MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptococcus parauberis KCTC 11537 chromosome

Total Repeats: 11321

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_015558	TTG	2	6	2076987	2076992	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11002	NC_015558	TTG	2	6	2077011	2077016	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11003	NC_015558	CCG	2	6	2077151	2077156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11004	NC_015558	TTC	2	6	2077197	2077202	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11005	NC_015558	GGC	2	6	2077238	2077243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11006	NC_015558	AAT	2	6	2077317	2077322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11007	NC_015558	GCCAT	2	10	2077336	2077345	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
11008	NC_015558	TTGG	2	8	2077416	2077423	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11009	NC_015558	CAT	2	6	2077428	2077433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11010	NC_015558	CTG	2	6	2077472	2077477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11011	NC_015558	CTG	2	6	2077526	2077531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11012	NC_015558	ATA	2	6	2077555	2077560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11013	NC_015558	AT	3	6	2077663	2077668	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11014	NC_015558	TCA	2	6	2077679	2077684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11015	NC_015558	GGA	2	6	2077790	2077795	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11016	NC_015558	GCA	2	6	2077804	2077809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11017	NC_015558	GTT	2	6	2077823	2077828	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11018	NC_015558	TTC	2	6	2077899	2077904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11019	NC_015558	T	6	6	2080307	2080312	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11020	NC_015558	T	7	7	2080318	2080324	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11021	NC_015558	ATTT	2	8	2080331	2080338	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11022	NC_015558	T	7	7	2080336	2080342	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11023	NC_015558	T	6	6	2080358	2080363	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11024	NC_015558	AAATG	2	10	2080441	2080450	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
11025	NC_015558	AT	3	6	2082164	2082169	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11026	NC_015558	A	7	7	2082170	2082176	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11027	NC_015558	A	6	6	2083099	2083104	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11028	NC_015558	CCT	2	6	2084015	2084020	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11029	NC_015558	T	6	6	2086757	2086762	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11030	NC_015558	TAA	2	6	2088217	2088222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11031	NC_015558	CTTT	2	8	2088254	2088261	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
11032	NC_015558	A	6	6	2088289	2088294	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11033	NC_015558	TCA	2	6	2088333	2088338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11035	NC_015558	ACTTT	2	10	2088397	2088406	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
11036	NC_015558	A	6	6	2088409	2088414	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11037	NC_015558	GATAT	2	10	2088415	2088424	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
11038	NC_015558	TGA	2	6	2088436	2088441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11039	NC_015558	CTA	2	6	2088525	2088530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11040	NC_015558	GGA	2	6	2088555	2088560	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11041	NC_015558	AGA	2	6	2088926	2088931	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11042	NC_015558	CTT	2	6	2088957	2088962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11043	NC_015558	GAATA	2	10	2089004	2089013	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
11044	NC_015558	TAC	2	6	2089022	2089027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11045	NC_015558	ATT	2	6	2089035	2089040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11046	NC_015558	T	6	6	2089048	2089053	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11047	NC_015558	TCA	2	6	2089895	2089900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11049	NC_015558	ATA	2	6	2089951	2089956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11050	NC_015558	T	7	7	2090519	2090525	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11051	NC_015558	TGC	2	6	2090615	2090620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11052	NC_015558	TA	3	6	2090627	2090632	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11053	NC_015558	AGA	2	6	2090682	2090687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11054	NC_015558	AGA	2	6	2090754	2090759	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11055	NC_015558	CAAA	2	8	2090812	2090819	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
11056	NC_015558	TGTTTC	2	12	2090840	2090851	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11057	NC_015558	TA	3	6	2090866	2090871	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11058	NC_015558	T	7	7	2090978	2090984	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11059	NC_015558	TAAT	2	8	2090997	2091004	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11060	NC_015558	AAT	2	6	2091028	2091033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11061	NC_015558	T	6	6	2091037	2091042	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11062	NC_015558	ATT	2	6	2091073	2091078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11063	NC_015558	GAT	2	6	2091141	2091146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11064	NC_015558	AAT	2	6	2091185	2091190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11065	NC_015558	GAA	2	6	2091199	2091204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11066	NC_015558	ACT	2	6	2091208	2091213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11068	NC_015558	TAA	2	6	2091263	2091268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11069	NC_015558	A	6	6	2091329	2091334	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11073	NC_015558	TC	3	6	2091527	2091532	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11074	NC_015558	ATT	2	6	2091551	2091556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11075	NC_015558	GGA	2	6	2091557	2091562	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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11082	NC_015558	TC	3	6	2091773	2091778	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11083	NC_015558	ATT	2	6	2091809	2091814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11084	NC_015558	TTAA	2	8	2091877	2091884	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11085	NC_015558	TAT	2	6	2091961	2091966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11096	NC_015558	CT	3	6	2093687	2093692	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11097	NC_015558	CTAT	2	8	2095909	2095916	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11098	NC_015558	CAA	2	6	2095948	2095953	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11099	NC_015558	A	6	6	2095966	2095971	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11100	NC_015558	ATA	2	6	2095978	2095983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11101	NC_015558	TAC	2	6	2099145	2099150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11102	NC_015558	GTA	2	6	2099170	2099175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11103	NC_015558	T	7	7	2103813	2103819	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11104	NC_015558	TAT	2	6	2103823	2103828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11105	NC_015558	TGA	2	6	2104706	2104711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11108	NC_015558	GAAA	2	8	2104774	2104781	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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11110	NC_015558	A	8	8	2104812	2104819	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11111	NC_015558	CTT	2	6	2104866	2104871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11112	NC_015558	TCA	2	6	2104877	2104882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11113	NC_015558	ACA	2	6	2104907	2104912	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11114	NC_015558	GCA	2	6	2104955	2104960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11115	NC_015558	CTT	2	6	2105050	2105055	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11116	NC_015558	TCT	2	6	2105156	2105161	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11117	NC_015558	AAT	2	6	2105171	2105176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11119	NC_015558	TAAA	2	8	2105218	2105225	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11120	NC_015558	AAT	2	6	2105237	2105242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11121	NC_015558	AATA	2	8	2105261	2105268	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11122	NC_015558	AAT	2	6	2105274	2105279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11123	NC_015558	T	6	6	2105294	2105299	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11124	NC_015558	CAT	2	6	2105339	2105344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11125	NC_015558	CTA	2	6	2105449	2105454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11126	NC_015558	ATGA	2	8	2105516	2105523	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11127	NC_015558	AT	3	6	2105550	2105555	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11128	NC_015558	ACC	2	6	2105708	2105713	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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11266	NC_015558	CAT	2	6	2134133	2134138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11305	NC_015558	T	6	6	2141410	2141415	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11309	NC_015558	A	6	6	2141457	2141462	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11310	NC_015558	ATA	2	6	2141468	2141473	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11321	NC_015558	AGAA	2	8	2143874	2143881	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.