MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Simkania negevensis Z chromosome gsn.131

Total Repeats: 5192

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_015713	ATTT	2	8	2424971	2424978	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5002	NC_015713	T	8	8	2425056	2425063	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_015713	AAG	2	6	2425099	2425104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_015713	GAA	2	6	2425110	2425115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_015713	A	7	7	2425173	2425179	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_015713	TAA	2	6	2427250	2427255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5007	NC_015713	ATA	2	6	2427266	2427271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5008	NC_015713	ATTA	2	8	2427278	2427285	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5009	NC_015713	ATTA	2	8	2427302	2427309	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_015713	AAG	2	6	2427320	2427325	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5011	NC_015713	AGA	2	6	2427551	2427556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5012	NC_015713	GCC	2	6	2430135	2430140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5013	NC_015713	T	6	6	2430156	2430161	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5014	NC_015713	CAT	2	6	2430179	2430184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5016	NC_015713	TAA	3	9	2430199	2430207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5017	NC_015713	ATT	3	9	2430215	2430223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5018	NC_015713	ATT	2	6	2430234	2430239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5019	NC_015713	A	6	6	2430243	2430248	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5020	NC_015713	ATT	2	6	2430307	2430312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5021	NC_015713	A	7	7	2430403	2430409	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5022	NC_015713	GGA	2	6	2430454	2430459	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5023	NC_015713	GAA	2	6	2430475	2430480	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5024	NC_015713	TGGGA	2	10	2432649	2432658	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
5025	NC_015713	T	9	9	2436668	2436676	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5026	NC_015713	CAC	2	6	2436710	2436715	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5027	NC_015713	T	7	7	2436794	2436800	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5033	NC_015713	TTTTC	2	10	2438633	2438642	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
5034	NC_015713	TTC	2	6	2439776	2439781	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5056	NC_015713	T	8	8	2447627	2447634	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5063	NC_015713	A	6	6	2447839	2447844	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5069	NC_015713	ATT	2	6	2449130	2449135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5084	NC_015713	CAAGC	2	10	2465342	2465351	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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5099	NC_015713	CTTTT	2	10	2476605	2476614	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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5101	NC_015713	GAA	2	6	2476697	2476702	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5103	NC_015713	TTA	2	6	2476744	2476749	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5105	NC_015713	A	6	6	2476807	2476812	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5106	NC_015713	TATT	2	8	2476865	2476872	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5107	NC_015713	A	6	6	2476892	2476897	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5112	NC_015713	TA	3	6	2478381	2478386	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5113	NC_015713	CAT	2	6	2487193	2487198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5115	NC_015713	CAA	2	6	2487272	2487277	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5116	NC_015713	A	6	6	2487285	2487290	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5117	NC_015713	GCA	2	6	2487345	2487350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5119	NC_015713	CA	3	6	2488377	2488382	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5120	NC_015713	TAG	2	6	2488393	2488398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5125	NC_015713	A	7	7	2488532	2488538	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5126	NC_015713	A	6	6	2488547	2488552	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5127	NC_015713	A	8	8	2490180	2490187	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5128	NC_015713	T	6	6	2490198	2490203	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5129	NC_015713	C	9	9	2491286	2491294	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5130	NC_015713	TCA	3	9	2491295	2491303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5131	NC_015713	T	6	6	2491363	2491368	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5132	NC_015713	CTT	2	6	2491446	2491451	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5134	NC_015713	GTT	2	6	2491526	2491531	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5135	NC_015713	CTT	2	6	2491533	2491538	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5136	NC_015713	ATA	2	6	2491552	2491557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5151	NC_015713	A	6	6	2492130	2492135	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5155	NC_015713	CAGT	2	8	2492288	2492295	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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5177	NC_015713	TCAA	2	8	2494577	2494584	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5178	NC_015713	TG	3	6	2494595	2494600	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5179	NC_015713	TAA	2	6	2494623	2494628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5180	NC_015713	CCT	2	6	2494714	2494719	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5181	NC_015713	TAT	2	6	2494764	2494769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.