MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Sphingobium chlorophenolicum L-1 chromosome 2

Total Repeats: 3716

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_015594	CAT	2	6	1287578	1287583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3502	NC_015594	CGACG	2	10	1287584	1287593	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
3503	NC_015594	GA	3	6	1289246	1289251	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3504	NC_015594	G	6	6	1290095	1290100	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3505	NC_015594	GCC	2	6	1290109	1290114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3506	NC_015594	AAT	2	6	1290840	1290845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3507	NC_015594	GAA	2	6	1290902	1290907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3508	NC_015594	GC	3	6	1290925	1290930	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3509	NC_015594	GGCCG	2	10	1290966	1290975	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
3510	NC_015594	ATCC	2	8	1291619	1291626	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3511	NC_015594	TCGA	2	8	1291630	1291637	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3512	NC_015594	CCA	2	6	1291669	1291674	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3513	NC_015594	TC	3	6	1291675	1291680	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3514	NC_015594	ACT	2	6	1291746	1291751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3515	NC_015594	CCT	2	6	1292156	1292161	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3516	NC_015594	CAT	2	6	1292175	1292180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3517	NC_015594	TCC	2	6	1294254	1294259	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3518	NC_015594	TTAT	2	8	1294287	1294294	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3519	NC_015594	AAT	2	6	1294331	1294336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3520	NC_015594	CGC	2	6	1294365	1294370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3521	NC_015594	CCG	2	6	1294949	1294954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3522	NC_015594	GGT	2	6	1295668	1295673	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3523	NC_015594	C	6	6	1295685	1295690	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3524	NC_015594	GAGCG	2	10	1295725	1295734	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
3525	NC_015594	GAA	2	6	1295757	1295762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3526	NC_015594	CGC	2	6	1295763	1295768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3527	NC_015594	GCG	2	6	1295773	1295778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3528	NC_015594	GGGA	2	8	1295805	1295812	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3529	NC_015594	GAA	2	6	1295814	1295819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3530	NC_015594	CGC	2	6	1295860	1295865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3531	NC_015594	GCC	2	6	1296275	1296280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3532	NC_015594	AT	3	6	1296300	1296305	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3533	NC_015594	AT	3	6	1298336	1298341	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3534	NC_015594	GAA	2	6	1298419	1298424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3535	NC_015594	CG	3	6	1298443	1298448	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3536	NC_015594	CCG	2	6	1298454	1298459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3537	NC_015594	AGG	2	6	1298464	1298469	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3538	NC_015594	CCGC	2	8	1298519	1298526	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3539	NC_015594	A	6	6	1298534	1298539	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3541	NC_015594	GA	3	6	1299671	1299676	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3542	NC_015594	GGA	2	6	1299680	1299685	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3543	NC_015594	ATT	2	6	1301957	1301962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3544	NC_015594	CGC	2	6	1302049	1302054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3545	NC_015594	GCC	2	6	1302103	1302108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3546	NC_015594	CT	4	8	1303945	1303952	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3547	NC_015594	CGGG	2	8	1303977	1303984	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3548	NC_015594	AT	3	6	1304042	1304047	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3549	NC_015594	TTG	2	6	1304063	1304068	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3550	NC_015594	TCT	2	6	1304075	1304080	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3551	NC_015594	GCT	2	6	1304089	1304094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3552	NC_015594	CCG	2	6	1304179	1304184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3553	NC_015594	TGG	2	6	1304197	1304202	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3554	NC_015594	GCC	2	6	1304230	1304235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3555	NC_015594	GGC	2	6	1304242	1304247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3557	NC_015594	GAGCG	2	10	1306059	1306068	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
3558	NC_015594	CG	3	6	1306110	1306115	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3559	NC_015594	GCA	2	6	1306155	1306160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3560	NC_015594	ATG	2	6	1306235	1306240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3561	NC_015594	GAA	2	6	1307205	1307210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3562	NC_015594	ATT	2	6	1307262	1307267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3563	NC_015594	AGCA	2	8	1307298	1307305	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3564	NC_015594	CAA	2	6	1307323	1307328	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3565	NC_015594	GAA	2	6	1307355	1307360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3566	NC_015594	TTC	2	6	1307369	1307374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3569	NC_015594	G	8	8	1308415	1308422	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3570	NC_015594	C	7	7	1308440	1308446	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3571	NC_015594	G	6	6	1308492	1308497	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3572	NC_015594	G	6	6	1308528	1308533	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3573	NC_015594	TGGG	2	8	1308539	1308546	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
3574	NC_015594	GGAC	2	8	1308547	1308554	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3575	NC_015594	TCC	2	6	1308564	1308569	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3576	NC_015594	GGA	2	6	1308584	1308589	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3579	NC_015594	CGGC	2	8	1309835	1309842	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3580	NC_015594	TC	3	6	1309857	1309862	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3581	NC_015594	AAT	2	6	1309869	1309874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3583	NC_015594	GCG	2	6	1309888	1309893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3587	NC_015594	T	8	8	1313265	1313272	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3588	NC_015594	AAAGGG	2	12	1313450	1313461	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3589	NC_015594	CCCTTT	2	12	1313476	1313487	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3590	NC_015594	T	6	6	1313485	1313490	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3592	NC_015594	GAG	2	6	1314368	1314373	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3593	NC_015594	GGA	2	6	1314375	1314380	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3595	NC_015594	T	6	6	1314460	1314465	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3596	NC_015594	AG	3	6	1316470	1316475	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3597	NC_015594	AGGG	2	8	1316542	1316549	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3598	NC_015594	GCCGG	2	10	1316556	1316565	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
3599	NC_015594	GCCCG	3	15	1316575	1316589	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
3600	NC_015594	G	6	6	1317471	1317476	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3601	NC_015594	T	7	7	1319058	1319064	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3602	NC_015594	AAG	2	6	1319069	1319074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3603	NC_015594	GGC	2	6	1319375	1319380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3604	NC_015594	CCA	2	6	1319661	1319666	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3605	NC_015594	AG	3	6	1319686	1319691	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3606	NC_015594	CT	3	6	1319700	1319705	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3607	NC_015594	ATAGG	2	10	1319737	1319746	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
3608	NC_015594	CTC	2	6	1319751	1319756	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3609	NC_015594	CAA	2	6	1320606	1320611	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3610	NC_015594	GC	3	6	1320700	1320705	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3611	NC_015594	C	7	7	1320737	1320743	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3612	NC_015594	CG	3	6	1320813	1320818	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3613	NC_015594	CCCT	2	8	1322507	1322514	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3614	NC_015594	GCA	2	6	1322543	1322548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3615	NC_015594	TGG	2	6	1322549	1322554	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3616	NC_015594	CG	3	6	1322598	1322603	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3617	NC_015594	GGA	2	6	1322628	1322633	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3619	NC_015594	GGC	2	6	1323323	1323328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3624	NC_015594	ATA	2	6	1324601	1324606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3625	NC_015594	ATG	2	6	1324609	1324614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3626	NC_015594	ATA	2	6	1324615	1324620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3627	NC_015594	GCGG	2	8	1324649	1324656	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3628	NC_015594	AT	3	6	1324658	1324663	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3629	NC_015594	GGC	2	6	1324673	1324678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3630	NC_015594	GCC	2	6	1324684	1324689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3631	NC_015594	GTT	2	6	1329087	1329092	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3632	NC_015594	TCGCT	2	10	1329115	1329124	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
3633	NC_015594	TCC	2	6	1330027	1330032	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3634	NC_015594	GGA	2	6	1330047	1330052	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3635	NC_015594	TCT	2	6	1330343	1330348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3636	NC_015594	TCG	3	9	1330384	1330392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3637	NC_015594	CTG	2	6	1330451	1330456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3638	NC_015594	T	7	7	1330467	1330473	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3639	NC_015594	TGC	2	6	1330483	1330488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3648	NC_015594	CTT	2	6	1331700	1331705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3657	NC_015594	GCG	2	6	1335093	1335098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3658	NC_015594	CGATC	2	10	1335099	1335108	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
3659	NC_015594	TAAA	2	8	1335184	1335191	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3660	NC_015594	GGA	2	6	1335234	1335239	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3664	NC_015594	GGC	2	6	1338368	1338373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3665	NC_015594	TCC	2	6	1338390	1338395	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3667	NC_015594	CT	3	6	1338434	1338439	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3668	NC_015594	TGG	2	6	1338455	1338460	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3672	NC_015594	GTC	2	6	1339989	1339994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3673	NC_015594	GCC	2	6	1340021	1340026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3674	NC_015594	CATGC	2	10	1340039	1340048	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
3675	NC_015594	AAT	2	6	1340057	1340062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3676	NC_015594	GGA	2	6	1344349	1344354	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3681	NC_015594	GCCA	2	8	1345976	1345983	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3682	NC_015594	GC	3	6	1346004	1346009	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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