MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Stenotrophomonas maltophilia JV3 chromosome

Total Repeats: 10132

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_015947	CGG	2	6	2765948	2765953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6002	NC_015947	CGCC	2	8	2765961	2765968	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6003	NC_015947	GATT	2	8	2766698	2766705	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6004	NC_015947	TTG	2	6	2766709	2766714	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6005	NC_015947	CAC	2	6	2766757	2766762	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6006	NC_015947	TCGT	2	8	2768803	2768810	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6007	NC_015947	TTC	2	6	2771933	2771938	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6008	NC_015947	CTG	2	6	2771943	2771948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6009	NC_015947	GAT	2	6	2772001	2772006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6010	NC_015947	CTG	2	6	2772717	2772722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6011	NC_015947	ATCT	2	8	2772809	2772816	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6012	NC_015947	T	7	7	2772827	2772833	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6013	NC_015947	TCC	2	6	2774582	2774587	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6014	NC_015947	ATG	2	6	2774588	2774593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6015	NC_015947	CCT	2	6	2774877	2774882	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6016	NC_015947	CAT	2	6	2774915	2774920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6017	NC_015947	GTC	2	6	2774933	2774938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6018	NC_015947	TGCACA	2	12	2774939	2774950	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
6019	NC_015947	CGG	2	6	2774952	2774957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6020	NC_015947	CGG	2	6	2774965	2774970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6021	NC_015947	GGC	2	6	2774987	2774992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6022	NC_015947	ACC	2	6	2774996	2775001	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6023	NC_015947	CTG	2	6	2775037	2775042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6024	NC_015947	GCA	2	6	2775047	2775052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6025	NC_015947	TGGC	2	8	2775059	2775066	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6026	NC_015947	TCAA	2	8	2776834	2776841	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6027	NC_015947	TAGCG	2	10	2776852	2776861	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
6028	NC_015947	CCA	2	6	2778159	2778164	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6029	NC_015947	CGG	2	6	2778175	2778180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6030	NC_015947	CG	4	8	2778716	2778723	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6031	NC_015947	ACC	2	6	2779185	2779190	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6032	NC_015947	CAGC	2	8	2779451	2779458	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6033	NC_015947	GCA	2	6	2781048	2781053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6034	NC_015947	CGC	2	6	2783955	2783960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6035	NC_015947	C	6	6	2783986	2783991	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6036	NC_015947	TTCCC	2	10	2784114	2784123	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
6037	NC_015947	CCG	2	6	2784133	2784138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6038	NC_015947	AGC	2	6	2786261	2786266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6039	NC_015947	TGC	2	6	2786278	2786283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6040	NC_015947	CACC	2	8	2786344	2786351	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
6041	NC_015947	CCT	2	6	2786355	2786360	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6042	NC_015947	CCG	2	6	2786380	2786385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6043	NC_015947	CG	3	6	2786400	2786405	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6044	NC_015947	CG	4	8	2786415	2786422	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6045	NC_015947	TGC	2	6	2787029	2787034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6046	NC_015947	GGC	2	6	2790209	2790214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6047	NC_015947	GAC	2	6	2790222	2790227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6048	NC_015947	CG	3	6	2790247	2790252	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6049	NC_015947	CGAC	2	8	2790264	2790271	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6050	NC_015947	CCA	2	6	2791132	2791137	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6051	NC_015947	GC	3	6	2791158	2791163	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6052	NC_015947	CAC	2	6	2793965	2793970	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6053	NC_015947	CGG	2	6	2794509	2794514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6054	NC_015947	CGC	2	6	2794596	2794601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6055	NC_015947	GTTG	2	8	2794719	2794726	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6056	NC_015947	CAG	2	6	2794769	2794774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6057	NC_015947	CGC	3	9	2794832	2794840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6058	NC_015947	CGC	2	6	2794896	2794901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6059	NC_015947	ATC	2	6	2795290	2795295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6060	NC_015947	TTG	2	6	2795300	2795305	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6061	NC_015947	GATG	2	8	2796370	2796377	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6062	NC_015947	TGC	2	6	2796410	2796415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6063	NC_015947	GCG	2	6	2796444	2796449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6064	NC_015947	CCG	2	6	2796497	2796502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6065	NC_015947	ATG	2	6	2797111	2797116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6066	NC_015947	TGGG	2	8	2797133	2797140	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
6067	NC_015947	CCCG	2	8	2797167	2797174	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6068	NC_015947	CATG	2	8	2800040	2800047	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6069	NC_015947	CAG	2	6	2800101	2800106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6070	NC_015947	GCA	2	6	2800115	2800120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6072	NC_015947	CGA	2	6	2800202	2800207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6073	NC_015947	TTG	2	6	2800264	2800269	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6074	NC_015947	CCT	2	6	2801538	2801543	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6075	NC_015947	AATG	2	8	2801546	2801553	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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6077	NC_015947	CGA	2	6	2801685	2801690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6079	NC_015947	CAGC	2	8	2801750	2801757	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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6083	NC_015947	TGA	2	6	2801816	2801821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6085	NC_015947	GA	3	6	2801888	2801893	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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6091	NC_015947	TC	3	6	2804290	2804295	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6092	NC_015947	CGG	2	6	2804299	2804304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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6095	NC_015947	TCCCC	2	10	2804990	2804999	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
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6099	NC_015947	GTG	2	6	2806851	2806856	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6100	NC_015947	GGGAT	2	10	2806864	2806873	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
6101	NC_015947	GCC	2	6	2806897	2806902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6102	NC_015947	GGCA	2	8	2807606	2807613	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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6108	NC_015947	GCC	2	6	2809830	2809835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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6110	NC_015947	TTG	2	6	2811055	2811060	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6112	NC_015947	GC	3	6	2811081	2811086	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6113	NC_015947	ACG	2	6	2812283	2812288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6114	NC_015947	GCCG	2	8	2812296	2812303	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6115	NC_015947	CGGC	2	8	2812348	2812355	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6116	NC_015947	CG	3	6	2812367	2812372	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6117	NC_015947	GCC	2	6	2813205	2813210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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6123	NC_015947	GC	3	6	2813622	2813627	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6124	NC_015947	TTG	2	6	2814163	2814168	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6125	NC_015947	ATTG	2	8	2814182	2814189	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6126	NC_015947	TCCC	2	8	2814232	2814239	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
6127	NC_015947	CCG	2	6	2814273	2814278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6128	NC_015947	GC	3	6	2814290	2814295	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6129	NC_015947	CGGC	2	8	2822991	2822998	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6130	NC_015947	GGCTC	2	10	2823069	2823078	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
6131	NC_015947	TCG	2	6	2823792	2823797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6132	NC_015947	TCA	2	6	2823830	2823835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6133	NC_015947	CGC	2	6	2823915	2823920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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6135	NC_015947	GC	3	6	2825489	2825494	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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6139	NC_015947	GCGG	2	8	2829180	2829187	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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6141	NC_015947	GCCT	2	8	2829319	2829326	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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6143	NC_015947	GC	3	6	2829341	2829346	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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6243	NC_015947	ACAAA	2	10	2880635	2880644	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
6244	NC_015947	CCGTT	2	10	2880665	2880674	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
6245	NC_015947	ACT	2	6	2880700	2880705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6249	NC_015947	GCG	2	6	2885883	2885888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6250	NC_015947	CGATT	2	10	2885893	2885902	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
6251	NC_015947	GGT	2	6	2891054	2891059	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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6253	NC_015947	TTGG	2	8	2891127	2891134	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6254	NC_015947	CCAA	2	8	2891151	2891158	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6255	NC_015947	ATC	2	6	2891538	2891543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6256	NC_015947	GCCA	2	8	2891552	2891559	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6257	NC_015947	GCG	2	6	2891615	2891620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6258	NC_015947	GAA	2	6	2891646	2891651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6259	NC_015947	GCT	2	6	2891672	2891677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6260	NC_015947	GGC	2	6	2891683	2891688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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6262	NC_015947	GCCGC	2	10	2892685	2892694	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
6263	NC_015947	GCG	2	6	2892702	2892707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6264	NC_015947	GC	3	6	2893908	2893913	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6265	NC_015947	GCT	2	6	2893943	2893948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6374	NC_015947	CGGC	2	8	2949591	2949598	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6375	NC_015947	ACC	2	6	2949602	2949607	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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6377	NC_015947	CCGG	2	8	2950171	2950178	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6378	NC_015947	CTTGCC	2	12	2950232	2950243	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
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6380	NC_015947	ATC	2	6	2952449	2952454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6382	NC_015947	GGGT	2	8	2952475	2952482	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
6383	NC_015947	TCCA	2	8	2952532	2952539	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6384	NC_015947	CCT	2	6	2953684	2953689	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6385	NC_015947	GCG	2	6	2954934	2954939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6386	NC_015947	AGTCC	2	10	2954997	2955006	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
6387	NC_015947	GCCG	2	8	2955043	2955050	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6388	NC_015947	CAC	2	6	2955111	2955116	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6389	NC_015947	CCGG	2	8	2955293	2955300	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6390	NC_015947	GCT	2	6	2958555	2958560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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