MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Sulfobacillus acidophilus TPY chromosome

Total Repeats: 8134

< Previous12...567891011121314151617Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_015757	CCG	2	6	3475268	3475273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8002	NC_015757	TCA	2	6	3475290	3475295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8003	NC_015757	CTA	2	6	3475346	3475351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8004	NC_015757	CCA	2	6	3475379	3475384	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8005	NC_015757	GTT	2	6	3475396	3475401	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8006	NC_015757	AGCA	2	8	3475423	3475430	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8007	NC_015757	CCG	2	6	3475467	3475472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8008	NC_015757	ACTCA	2	10	3475711	3475720	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
8009	NC_015757	CCG	2	6	3475738	3475743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8010	NC_015757	A	6	6	3475795	3475800	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8011	NC_015757	C	6	6	3475840	3475845	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
8012	NC_015757	C	6	6	3475920	3475925	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
8013	NC_015757	GCC	2	6	3475936	3475941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8014	NC_015757	AAT	2	6	3476005	3476010	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8015	NC_015757	CCG	2	6	3476016	3476021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8016	NC_015757	TGGTG	2	10	3476773	3476782	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
8017	NC_015757	CT	3	6	3476880	3476885	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8018	NC_015757	TAA	2	6	3476925	3476930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8019	NC_015757	GGTC	2	8	3478013	3478020	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8020	NC_015757	CGA	2	6	3480139	3480144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8021	NC_015757	AC	3	6	3484159	3484164	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8022	NC_015757	CCG	2	6	3484281	3484286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8023	NC_015757	CGAC	2	8	3484348	3484355	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8024	NC_015757	GTC	2	6	3484366	3484371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8025	NC_015757	CTC	2	6	3484376	3484381	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8026	NC_015757	GTT	2	6	3485280	3485285	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8027	NC_015757	TCC	3	9	3486730	3486738	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8028	NC_015757	GC	3	6	3487670	3487675	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8029	NC_015757	AAG	2	6	3487693	3487698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8030	NC_015757	GTC	2	6	3487746	3487751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8031	NC_015757	TCC	2	6	3487823	3487828	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8032	NC_015757	AATTG	2	10	3487851	3487860	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
8033	NC_015757	GAG	2	6	3487919	3487924	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8034	NC_015757	CGG	2	6	3489546	3489551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8035	NC_015757	CCTC	2	8	3491294	3491301	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
8036	NC_015757	CGG	2	6	3491888	3491893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8037	NC_015757	CTC	2	6	3491911	3491916	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8038	NC_015757	AGG	2	6	3491935	3491940	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8039	NC_015757	ACA	2	6	3493006	3493011	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8040	NC_015757	GCAG	2	8	3493040	3493047	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8041	NC_015757	TCA	2	6	3493757	3493762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8042	NC_015757	CCG	2	6	3493763	3493768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8043	NC_015757	GAT	2	6	3493937	3493942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8044	NC_015757	AGG	2	6	3493995	3494000	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8045	NC_015757	GCCG	2	8	3494008	3494015	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8046	NC_015757	TCA	2	6	3494042	3494047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8047	NC_015757	CAG	2	6	3495910	3495915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8048	NC_015757	CCGA	2	8	3495916	3495923	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8049	NC_015757	ATTT	2	8	3496406	3496413	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8050	NC_015757	TCC	2	6	3497669	3497674	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8051	NC_015757	AAT	2	6	3497776	3497781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8052	NC_015757	CAA	2	6	3497783	3497788	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8053	NC_015757	ATT	2	6	3499350	3499355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8054	NC_015757	CAC	2	6	3499375	3499380	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8055	NC_015757	TCC	2	6	3501642	3501647	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8056	NC_015757	CT	3	6	3503341	3503346	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8057	NC_015757	TGG	2	6	3503353	3503358	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8058	NC_015757	TCC	2	6	3503856	3503861	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8059	NC_015757	TAT	2	6	3503880	3503885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8060	NC_015757	CCT	2	6	3503888	3503893	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8061	NC_015757	TCA	2	6	3503914	3503919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8062	NC_015757	TCA	2	6	3506142	3506147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8063	NC_015757	AAG	2	6	3506152	3506157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8064	NC_015757	ACA	2	6	3509202	3509207	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8065	NC_015757	ACC	2	6	3509216	3509221	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8066	NC_015757	ATGA	2	8	3510135	3510142	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8067	NC_015757	GTA	2	6	3511552	3511557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8068	NC_015757	TCC	2	6	3512299	3512304	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8069	NC_015757	GGC	2	6	3513954	3513959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8070	NC_015757	TCC	2	6	3515271	3515276	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8071	NC_015757	C	6	6	3516312	3516317	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
8072	NC_015757	TCCT	2	8	3517329	3517336	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8073	NC_015757	CCT	2	6	3518368	3518373	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8074	NC_015757	CCT	2	6	3519794	3519799	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8075	NC_015757	AGG	2	6	3521469	3521474	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8076	NC_015757	ACA	2	6	3522227	3522232	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8077	NC_015757	TCGG	2	8	3522268	3522275	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8078	NC_015757	T	6	6	3522276	3522281	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8079	NC_015757	CAT	2	6	3522348	3522353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8080	NC_015757	C	6	6	3523969	3523974	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
8081	NC_015757	TCG	2	6	3523975	3523980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8082	NC_015757	CTA	2	6	3523988	3523993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8083	NC_015757	TA	3	6	3524100	3524105	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8084	NC_015757	A	6	6	3524105	3524110	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8085	NC_015757	TCG	2	6	3524122	3524127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8086	NC_015757	TGCCGT	2	12	3525508	3525519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8087	NC_015757	ACA	2	6	3525609	3525614	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8088	NC_015757	GTG	2	6	3525637	3525642	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8089	NC_015757	GGA	2	6	3525685	3525690	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8090	NC_015757	ACGC	2	8	3525703	3525710	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8091	NC_015757	AGG	2	6	3525762	3525767	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8092	NC_015757	ATTCCT	2	12	3526277	3526288	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8093	NC_015757	TCAA	2	8	3526473	3526480	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8094	NC_015757	TTTA	2	8	3526692	3526699	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8095	NC_015757	AGA	2	6	3526734	3526739	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8096	NC_015757	GA	3	6	3526822	3526827	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8097	NC_015757	TCG	2	6	3526834	3526839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8098	NC_015757	CAC	2	6	3526878	3526883	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8099	NC_015757	CCTA	2	8	3526904	3526911	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
8100	NC_015757	GAAAA	2	10	3531802	3531811	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
8101	NC_015757	A	6	6	3531819	3531824	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8102	NC_015757	CGA	2	6	3531849	3531854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8103	NC_015757	CGA	2	6	3531979	3531984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8104	NC_015757	CCT	2	6	3533158	3533163	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8105	NC_015757	TC	3	6	3533210	3533215	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8106	NC_015757	A	7	7	3534335	3534341	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8107	NC_015757	A	6	6	3535403	3535408	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8108	NC_015757	TGT	2	6	3536735	3536740	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8109	NC_015757	CTTT	2	8	3540728	3540735	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8110	NC_015757	GCC	3	9	3540740	3540748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8111	NC_015757	CTC	2	6	3540772	3540777	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8112	NC_015757	TC	3	6	3540776	3540781	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8113	NC_015757	TGG	2	6	3541177	3541182	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8114	NC_015757	CCT	2	6	3541487	3541492	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8115	NC_015757	G	6	6	3541512	3541517	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
8116	NC_015757	GTG	2	6	3541537	3541542	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8117	NC_015757	CAG	2	6	3543480	3543485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8118	NC_015757	CCG	2	6	3543500	3543505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8119	NC_015757	AAT	2	6	3545138	3545143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8120	NC_015757	CCT	2	6	3548674	3548679	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8121	NC_015757	A	6	6	3549425	3549430	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8122	NC_015757	CG	3	6	3549446	3549451	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8123	NC_015757	TCC	2	6	3550154	3550159	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8124	NC_015757	AT	4	8	3550327	3550334	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8125	NC_015757	AACC	2	8	3550361	3550368	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8126	NC_015757	GAA	2	6	3550643	3550648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8127	NC_015757	T	6	6	3550716	3550721	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8128	NC_015757	TAT	2	6	3550913	3550918	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8129	NC_015757	CGT	2	6	3550950	3550955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8130	NC_015757	ATG	3	9	3551086	3551094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8131	NC_015757	GGA	2	6	3551116	3551121	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8132	NC_015757	ATT	2	6	3551125	3551130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8133	NC_015757	CAA	2	6	3551145	3551150	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8134	NC_015757	GAATC	2	10	3551197	3551206	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding

< Previous12...567891011121314151617Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.