MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Spirochaeta caldaria DSM 7334 chromosome

Total Repeats: 6076

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_015732	GAA	2	6	3199372	3199377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6002	NC_015732	TCTGC	2	10	3199378	3199387	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
6003	NC_015732	C	9	9	3199436	3199444	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6004	NC_015732	AAG	2	6	3199449	3199454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6005	NC_015732	TTC	2	6	3199455	3199460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6006	NC_015732	AG	3	6	3199510	3199515	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6007	NC_015732	AGG	2	6	3199705	3199710	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6008	NC_015732	GCG	2	6	3199778	3199783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6009	NC_015732	ACC	3	9	3199822	3199830	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6010	NC_015732	TCC	2	6	3199848	3199853	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6011	NC_015732	AG	3	6	3199932	3199937	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6012	NC_015732	GCC	2	6	3199954	3199959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6013	NC_015732	CAA	2	6	3199961	3199966	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6014	NC_015732	TTC	2	6	3199980	3199985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6015	NC_015732	GA	3	6	3200067	3200072	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6016	NC_015732	CTT	2	6	3201648	3201653	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6017	NC_015732	AAG	2	6	3201670	3201675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6018	NC_015732	TTTA	2	8	3204762	3204769	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6019	NC_015732	TAA	2	6	3206945	3206950	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6020	NC_015732	ATG	2	6	3206958	3206963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6021	NC_015732	TAA	2	6	3211150	3211155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6022	NC_015732	ACA	2	6	3211158	3211163	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6023	NC_015732	GGA	2	6	3211165	3211170	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6024	NC_015732	TAT	2	6	3213896	3213901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6025	NC_015732	CCT	2	6	3215190	3215195	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6026	NC_015732	ATT	2	6	3215219	3215224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6027	NC_015732	GCT	3	9	3218295	3218303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6028	NC_015732	ATGCT	2	10	3218308	3218317	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
6029	NC_015732	A	8	8	3224821	3224828	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6030	NC_015732	AT	3	6	3225733	3225738	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6031	NC_015732	T	6	6	3225795	3225800	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6032	NC_015732	GTT	2	6	3225925	3225930	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6033	NC_015732	TAG	2	6	3225932	3225937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6034	NC_015732	TTAT	2	8	3230682	3230689	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6035	NC_015732	A	8	8	3231934	3231941	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6036	NC_015732	ATT	2	6	3231958	3231963	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6037	NC_015732	T	6	6	3232037	3232042	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6038	NC_015732	A	6	6	3232111	3232116	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6039	NC_015732	ATC	2	6	3232180	3232185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6040	NC_015732	ATG	2	6	3232221	3232226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6041	NC_015732	T	6	6	3232287	3232292	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6042	NC_015732	TAA	3	9	3232681	3232689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6043	NC_015732	AAG	2	6	3232730	3232735	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6044	NC_015732	GTT	2	6	3233131	3233136	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6045	NC_015732	TAT	2	6	3233323	3233328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6046	NC_015732	ATT	2	6	3233340	3233345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6047	NC_015732	CAA	2	6	3233961	3233966	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6048	NC_015732	GCGA	2	8	3233973	3233980	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6049	NC_015732	GAT	2	6	3234023	3234028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6050	NC_015732	AGT	2	6	3234078	3234083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6051	NC_015732	GGA	2	6	3234137	3234142	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6052	NC_015732	T	7	7	3234143	3234149	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6053	NC_015732	AAT	2	6	3234157	3234162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6054	NC_015732	TCT	2	6	3234188	3234193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6055	NC_015732	TCC	2	6	3234202	3234207	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6056	NC_015732	TTCCTT	2	12	3234238	3234249	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6057	NC_015732	CCT	2	6	3234295	3234300	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6058	NC_015732	GTT	2	6	3234354	3234359	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6059	NC_015732	AAC	2	6	3234387	3234392	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6060	NC_015732	TATT	2	8	3234398	3234405	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6061	NC_015732	TTC	2	6	3234439	3234444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6062	NC_015732	AT	3	6	3234466	3234471	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6063	NC_015732	TAT	3	9	3234469	3234477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6064	NC_015732	TA	4	8	3237048	3237055	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6065	NC_015732	ATT	2	6	3239104	3239109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6066	NC_015732	ATT	2	6	3239149	3239154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6067	NC_015732	ATA	2	6	3239155	3239160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6068	NC_015732	ATT	3	9	3239193	3239201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6069	NC_015732	A	6	6	3239208	3239213	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6070	NC_015732	TTTTA	2	10	3239215	3239224	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
6071	NC_015732	TTA	3	9	3239222	3239230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6072	NC_015732	TA	4	8	3239229	3239236	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6073	NC_015732	TTTTA	2	10	3239238	3239247	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
6074	NC_015732	ACT	2	6	3239250	3239255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6075	NC_015732	A	6	6	3239280	3239285	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6076	NC_015732	A	6	6	3239301	3239306	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.