MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Spirochaeta caldaria DSM 7334 chromosome

Total Repeats: 6076

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_015732	AAAT	2	8	2460458	2460465	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4502	NC_015732	TTA	2	6	2460492	2460497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4503	NC_015732	T	6	6	2460540	2460545	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4504	NC_015732	TTC	2	6	2462073	2462078	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4505	NC_015732	CTT	2	6	2462085	2462090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4506	NC_015732	CTT	2	6	2462113	2462118	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4507	NC_015732	GTT	2	6	2462128	2462133	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4508	NC_015732	ATT	2	6	2462165	2462170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4509	NC_015732	TAA	2	6	2462187	2462192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4510	NC_015732	TAG	2	6	2462232	2462237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4511	NC_015732	TAA	2	6	2462320	2462325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4512	NC_015732	AT	3	6	2462382	2462387	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4513	NC_015732	A	6	6	2462392	2462397	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4514	NC_015732	TG	3	6	2462411	2462416	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4515	NC_015732	ACTCC	2	10	2462453	2462462	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
4516	NC_015732	TAT	2	6	2462526	2462531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4517	NC_015732	T	6	6	2462534	2462539	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4518	NC_015732	AAC	2	6	2462548	2462553	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4519	NC_015732	TTTC	2	8	2462620	2462627	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4520	NC_015732	AAACC	2	10	2462634	2462643	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
4521	NC_015732	GAAC	2	8	2462672	2462679	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4522	NC_015732	ATA	2	6	2462755	2462760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4523	NC_015732	GAA	2	6	2462811	2462816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4524	NC_015732	ATTA	2	8	2462838	2462845	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4525	NC_015732	AATTA	2	10	2462871	2462880	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4526	NC_015732	AT	3	6	2462892	2462897	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4527	NC_015732	TTA	2	6	2462898	2462903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4528	NC_015732	GAAAAA	2	12	2462911	2462922	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4529	NC_015732	CCTT	2	8	2464187	2464194	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4530	NC_015732	AT	3	6	2464290	2464295	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4531	NC_015732	GCA	2	6	2464364	2464369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4532	NC_015732	CCTT	2	8	2465534	2465541	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4533	NC_015732	TCT	2	6	2465668	2465673	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4534	NC_015732	AT	3	6	2465687	2465692	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4535	NC_015732	ATT	2	6	2465704	2465709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4536	NC_015732	TAT	2	6	2465710	2465715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4537	NC_015732	AT	3	6	2465949	2465954	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4538	NC_015732	CCTT	2	8	2466463	2466470	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4539	NC_015732	T	8	8	2466522	2466529	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4540	NC_015732	CTT	2	6	2466533	2466538	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4541	NC_015732	TAT	2	6	2466587	2466592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4542	NC_015732	TA	3	6	2466595	2466600	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4543	NC_015732	CCTT	2	8	2467930	2467937	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4544	NC_015732	AT	3	6	2468033	2468038	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4545	NC_015732	TGA	2	6	2468096	2468101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4546	NC_015732	CCT	2	6	2468124	2468129	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4547	NC_015732	TCCT	2	8	2468154	2468161	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4548	NC_015732	A	6	6	2468163	2468168	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4549	NC_015732	CCTT	2	8	2469879	2469886	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4550	NC_015732	AT	3	6	2469919	2469924	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4551	NC_015732	ATT	2	6	2469936	2469941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4552	NC_015732	TAT	2	6	2469942	2469947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4553	NC_015732	AT	3	6	2470181	2470186	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4554	NC_015732	CCTT	2	8	2470695	2470702	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4555	NC_015732	T	6	6	2470754	2470759	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4556	NC_015732	CTT	2	6	2470763	2470768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4557	NC_015732	TAT	2	6	2470817	2470822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4558	NC_015732	TA	3	6	2470825	2470830	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4559	NC_015732	CCT	2	6	2471536	2471541	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4560	NC_015732	CCTT	2	8	2472160	2472167	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4561	NC_015732	AT	3	6	2472263	2472268	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4562	NC_015732	GCA	2	6	2472337	2472342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4563	NC_015732	CCTT	2	8	2473507	2473514	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4564	NC_015732	TAAA	2	8	2473674	2473681	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4565	NC_015732	TAT	2	6	2473784	2473789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4566	NC_015732	TAG	2	6	2473838	2473843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4567	NC_015732	AACAG	2	10	2473845	2473854	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
4568	NC_015732	TAA	2	6	2473908	2473913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4569	NC_015732	T	6	6	2473920	2473925	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4570	NC_015732	TA	3	6	2473931	2473936	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4571	NC_015732	AGT	2	6	2473966	2473971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4572	NC_015732	ATT	2	6	2473995	2474000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4573	NC_015732	AGT	2	6	2474004	2474009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4574	NC_015732	AAT	2	6	2474160	2474165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4575	NC_015732	CAA	2	6	2474330	2474335	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4576	NC_015732	TAC	2	6	2474364	2474369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4577	NC_015732	AAAT	2	8	2474430	2474437	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4578	NC_015732	AG	3	6	2474474	2474479	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4579	NC_015732	A	6	6	2474480	2474485	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4580	NC_015732	TGT	2	6	2474497	2474502	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4581	NC_015732	AGC	2	6	2474523	2474528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4582	NC_015732	TCTT	2	8	2474605	2474612	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4583	NC_015732	ATA	2	6	2474616	2474621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4584	NC_015732	TAT	2	6	2474627	2474632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4585	NC_015732	ATA	2	6	2474681	2474686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4586	NC_015732	AAC	2	6	2475063	2475068	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4587	NC_015732	CCA	2	6	2475121	2475126	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4588	NC_015732	TAA	2	6	2475152	2475157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4589	NC_015732	T	6	6	2475173	2475178	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4590	NC_015732	TCC	2	6	2475186	2475191	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4591	NC_015732	TA	3	6	2475239	2475244	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4592	NC_015732	CAT	2	6	2475247	2475252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4593	NC_015732	CT	3	6	2475281	2475286	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4594	NC_015732	ATA	2	6	2475298	2475303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4595	NC_015732	A	7	7	2475369	2475375	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4596	NC_015732	CCT	2	6	2476381	2476386	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4597	NC_015732	CTT	2	6	2476428	2476433	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4598	NC_015732	TAAC	2	8	2476533	2476540	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4599	NC_015732	CTT	2	6	2477808	2477813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4600	NC_015732	CCT	2	6	2477856	2477861	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4601	NC_015732	T	6	6	2477864	2477869	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4602	NC_015732	CGG	2	6	2477892	2477897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4603	NC_015732	CAG	2	6	2477944	2477949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4604	NC_015732	AGG	2	6	2477963	2477968	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4605	NC_015732	GGC	2	6	2477994	2477999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4606	NC_015732	GGA	2	6	2478000	2478005	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4607	NC_015732	GGAAGA	2	12	2478021	2478032	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4608	NC_015732	TGA	2	6	2478045	2478050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4609	NC_015732	G	6	6	2478051	2478056	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4610	NC_015732	GCC	2	6	2478073	2478078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4611	NC_015732	TGGC	2	8	2478110	2478117	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4612	NC_015732	GGA	2	6	2478122	2478127	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4613	NC_015732	GAT	2	6	2478149	2478154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4614	NC_015732	ACC	2	6	2478198	2478203	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4615	NC_015732	GCC	2	6	2478322	2478327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4616	NC_015732	GGC	2	6	2478399	2478404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4617	NC_015732	GAA	2	6	2478447	2478452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4618	NC_015732	ATC	2	6	2478516	2478521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4619	NC_015732	GGA	2	6	2478638	2478643	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4620	NC_015732	CCT	2	6	2478662	2478667	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4621	NC_015732	TAG	2	6	2478676	2478681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4622	NC_015732	AGA	2	6	2478950	2478955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4623	NC_015732	CCT	2	6	2479075	2479080	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4624	NC_015732	GGA	2	6	2479151	2479156	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4625	NC_015732	CGG	2	6	2479171	2479176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4626	NC_015732	TGT	2	6	2484345	2484350	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4627	NC_015732	A	7	7	2486142	2486148	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4628	NC_015732	AGG	2	6	2489359	2489364	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4629	NC_015732	T	6	6	2490377	2490382	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4630	NC_015732	T	6	6	2493985	2493990	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4631	NC_015732	TCC	2	6	2497644	2497649	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4632	NC_015732	CCT	2	6	2499511	2499516	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4633	NC_015732	TAC	2	6	2499528	2499533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4634	NC_015732	ATTT	2	8	2499585	2499592	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4635	NC_015732	TAT	2	6	2499594	2499599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4636	NC_015732	TAAT	2	8	2499602	2499609	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4637	NC_015732	AT	3	6	2499621	2499626	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4638	NC_015732	A	6	6	2501761	2501766	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4639	NC_015732	A	6	6	2501772	2501777	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4640	NC_015732	TA	3	6	2501788	2501793	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4654	NC_015732	TAC	2	6	2505693	2505698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4668	NC_015732	A	6	6	2506412	2506417	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4674	NC_015732	A	6	6	2506774	2506779	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4684	NC_015732	A	6	6	2509315	2509320	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4750	NC_015732	TA	3	6	2547265	2547270	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4751	NC_015732	ATT	2	6	2547299	2547304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4752	NC_015732	T	6	6	2547323	2547328	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4753	NC_015732	AG	4	8	2547365	2547372	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4754	NC_015732	GTT	2	6	2547374	2547379	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4755	NC_015732	ATTT	2	8	2547386	2547393	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4756	NC_015732	T	7	7	2547391	2547397	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4757	NC_015732	ATT	2	6	2547500	2547505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4758	NC_015732	T	7	7	2547514	2547520	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4759	NC_015732	TAA	2	6	2547634	2547639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4762	NC_015732	CAA	2	6	2550549	2550554	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4763	NC_015732	CCT	2	6	2550562	2550567	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4898	NC_015732	A	6	6	2632252	2632257	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4899	NC_015732	TA	3	6	2632259	2632264	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4900	NC_015732	T	8	8	2632285	2632292	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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