MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Stenotrophomonas maltophilia JV3 chromosome

Total Repeats: 10132

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_015947	ACC	2	6	4484253	4484258	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10002	NC_015947	TGG	2	6	4484346	4484351	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10003	NC_015947	CGA	2	6	4484370	4484375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10004	NC_015947	AGG	2	6	4484516	4484521	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10005	NC_015947	CAA	2	6	4484630	4484635	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10006	NC_015947	GT	3	6	4484657	4484662	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10007	NC_015947	GCA	2	6	4484687	4484692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10008	NC_015947	GTA	2	6	4484820	4484825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10009	NC_015947	GT	3	6	4484827	4484832	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10010	NC_015947	ATG	2	6	4484852	4484857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10011	NC_015947	TCC	2	6	4484878	4484883	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10012	NC_015947	CGG	2	6	4484894	4484899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10013	NC_015947	CCA	2	6	4484914	4484919	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10014	NC_015947	CACGA	2	10	4484979	4484988	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
10015	NC_015947	GAC	2	6	4484992	4484997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10016	NC_015947	GCA	2	6	4485004	4485009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10017	NC_015947	TTC	2	6	4485080	4485085	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10018	NC_015947	GGC	2	6	4485175	4485180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10019	NC_015947	TCC	2	6	4485344	4485349	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10020	NC_015947	ACC	2	6	4485470	4485475	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10021	NC_015947	ACGC	2	8	4485477	4485484	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10022	NC_015947	GCT	2	6	4485534	4485539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10023	NC_015947	TTTC	2	8	4485606	4485613	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
10024	NC_015947	CAA	2	6	4485615	4485620	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10025	NC_015947	CTT	2	6	4485643	4485648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10026	NC_015947	CTG	2	6	4485702	4485707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10027	NC_015947	ATC	2	6	4485752	4485757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10028	NC_015947	TCG	2	6	4485777	4485782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10029	NC_015947	TGG	2	6	4485786	4485791	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10030	NC_015947	CTC	2	6	4485977	4485982	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10031	NC_015947	TGC	2	6	4485985	4485990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10032	NC_015947	GCTT	2	8	4486120	4486127	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10033	NC_015947	ATC	2	6	4486173	4486178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10034	NC_015947	TGC	2	6	4486257	4486262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10035	NC_015947	GCC	2	6	4486282	4486287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10036	NC_015947	T	6	6	4486321	4486326	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10037	NC_015947	GTT	2	6	4486351	4486356	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10038	NC_015947	TGC	2	6	4486362	4486367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10039	NC_015947	TCG	2	6	4486369	4486374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10040	NC_015947	TCG	2	6	4486392	4486397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10041	NC_015947	GCC	2	6	4486404	4486409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10042	NC_015947	TAT	2	6	4486410	4486415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10043	NC_015947	TTCG	2	8	4486443	4486450	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10044	NC_015947	ATC	2	6	4486451	4486456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10045	NC_015947	CGG	2	6	4486462	4486467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10046	NC_015947	TGG	2	6	4486468	4486473	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10047	NC_015947	GCA	2	6	4486514	4486519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10048	NC_015947	T	7	7	4486560	4486566	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10049	NC_015947	TGA	2	6	4486573	4486578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10050	NC_015947	CAC	2	6	4486585	4486590	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10051	NC_015947	GCG	2	6	4486624	4486629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10052	NC_015947	CG	3	6	4486635	4486640	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10053	NC_015947	CGC	2	6	4486653	4486658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10054	NC_015947	GAT	2	6	4488476	4488481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10055	NC_015947	GCC	2	6	4488515	4488520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10056	NC_015947	CCAT	2	8	4489299	4489306	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10057	NC_015947	TGA	2	6	4490229	4490234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10058	NC_015947	GAT	2	6	4490242	4490247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10059	NC_015947	TCC	2	6	4491528	4491533	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10060	NC_015947	GCC	2	6	4491598	4491603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10061	NC_015947	GCA	2	6	4493855	4493860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10062	NC_015947	CG	3	6	4495714	4495719	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10063	NC_015947	TTGA	2	8	4495768	4495775	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10064	NC_015947	CGGC	2	8	4496578	4496585	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10065	NC_015947	GCCG	2	8	4496619	4496626	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10066	NC_015947	CCGG	2	8	4496648	4496655	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10067	NC_015947	GCC	2	6	4502247	4502252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10068	NC_015947	CAG	2	6	4502292	4502297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10069	NC_015947	CCCCTC	2	12	4503141	4503152	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
10070	NC_015947	CGC	2	6	4503232	4503237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10071	NC_015947	TCT	2	6	4503248	4503253	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10072	NC_015947	TGG	2	6	4503258	4503263	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10073	NC_015947	GTGG	2	8	4503337	4503344	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
10074	NC_015947	TGCCC	2	10	4503419	4503428	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
10075	NC_015947	CAG	2	6	4503460	4503465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10076	NC_015947	C	6	6	4503486	4503491	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10077	NC_015947	TAG	2	6	4503527	4503532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10078	NC_015947	CTAT	2	8	4503537	4503544	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10079	NC_015947	CCG	2	6	4504024	4504029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10080	NC_015947	TGT	2	6	4504065	4504070	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10081	NC_015947	GTT	2	6	4504074	4504079	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10082	NC_015947	CCTCCC	2	12	4504080	4504091	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
10083	NC_015947	CGCCCC	2	12	4504098	4504109	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
10084	NC_015947	C	6	6	4508806	4508811	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10085	NC_015947	GGC	2	6	4509235	4509240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10086	NC_015947	TCAACG	2	12	4509266	4509277	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
10087	NC_015947	GGGT	2	8	4509306	4509313	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
10088	NC_015947	CGC	2	6	4509357	4509362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10089	NC_015947	ACCC	2	8	4509392	4509399	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
10090	NC_015947	GCA	2	6	4518482	4518487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10091	NC_015947	GGCA	2	8	4518489	4518496	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10092	NC_015947	GGCC	2	8	4518506	4518513	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10093	NC_015947	A	6	6	4518642	4518647	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10094	NC_015947	CGG	2	6	4520209	4520214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10095	NC_015947	GC	4	8	4520222	4520229	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10096	NC_015947	CCA	2	6	4520232	4520237	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10097	NC_015947	GTCTG	2	10	4522762	4522771	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
10098	NC_015947	CGG	2	6	4522794	4522799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10099	NC_015947	CCA	2	6	4523444	4523449	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10100	NC_015947	CG	3	6	4523459	4523464	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10101	NC_015947	GCCG	2	8	4523476	4523483	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10102	NC_015947	CGGC	2	8	4523536	4523543	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10103	NC_015947	GGTC	2	8	4525602	4525609	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10104	NC_015947	AGG	2	6	4527326	4527331	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10105	NC_015947	CG	3	6	4527345	4527350	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10106	NC_015947	GCA	2	6	4527378	4527383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10107	NC_015947	CGC	2	6	4528378	4528383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10108	NC_015947	TGC	2	6	4530248	4530253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10109	NC_015947	GCCG	2	8	4531756	4531763	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10110	NC_015947	CGGC	2	8	4531809	4531816	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10111	NC_015947	TCA	2	6	4533151	4533156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10112	NC_015947	CCG	2	6	4533203	4533208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10113	NC_015947	GAT	2	6	4533218	4533223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10114	NC_015947	CGGC	2	8	4534476	4534483	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10115	NC_015947	CCAA	2	8	4534487	4534494	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10116	NC_015947	CCA	2	6	4534504	4534509	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10117	NC_015947	GCGA	2	8	4534657	4534664	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10118	NC_015947	TCC	2	6	4534712	4534717	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10119	NC_015947	GCCG	2	8	4535774	4535781	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10120	NC_015947	CGC	2	6	4535795	4535800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10121	NC_015947	GCCA	2	8	4535818	4535825	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10122	NC_015947	TGG	2	6	4536617	4536622	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10123	NC_015947	GCCG	2	8	4536624	4536631	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10124	NC_015947	CGGC	2	8	4536684	4536691	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10125	NC_015947	GGC	2	6	4537852	4537857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10126	NC_015947	GATG	2	8	4541948	4541955	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
10127	NC_015947	CGC	2	6	4541982	4541987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10128	NC_015947	GCG	2	6	4542006	4542011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10129	NC_015947	CTG	2	6	4542017	4542022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10130	NC_015947	CGGC	2	8	4542038	4542045	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10131	NC_015947	AG	3	6	4544454	4544459	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10132	NC_015947	TACCC	2	10	4544461	4544470	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding

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