MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptococcus salivarius CCHSS3

Total Repeats: 6473

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015760	T	6	6	50	55	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015760	AAG	2	6	86	91	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015760	CTA	5	15	1580	1594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_015760	ATA	2	6	1597	1602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015760	TAA	2	6	1604	1609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015760	T	6	6	2790	2795	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015760	AG	3	6	2799	2804	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015760	TA	3	6	3020	3025	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015760	TCT	2	6	3092	3097	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_015760	T	6	6	3191	3196	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015760	AAAT	2	8	3203	3210	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015760	A	6	6	4334	4339	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015760	TAAG	2	8	8478	8485	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015760	CTATA	2	10	8491	8500	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_015760	CTTTT	2	10	8514	8523	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_015760	A	7	7	8604	8610	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015760	AGA	2	6	8620	8625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015760	GAT	2	6	11993	11998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015760	TAA	2	6	12015	12020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015760	TAAT	2	8	12604	12611	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015760	CTT	2	6	14605	14610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_015760	T	7	7	14609	14615	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015760	GA	3	6	14625	14630	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015760	A	7	7	14654	14660	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015760	GAT	2	6	14703	14708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015760	GA	3	6	14730	14735	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015760	A	6	6	14754	14759	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015760	A	7	7	14764	14770	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015760	AG	3	6	14818	14823	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015760	AGA	2	6	14869	14874	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015760	GAC	2	6	14911	14916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_015760	ATT	2	6	14940	14945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015760	T	6	6	14949	14954	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015760	GGC	2	6	14989	14994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_015760	AG	3	6	15024	15029	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015760	CTT	2	6	15039	15044	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_015760	ATTT	2	8	15151	15158	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015760	TAG	2	6	15206	15211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015760	CGA	2	6	15234	15239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_015760	GCA	2	6	15308	15313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_015760	CGC	2	6	15355	15360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_015760	GTGA	2	8	15361	15368	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015760	TGT	2	6	15394	15399	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015760	CAG	2	6	15477	15482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_015760	AGCG	2	8	15532	15539	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
46	NC_015760	AT	3	6	15661	15666	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015760	GGA	2	6	15667	15672	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015760	CT	3	6	15692	15697	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_015760	GAA	2	6	15931	15936	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015760	GGT	2	6	16005	16010	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015760	GTC	2	6	16019	16024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_015760	TCGTG	2	10	16028	16037	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
53	NC_015760	CAT	2	6	16087	16092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_015760	TAA	2	6	16122	16127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015760	GGA	2	6	16131	16136	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015760	ATC	2	6	16155	16160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_015760	AC	3	6	16182	16187	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_015760	TGGT	2	8	16197	16204	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015760	CGC	2	6	16321	16326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_015760	AC	3	6	16351	16356	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_015760	CAC	2	6	16366	16371	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_015760	AGCC	2	8	16413	16420	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
63	NC_015760	GAT	2	6	16436	16441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015760	CCT	2	6	16492	16497	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_015760	AGG	2	6	16594	16599	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015760	TAAT	2	8	16689	16696	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015760	ATAG	2	8	16702	16709	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015760	GTTAA	2	10	16774	16783	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015760	ACG	2	6	16837	16842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_015760	TAG	2	6	17008	17013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015760	GCGA	2	8	17016	17023	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
72	NC_015760	AGA	2	6	17095	17100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015760	AG	3	6	17123	17128	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015760	TCG	2	6	17198	17203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_015760	GGA	2	6	17211	17216	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015760	CT	3	6	17237	17242	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_015760	GGGAG	2	10	17292	17301	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015760	ACA	2	6	17329	17334	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_015760	ATG	2	6	17396	17401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015760	GGA	2	6	17529	17534	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015760	TC	3	6	17615	17620	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_015760	ACC	2	6	17794	17799	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_015760	AT	3	6	17815	17820	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015760	AGC	2	6	17874	17879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_015760	ATTC	2	8	17881	17888	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_015760	GAA	2	6	18008	18013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015760	GAG	2	6	18024	18029	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015760	GA	3	6	18154	18159	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015760	ACA	2	6	18180	18185	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_015760	TA	3	6	18208	18213	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015760	CTAA	2	8	18235	18242	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_015760	TAG	2	6	18337	18342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015760	GA	3	6	18449	18454	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015760	CT	3	6	18565	18570	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_015760	GAT	2	6	18583	18588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015760	CGG	2	6	18673	18678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_015760	GA	3	6	18771	18776	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015760	TAGG	2	8	18889	18896	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015760	GTT	2	6	18933	18938	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015760	TAC	2	6	18943	18948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_015760	CCT	2	6	19031	19036	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_015760	GGT	2	6	19167	19172	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015760	TCG	2	6	19282	19287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_015760	CGT	2	6	19362	19367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_015760	GTT	2	6	19465	19470	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015760	AGGGA	2	10	19500	19509	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015760	GA	3	6	19586	19591	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015760	GAAGTG	2	12	19611	19622	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015760	ACTAAT	2	12	19641	19652	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_015760	AAAG	2	8	19670	19677	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015760	TTGAG	2	10	19734	19743	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015760	GTG	2	6	19957	19962	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015760	AT	3	6	20114	20119	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015760	ACC	2	6	20319	20324	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_015760	CGT	2	6	20356	20361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_015760	GAG	2	6	20368	20373	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015760	ATA	2	6	20458	20463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015760	TAA	2	6	20464	20469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015760	CTC	2	6	20532	20537	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_015760	CGC	2	6	20698	20703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_015760	TA	4	8	20704	20711	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015760	AT	3	6	20795	20800	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015760	GGA	2	6	20815	20820	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015760	GCGT	2	8	20874	20881	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
125	NC_015760	TCC	2	6	20898	20903	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_015760	TCG	2	6	20938	20943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_015760	CGG	2	6	21038	21043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_015760	TGT	2	6	21112	21117	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015760	GGT	2	6	21224	21229	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015760	GTA	2	6	21340	21345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015760	T	7	7	21380	21386	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015760	T	6	6	22788	22793	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015760	AGT	2	6	22823	22828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015760	A	6	6	24300	24305	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015760	AAAT	2	8	24334	24341	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015760	TATCA	2	10	26047	26056	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
137	NC_015760	TTTTA	2	10	26071	26080	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015760	AGGTTA	2	12	26131	26142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_015760	ATTT	2	8	26177	26184	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015760	A	7	7	26203	26209	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_015760	TAG	2	6	26222	26227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_015760	GGA	2	6	26235	26240	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
143	NC_015760	AGCT	2	8	27216	27223	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
144	NC_015760	T	7	7	27233	27239	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_015760	T	8	8	29247	29254	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_015760	TAA	3	9	29323	29331	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_015760	ATA	2	6	29333	29338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_015760	GAAA	2	8	29399	29406	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
149	NC_015760	GTTT	2	8	29412	29419	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
150	NC_015760	T	6	6	29417	29422	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_015760	ATA	3	9	30711	30719	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_015760	TAA	2	6	30720	30725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_015760	TTG	2	6	30749	30754	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
154	NC_015760	T	6	6	30805	30810	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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157	NC_015760	GTT	2	6	30859	30864	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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184	NC_015760	TA	3	6	45060	45065	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
185	NC_015760	ATA	2	6	45068	45073	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
186	NC_015760	TA	3	6	45072	45077	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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286	NC_015760	CAT	2	6	69612	69617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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289	NC_015760	ATC	2	6	69680	69685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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291	NC_015760	TGGT	2	8	69722	69729	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
292	NC_015760	CGC	2	6	69846	69851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
293	NC_015760	AC	3	6	69876	69881	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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