MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Serratia plymuthica AS9 chromosome

Total Repeats: 14640

< Previous12...18192021222324252627282930Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14501	NC_015567	ACG	2	6	5392852	5392857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14502	NC_015567	GT	3	6	5392920	5392925	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14503	NC_015567	ATG	2	6	5392945	5392950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14504	NC_015567	TCC	2	6	5392971	5392976	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14505	NC_015567	CCGA	2	8	5393007	5393014	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
14506	NC_015567	CAA	2	6	5393023	5393028	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14507	NC_015567	GAC	2	6	5393084	5393089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14508	NC_015567	GCA	2	6	5393096	5393101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14509	NC_015567	TTC	2	6	5393172	5393177	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14510	NC_015567	GCC	2	6	5393415	5393420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14511	NC_015567	TCC	2	6	5393435	5393440	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14512	NC_015567	C	6	6	5393479	5393484	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
14513	NC_015567	TGCG	2	8	5393567	5393574	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14514	NC_015567	GCT	2	6	5393625	5393630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14515	NC_015567	CTT	2	6	5393650	5393655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14516	NC_015567	TCC	2	6	5393699	5393704	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14517	NC_015567	CTT	2	6	5393734	5393739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14518	NC_015567	CA	3	6	5393740	5393745	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14519	NC_015567	CTG	2	6	5393793	5393798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14520	NC_015567	TCG	2	6	5393868	5393873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14521	NC_015567	CTA	2	6	5393896	5393901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14522	NC_015567	AGT	2	6	5393993	5393998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14523	NC_015567	CCG	2	6	5394042	5394047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14524	NC_015567	GCC	2	6	5394107	5394112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14525	NC_015567	AGT	2	6	5394213	5394218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14526	NC_015567	T	6	6	5394238	5394243	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14527	NC_015567	CA	3	6	5394282	5394287	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14528	NC_015567	GCC	2	6	5394323	5394328	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14529	NC_015567	GTT	2	6	5394438	5394443	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14530	NC_015567	A	6	6	5394501	5394506	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14531	NC_015567	T	6	6	5394522	5394527	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14532	NC_015567	TA	3	6	5395345	5395350	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14533	NC_015567	GA	4	8	5395356	5395363	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14534	NC_015567	GC	3	6	5398756	5398761	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14535	NC_015567	CAG	2	6	5402625	5402630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14536	NC_015567	A	7	7	5402658	5402664	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14537	NC_015567	CA	3	6	5402724	5402729	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14538	NC_015567	TTA	2	6	5404663	5404668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14539	NC_015567	A	6	6	5404790	5404795	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14540	NC_015567	ATA	2	6	5404826	5404831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14541	NC_015567	CAA	2	6	5404848	5404853	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14542	NC_015567	TCAT	2	8	5409007	5409014	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14543	NC_015567	CAA	2	6	5409033	5409038	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14544	NC_015567	TGC	2	6	5409584	5409589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14545	NC_015567	AAG	2	6	5409596	5409601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14546	NC_015567	AGT	2	6	5410119	5410124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14547	NC_015567	AAC	2	6	5410134	5410139	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14548	NC_015567	TCC	2	6	5410227	5410232	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14549	NC_015567	AAT	2	6	5410256	5410261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14550	NC_015567	TAA	2	6	5410288	5410293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14551	NC_015567	TAA	2	6	5410300	5410305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14552	NC_015567	TAAA	2	8	5410315	5410322	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14553	NC_015567	A	6	6	5410320	5410325	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14554	NC_015567	TCT	2	6	5410328	5410333	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14555	NC_015567	TCGA	2	8	5410363	5410370	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14556	NC_015567	AAC	2	6	5410404	5410409	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14557	NC_015567	GTTT	2	8	5412350	5412357	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
14558	NC_015567	CAT	2	6	5412382	5412387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14559	NC_015567	AAG	2	6	5413104	5413109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14560	NC_015567	CTAA	2	8	5413150	5413157	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14561	NC_015567	TGG	2	6	5413159	5413164	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14562	NC_015567	TTA	2	6	5413186	5413191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14563	NC_015567	TGC	2	6	5413279	5413284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14564	NC_015567	TGT	2	6	5413299	5413304	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14565	NC_015567	ATT	2	6	5413461	5413466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14566	NC_015567	AAT	2	6	5413501	5413506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14567	NC_015567	AATTA	2	10	5413512	5413521	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
14568	NC_015567	TAT	2	6	5413526	5413531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14569	NC_015567	AAT	2	6	5413576	5413581	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14570	NC_015567	T	6	6	5413642	5413647	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14571	NC_015567	GCT	2	6	5413648	5413653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14572	NC_015567	GA	3	6	5413713	5413718	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14573	NC_015567	AAAC	2	8	5414943	5414950	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
14574	NC_015567	CTG	2	6	5417844	5417849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14575	NC_015567	CAG	2	6	5417858	5417863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14576	NC_015567	GAG	2	6	5417877	5417882	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14577	NC_015567	GAG	2	6	5420178	5420183	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14578	NC_015567	T	9	9	5420665	5420673	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14579	NC_015567	GTA	2	6	5420843	5420848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14580	NC_015567	CTC	2	6	5422330	5422335	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14581	NC_015567	ATA	2	6	5422380	5422385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14582	NC_015567	GCT	2	6	5424321	5424326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14583	NC_015567	T	6	6	5424359	5424364	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14584	NC_015567	ATA	2	6	5424795	5424800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14585	NC_015567	GCA	2	6	5424898	5424903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14586	NC_015567	TACT	2	8	5424905	5424912	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14587	NC_015567	TGA	2	6	5424914	5424919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14588	NC_015567	AGG	2	6	5424954	5424959	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14589	NC_015567	AG	3	6	5426082	5426087	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14590	NC_015567	GGC	2	6	5427961	5427966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14591	NC_015567	TGA	2	6	5427969	5427974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14592	NC_015567	AG	3	6	5427977	5427982	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14593	NC_015567	TAT	2	6	5429614	5429619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14594	NC_015567	CAGC	2	8	5429651	5429658	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
14595	NC_015567	TGC	2	6	5430566	5430571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14596	NC_015567	GCG	2	6	5432761	5432766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14597	NC_015567	CAA	2	6	5432831	5432836	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14598	NC_015567	ACT	2	6	5432850	5432855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14599	NC_015567	A	7	7	5432874	5432880	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14600	NC_015567	T	6	6	5435398	5435403	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14601	NC_015567	TAG	2	6	5436095	5436100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14602	NC_015567	AAAG	2	8	5436178	5436185	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
14603	NC_015567	TATCT	2	10	5436189	5436198	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
14604	NC_015567	T	6	6	5436198	5436203	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14605	NC_015567	GCC	2	6	5436211	5436216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14606	NC_015567	AG	3	6	5436962	5436967	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14607	NC_015567	ATC	2	6	5437015	5437020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14608	NC_015567	A	6	6	5437021	5437026	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14609	NC_015567	T	6	6	5437054	5437059	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14610	NC_015567	CCA	2	6	5437088	5437093	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14611	NC_015567	GCC	2	6	5437187	5437192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14612	NC_015567	TCCT	2	8	5437394	5437401	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14613	NC_015567	GC	3	6	5437425	5437430	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14614	NC_015567	CGG	2	6	5437573	5437578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14615	NC_015567	AAT	2	6	5437633	5437638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14616	NC_015567	CGG	2	6	5437704	5437709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14617	NC_015567	GCC	2	6	5437784	5437789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14618	NC_015567	CAC	2	6	5437793	5437798	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14619	NC_015567	CAGA	2	8	5437916	5437923	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
14620	NC_015567	T	6	6	5437926	5437931	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14621	NC_015567	GCT	2	6	5437969	5437974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14622	NC_015567	ATCTA	2	10	5438024	5438033	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
14623	NC_015567	T	7	7	5438110	5438116	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14624	NC_015567	CGG	2	6	5438164	5438169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14625	NC_015567	GCA	2	6	5438182	5438187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14626	NC_015567	TCACC	2	10	5438269	5438278	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
14627	NC_015567	GGGC	2	8	5438408	5438415	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
14628	NC_015567	AAC	2	6	5438425	5438430	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14629	NC_015567	G	6	6	5438439	5438444	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
14630	NC_015567	TCT	2	6	5439848	5439853	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14631	NC_015567	CT	3	6	5439852	5439857	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14632	NC_015567	GC	3	6	5439916	5439921	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14633	NC_015567	AT	3	6	5442406	5442411	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14634	NC_015567	TAA	2	6	5442427	5442432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14635	NC_015567	CG	3	6	5442459	5442464	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14636	NC_015567	A	6	6	5442685	5442690	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14637	NC_015567	CGC	2	6	5442745	5442750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14638	NC_015567	TGA	2	6	5442786	5442791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14639	NC_015567	GGA	2	6	5442795	5442800	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14640	NC_015567	TC	3	6	5442844	5442849	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding

< Previous12...18192021222324252627282930Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.