CGG	2	6	2529721	2529726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7116	NC_016810	TCA	2	6	2529737	2529742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7117	NC_016810	CAC	2	6	2529745	2529750	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7118	NC_016810	AGG	2	6	2529828	2529833	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7119	NC_016810	CGG	2	6	2529838	2529843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7120	NC_016810	TCA	2	6	2529854	2529859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7121	NC_016810	CAC	2	6	2529862	2529867	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7122	NC_016810	CCA	2	6	2529941	2529946	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7123	NC_016810	A	6	6	2529951	2529956	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7124	NC_016810	T	6	6	2529972	2529977	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7125	NC_016810	TGCGC	2	10	2530031	2530040	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
7126	NC_016810	GAC	2	6	2530055	2530060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7127	NC_016810	TCA	2	6	2533491	2533496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7128	NC_016810	TTGC	2	8	2533565	2533572	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7129	NC_016810	TTAA	2	8	2533621	2533628	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7130	NC_016810	TAA	2	6	2533634	2533639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7131	NC_016810	CA	3	6	2534465	2534470	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7132	NC_016810	AGAT	2	8	2534476	2534483	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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7260	NC_016810	TCA	2	6	2605595	2605600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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