MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptococcus pseudopneumoniae IS7493 chromosome

Total Repeats: 7424

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015875	TAT	2	6	1383	1388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015875	T	6	6	1390	1395	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015875	T	6	6	1403	1408	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015875	TAT	2	6	1472	1477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015875	TAT	2	6	1481	1486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015875	ATAA	2	8	1503	1510	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015875	AGT	2	6	2716	2721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015875	TTAG	2	8	2923	2930	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015875	TGAAA	2	10	2974	2983	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015875	TAA	2	6	4121	4126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015875	A	7	7	4146	4152	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015875	TCT	2	6	8273	8278	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_015875	AAT	2	6	8301	8306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015875	TAA	2	6	8316	8321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015875	AG	3	6	14140	14145	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015875	CT	3	6	14153	14158	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_015875	T	6	6	14158	14163	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015875	GAG	2	6	14172	14177	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015875	A	7	7	14744	14750	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015875	A	7	7	14753	14759	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015875	GT	3	6	14769	14774	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015875	TGA	2	6	14785	14790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015875	A	6	6	14797	14802	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015875	ATT	2	6	14820	14825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015875	T	6	6	14861	14866	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015875	CT	3	6	14897	14902	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_015875	AAATG	2	10	14929	14938	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015875	TC	4	8	14960	14967	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_015875	GAG	2	6	15044	15049	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015875	TACA	2	8	17311	17318	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_015875	GCAAG	2	10	17338	17347	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
32	NC_015875	A	6	6	17348	17353	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015875	CTT	2	6	17368	17373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_015875	TAT	2	6	17944	17949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015875	AT	3	6	18124	18129	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015875	A	6	6	18250	18255	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015875	A	6	6	18257	18262	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015875	AC	3	6	18279	18284	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_015875	GTA	2	6	18290	18295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015875	GTC	2	6	18296	18301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_015875	A	7	7	18310	18316	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015875	ACA	2	6	18338	18343	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_015875	CTC	2	6	21182	21187	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_015875	TAA	2	6	21204	21209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015875	TAA	2	6	21240	21245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015875	TAA	2	6	21273	21278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015875	TAA	2	6	21284	21289	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015875	CTG	2	6	21855	21860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_015875	TAGA	2	8	21888	21895	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015875	T	8	8	21928	21935	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015875	AAG	2	6	22009	22014	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015875	GAT	2	6	22079	22084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015875	ACCAAG	2	12	22086	22097	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_015875	TC	3	6	22234	22239	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_015875	TC	3	6	22287	22292	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_015875	GAA	3	9	22335	22343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015875	A	8	8	22342	22349	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015875	CAA	2	6	22374	22379	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_015875	ACA	2	6	22382	22387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_015875	T	6	6	24087	24092	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015875	GAC	2	6	24225	24230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_015875	AGG	2	6	24240	24245	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015875	TGA	2	6	25674	25679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015875	ATT	2	6	28347	28352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015875	GAA	2	6	28761	28766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015875	AAG	2	6	28772	28777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015875	GAA	2	6	28812	28817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015875	TCTT	2	8	29005	29012	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_015875	CTA	2	6	29063	29068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_015875	CAA	2	6	29118	29123	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_015875	GTT	2	6	29164	29169	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015875	TTTTG	2	10	29403	29412	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015875	GTG	2	6	29444	29449	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015875	AT	3	6	29480	29485	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015875	AAG	2	6	29507	29512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015875	ATT	2	6	29538	29543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015875	AAG	2	6	29600	29605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015875	CAA	2	6	29627	29632	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_015875	CAA	2	6	29651	29656	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_015875	TGA	2	6	29751	29756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015875	GCA	2	6	29762	29767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_015875	GAA	2	6	29842	29847	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015875	CAA	2	6	29887	29892	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_015875	TGG	2	6	29917	29922	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015875	TGC	2	6	29956	29961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_015875	AGG	2	6	29962	29967	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015875	GAC	2	6	29993	29998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_015875	CAG	2	6	30009	30014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_015875	AAG	2	6	30056	30061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015875	TGA	2	6	30094	30099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015875	GAT	2	6	30128	30133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015875	GGT	2	6	30161	30166	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015875	AAAGG	2	10	30167	30176	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015875	GTT	2	6	30283	30288	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015875	GCA	2	6	30314	30319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_015875	CTA	2	6	30474	30479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_015875	TTTG	2	8	30568	30575	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015875	ATA	2	6	30576	30581	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015875	ACG	2	6	30639	30644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_015875	TTG	2	6	30717	30722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015875	GTTT	2	8	30747	30754	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015875	TCA	2	6	30797	30802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_015875	GTT	2	6	30857	30862	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015875	ATG	2	6	30894	30899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015875	ATT	2	6	30956	30961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015875	GAAG	2	8	30974	30981	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015875	TAG	2	6	31047	31052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015875	TAG	2	6	31101	31106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015875	TCTTG	2	10	31215	31224	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
110	NC_015875	GGA	2	6	31238	31243	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015875	ATT	2	6	31261	31266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015875	ATTG	2	8	31414	31421	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015875	GCA	2	6	31481	31486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_015875	GCA	2	6	31499	31504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_015875	GCA	2	6	31529	31534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_015875	GCA	2	6	31541	31546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_015875	GCA	2	6	31610	31615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_015875	TGT	2	6	31666	31671	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015875	GGATG	2	10	31820	31829	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015875	TTGGT	2	10	31861	31870	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015875	AAG	2	6	32022	32027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015875	GA	3	6	32043	32048	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015875	A	6	6	32062	32067	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015875	A	6	6	32088	32093	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015875	TTGGT	2	10	32101	32110	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015875	GAAA	2	8	32140	32147	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015875	ATG	2	6	32175	32180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015875	CTT	2	6	32233	32238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_015875	AT	3	6	32283	32288	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015875	CCT	2	6	32309	32314	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_015875	CAT	2	6	32322	32327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_015875	CAT	2	6	32374	32379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_015875	AAG	2	6	32400	32405	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015875	GGAT	2	8	32432	32439	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015875	TAA	2	6	32479	32484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015875	AGG	2	6	32616	32621	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015875	TAT	2	6	37236	37241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015875	CAT	2	6	37309	37314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_015875	CTC	2	6	37319	37324	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
140	NC_015875	ACA	2	6	37326	37331	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_015875	ATG	2	6	37377	37382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_015875	TGG	2	6	37441	37446	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
143	NC_015875	CTA	2	6	37482	37487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_015875	ATA	2	6	37555	37560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_015875	GTA	2	6	37564	37569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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148	NC_015875	TCT	2	6	37930	37935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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