MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Spirochaeta caldaria DSM 7334 chromosome

Total Repeats: 6076

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_015732	GCA	2	6	2687246	2687251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5002	NC_015732	TGG	2	6	2687296	2687301	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_015732	C	6	6	2687365	2687370	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5004	NC_015732	TGA	2	6	2687927	2687932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_015732	GCA	2	6	2687954	2687959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5006	NC_015732	TGC	2	6	2687978	2687983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5007	NC_015732	TGG	2	6	2688032	2688037	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5008	NC_015732	C	6	6	2688101	2688106	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5009	NC_015732	CGCTG	2	10	2688170	2688179	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
5010	NC_015732	TGGC	2	8	2688213	2688220	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5011	NC_015732	GGA	2	6	2688230	2688235	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5012	NC_015732	CTG	2	6	2688240	2688245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5013	NC_015732	CGG	2	6	2688262	2688267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5014	NC_015732	GCC	2	6	2688299	2688304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5015	NC_015732	CCT	2	6	2688425	2688430	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5016	NC_015732	ACCT	2	8	2688454	2688461	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5017	NC_015732	ATC	2	6	2692961	2692966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5018	NC_015732	TAT	2	6	2692998	2693003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5019	NC_015732	T	7	7	2693026	2693032	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5020	NC_015732	GGA	2	6	2693054	2693059	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5021	NC_015732	GTG	2	6	2696033	2696038	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5022	NC_015732	A	8	8	2696060	2696067	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5023	NC_015732	TA	3	6	2701662	2701667	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5024	NC_015732	ATT	2	6	2701676	2701681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5025	NC_015732	ATC	2	6	2706423	2706428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5026	NC_015732	TATC	2	8	2707095	2707102	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5027	NC_015732	AC	3	6	2709210	2709215	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5028	NC_015732	TGAT	2	8	2709348	2709355	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5029	NC_015732	TCA	2	6	2709382	2709387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5030	NC_015732	ATT	2	6	2709390	2709395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5031	NC_015732	GAA	2	6	2709401	2709406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5032	NC_015732	A	6	6	2709420	2709425	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_015732	ATTT	2	8	2709429	2709436	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5034	NC_015732	TAA	2	6	2709457	2709462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5035	NC_015732	GAA	2	6	2709665	2709670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5036	NC_015732	CAG	2	6	2709801	2709806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5037	NC_015732	AGA	2	6	2709829	2709834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5038	NC_015732	A	7	7	2709851	2709857	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5039	NC_015732	GAA	2	6	2709923	2709928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5040	NC_015732	ATT	2	6	2709959	2709964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5041	NC_015732	CTA	2	6	2710003	2710008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5042	NC_015732	ATT	2	6	2710832	2710837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_015732	T	8	8	2710836	2710843	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_015732	TA	3	6	2710870	2710875	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5045	NC_015732	AGG	2	6	2710900	2710905	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5046	NC_015732	A	8	8	2711461	2711468	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5047	NC_015732	AT	3	6	2713356	2713361	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5048	NC_015732	CCT	2	6	2713405	2713410	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5049	NC_015732	GAG	2	6	2713458	2713463	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5050	NC_015732	CATT	2	8	2713514	2713521	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5051	NC_015732	GAAAC	2	10	2715723	2715732	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
5052	NC_015732	CAA	2	6	2715774	2715779	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5053	NC_015732	TCC	2	6	2720839	2720844	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5054	NC_015732	GTT	2	6	2721449	2721454	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5055	NC_015732	T	6	6	2721453	2721458	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5056	NC_015732	ACC	2	6	2721469	2721474	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5057	NC_015732	ACT	2	6	2721492	2721497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5058	NC_015732	CAAG	2	8	2721501	2721508	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5059	NC_015732	GTTT	2	8	2721518	2721525	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5060	NC_015732	A	7	7	2721558	2721564	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5061	NC_015732	GAG	2	6	2723478	2723483	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5062	NC_015732	TCC	2	6	2725198	2725203	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5063	NC_015732	ATT	2	6	2725278	2725283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5064	NC_015732	A	7	7	2725291	2725297	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5065	NC_015732	TCC	2	6	2729153	2729158	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5066	NC_015732	TGA	2	6	2729171	2729176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5067	NC_015732	T	6	6	2729197	2729202	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5068	NC_015732	TGT	2	6	2729204	2729209	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5069	NC_015732	TA	4	8	2729216	2729223	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5070	NC_015732	A	6	6	2729229	2729234	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5071	NC_015732	CAA	2	6	2729332	2729337	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5072	NC_015732	A	6	6	2729407	2729412	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5073	NC_015732	A	8	8	2733184	2733191	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5074	NC_015732	CA	3	6	2733196	2733201	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5075	NC_015732	TAA	2	6	2733284	2733289	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5076	NC_015732	TAA	2	6	2733293	2733298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5077	NC_015732	AAT	2	6	2733308	2733313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5078	NC_015732	CTAT	2	8	2733319	2733326	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5079	NC_015732	ATCTAC	2	12	2733340	2733351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5080	NC_015732	CTA	2	6	2735654	2735659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5081	NC_015732	AT	3	6	2735673	2735678	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5082	NC_015732	ATA	2	6	2735699	2735704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5083	NC_015732	TAT	3	9	2738792	2738800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5084	NC_015732	ATA	2	6	2738805	2738810	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5085	NC_015732	CAT	2	6	2738848	2738853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5086	NC_015732	CT	3	6	2738862	2738867	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5087	NC_015732	GCT	2	6	2738889	2738894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5088	NC_015732	TATT	2	8	2738906	2738913	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5089	NC_015732	C	9	9	2738922	2738930	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5090	NC_015732	T	6	6	2738941	2738946	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5091	NC_015732	GTA	2	6	2738955	2738960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5092	NC_015732	ACC	2	6	2738987	2738992	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5093	NC_015732	ATC	3	9	2738993	2739001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5094	NC_015732	G	6	6	2739017	2739022	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5095	NC_015732	T	7	7	2739092	2739098	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5096	NC_015732	CGG	2	6	2740053	2740058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5097	NC_015732	AGG	2	6	2740103	2740108	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5098	NC_015732	TAT	2	6	2746097	2746102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5099	NC_015732	ATA	2	6	2746130	2746135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5100	NC_015732	A	6	6	2746150	2746155	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5101	NC_015732	GCT	2	6	2746198	2746203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5102	NC_015732	TAT	2	6	2747005	2747010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5103	NC_015732	TAC	2	6	2747061	2747066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5104	NC_015732	CTG	2	6	2747160	2747165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5105	NC_015732	CAA	2	6	2747166	2747171	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5106	NC_015732	CAA	2	6	2747178	2747183	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5107	NC_015732	CTG	2	6	2747187	2747192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5108	NC_015732	T	7	7	2747193	2747199	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5109	NC_015732	T	6	6	2747216	2747221	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5110	NC_015732	GAACCT	2	12	2747243	2747254	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
5111	NC_015732	CAC	2	6	2747273	2747278	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5112	NC_015732	ATG	2	6	2747310	2747315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5113	NC_015732	CAC	2	6	2747328	2747333	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5114	NC_015732	CCT	2	6	2747806	2747811	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5115	NC_015732	CAG	2	6	2748236	2748241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5117	NC_015732	ATT	2	6	2748341	2748346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5118	NC_015732	AAC	2	6	2748357	2748362	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5119	NC_015732	ACA	2	6	2748578	2748583	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5120	NC_015732	CAG	2	6	2748592	2748597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5121	NC_015732	GCC	2	6	2748600	2748605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5122	NC_015732	GCA	2	6	2748608	2748613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5123	NC_015732	T	6	6	2749342	2749347	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5124	NC_015732	GCC	2	6	2751626	2751631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5125	NC_015732	TCC	2	6	2751647	2751652	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5126	NC_015732	A	7	7	2751685	2751691	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5127	NC_015732	A	6	6	2751705	2751710	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5128	NC_015732	CTAA	2	8	2751744	2751751	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5129	NC_015732	T	6	6	2752583	2752588	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5130	NC_015732	TTC	2	6	2754116	2754121	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5132	NC_015732	CTT	2	6	2754156	2754161	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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