MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Spirochaeta caldaria DSM 7334 chromosome

Total Repeats: 6076

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_015732	AGA	2	6	1875844	1875849	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3002	NC_015732	CCTA	2	8	1876709	1876716	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3003	NC_015732	CTT	2	6	1877159	1877164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3004	NC_015732	A	6	6	1877179	1877184	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3005	NC_015732	AGG	2	6	1884760	1884765	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_015732	C	7	7	1885969	1885975	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3007	NC_015732	T	6	6	1893428	1893433	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3008	NC_015732	ATT	2	6	1893457	1893462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3009	NC_015732	TCC	2	6	1893475	1893480	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3010	NC_015732	GAAAA	2	10	1893495	1893504	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
3011	NC_015732	T	6	6	1893520	1893525	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3012	NC_015732	ATTT	2	8	1893526	1893533	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3013	NC_015732	TAC	2	6	1893535	1893540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3014	NC_015732	TAG	2	6	1893550	1893555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3015	NC_015732	TAT	2	6	1894597	1894602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3016	NC_015732	TAG	2	6	1894626	1894631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3017	NC_015732	ATC	2	6	1896147	1896152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3018	NC_015732	AAT	2	6	1896215	1896220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_015732	T	6	6	1896243	1896248	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_015732	AAGG	2	8	1897090	1897097	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3021	NC_015732	ACT	2	6	1898192	1898197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3022	NC_015732	TAG	2	6	1898981	1898986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3023	NC_015732	GAG	2	6	1899050	1899055	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3024	NC_015732	GTT	2	6	1904243	1904248	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3025	NC_015732	CCT	2	6	1904249	1904254	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3026	NC_015732	CTA	2	6	1904266	1904271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3027	NC_015732	CTC	2	6	1906272	1906277	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3028	NC_015732	TCC	2	6	1910064	1910069	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3029	NC_015732	TCC	2	6	1910097	1910102	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3030	NC_015732	TTAT	2	8	1910150	1910157	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3031	NC_015732	AT	3	6	1910156	1910161	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3032	NC_015732	T	6	6	1910190	1910195	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3033	NC_015732	GAA	2	6	1910196	1910201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3034	NC_015732	AAG	2	6	1910261	1910266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3035	NC_015732	AGG	2	6	1910309	1910314	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3036	NC_015732	ATGAG	2	10	1910316	1910325	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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3038	NC_015732	AGT	2	6	1917289	1917294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3039	NC_015732	AAGGC	2	10	1917296	1917305	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
3040	NC_015732	AT	3	6	1917343	1917348	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3041	NC_015732	CTTT	2	8	1919785	1919792	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3042	NC_015732	TCC	2	6	1924252	1924257	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3043	NC_015732	A	6	6	1924283	1924288	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3044	NC_015732	TAA	2	6	1924315	1924320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3045	NC_015732	TTA	2	6	1924321	1924326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3047	NC_015732	C	10	10	1924421	1924430	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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3049	NC_015732	TTC	2	6	1926579	1926584	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3050	NC_015732	TTA	2	6	1926639	1926644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3051	NC_015732	CCTG	2	8	1926729	1926736	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3052	NC_015732	CGG	2	6	1926748	1926753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3053	NC_015732	CTG	2	6	1928165	1928170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3054	NC_015732	CTT	2	6	1928178	1928183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3055	NC_015732	A	6	6	1928217	1928222	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3056	NC_015732	TA	3	6	1928244	1928249	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3057	NC_015732	AT	3	6	1928280	1928285	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3058	NC_015732	AGATA	2	10	1928298	1928307	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
3059	NC_015732	AGA	2	6	1928308	1928313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3060	NC_015732	GAA	2	6	1928340	1928345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3061	NC_015732	A	6	6	1928410	1928415	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3062	NC_015732	CTTCG	2	10	1929964	1929973	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
3063	NC_015732	A	6	6	1930393	1930398	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3064	NC_015732	AAAT	2	8	1930403	1930410	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3065	NC_015732	A	7	7	1930457	1930463	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3066	NC_015732	A	6	6	1930509	1930514	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3067	NC_015732	AGA	2	6	1930539	1930544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3068	NC_015732	AAT	2	6	1930548	1930553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3069	NC_015732	ATGAA	2	10	1930646	1930655	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
3070	NC_015732	AAGAA	2	10	1930743	1930752	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
3071	NC_015732	GAA	2	6	1930797	1930802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3073	NC_015732	TGT	2	6	1930837	1930842	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3079	NC_015732	TCA	2	6	1931075	1931080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3081	NC_015732	ATA	2	6	1931135	1931140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3082	NC_015732	CG	3	6	1931936	1931941	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3083	NC_015732	GA	3	6	1931945	1931950	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3084	NC_015732	T	6	6	1931995	1932000	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3085	NC_015732	GGA	2	6	1932018	1932023	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3089	NC_015732	AGAAAT	2	12	1933439	1933450	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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3092	NC_015732	ATA	2	6	1933524	1933529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3093	NC_015732	A	6	6	1933559	1933564	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3094	NC_015732	AT	3	6	1933585	1933590	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3097	NC_015732	GGCT	2	8	1933699	1933706	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3098	NC_015732	GA	3	6	1933746	1933751	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3099	NC_015732	TCA	2	6	1933793	1933798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3101	NC_015732	ATA	2	6	1933853	1933858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3102	NC_015732	TAC	2	6	1934739	1934744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3103	NC_015732	ATTT	2	8	1934756	1934763	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3104	NC_015732	AAT	2	6	1934765	1934770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3105	NC_015732	CTA	2	6	1934805	1934810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3109	NC_015732	GAA	2	6	1934985	1934990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3110	NC_015732	A	6	6	1936518	1936523	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3111	NC_015732	ATA	2	6	1936576	1936581	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3112	NC_015732	ATT	2	6	1936607	1936612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3113	NC_015732	TAAT	2	8	1936625	1936632	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3114	NC_015732	TGA	2	6	1936678	1936683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3117	NC_015732	ATCAAG	2	12	1936952	1936963	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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3119	NC_015732	CG	3	6	1937952	1937957	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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3122	NC_015732	CGG	2	6	1939667	1939672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3123	NC_015732	TCT	2	6	1939684	1939689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3125	NC_015732	ACAT	2	8	1939715	1939722	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3126	NC_015732	TA	3	6	1939723	1939728	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3127	NC_015732	TGTA	2	8	1939729	1939736	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3128	NC_015732	GGA	2	6	1939739	1939744	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3129	NC_015732	GTT	2	6	1940624	1940629	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3130	NC_015732	AAC	2	6	1940927	1940932	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3131	NC_015732	TGT	2	6	1940953	1940958	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3133	NC_015732	ATA	2	6	1941059	1941064	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3401	NC_015732	ATT	2	6	1990759	1990764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3432	NC_015732	CTTCC	2	10	1992436	1992445	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
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3441	NC_015732	ATGC	2	8	1992791	1992798	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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