MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Spirochaeta coccoides DSM 17374 chromosome

Total Repeats: 5235

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_015436	A	6	6	2131933	2131938	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5002	NC_015436	TAT	2	6	2131980	2131985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_015436	ATA	2	6	2132002	2132007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_015436	CAC	2	6	2132033	2132038	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5005	NC_015436	TAC	2	6	2132058	2132063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5006	NC_015436	TCA	2	6	2132084	2132089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5007	NC_015436	TCT	2	6	2132090	2132095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5008	NC_015436	GA	26	52	2132121	2132172	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5009	NC_015436	GA	3	6	2132182	2132187	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_015436	CCA	2	6	2134414	2134419	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5011	NC_015436	CG	3	6	2134432	2134437	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5012	NC_015436	TC	4	8	2134445	2134452	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5013	NC_015436	CAG	2	6	2135438	2135443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5014	NC_015436	ATTG	2	8	2135497	2135504	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5015	NC_015436	TCC	2	6	2136633	2136638	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5016	NC_015436	ATT	2	6	2136643	2136648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5017	NC_015436	A	6	6	2136729	2136734	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5018	NC_015436	GCG	2	6	2136753	2136758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5019	NC_015436	ATT	2	6	2140331	2140336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5020	NC_015436	T	7	7	2140335	2140341	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5021	NC_015436	CAA	2	6	2140347	2140352	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5022	NC_015436	CAT	2	6	2140474	2140479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5023	NC_015436	GAAAA	2	10	2141697	2141706	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
5024	NC_015436	GAT	2	6	2143263	2143268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5025	NC_015436	CGCAA	2	10	2144075	2144084	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
5026	NC_015436	TTCA	2	8	2144089	2144096	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5027	NC_015436	TTCA	2	8	2144180	2144187	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5028	NC_015436	TTCC	2	8	2144232	2144239	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5029	NC_015436	TTCC	2	8	2144243	2144250	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5030	NC_015436	CAA	2	6	2147248	2147253	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5031	NC_015436	CCCA	2	8	2151893	2151900	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
5032	NC_015436	CCT	2	6	2152942	2152947	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5033	NC_015436	ATT	2	6	2153046	2153051	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5034	NC_015436	TAT	2	6	2153052	2153057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5035	NC_015436	TCA	2	6	2154284	2154289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5036	NC_015436	CAA	2	6	2154318	2154323	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5037	NC_015436	CAA	2	6	2154335	2154340	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5038	NC_015436	CTT	2	6	2154623	2154628	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5039	NC_015436	TC	3	6	2154639	2154644	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5040	NC_015436	TCT	3	9	2154670	2154678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5041	NC_015436	TCG	2	6	2154700	2154705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5042	NC_015436	CTGC	2	8	2154707	2154714	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5043	NC_015436	CTG	2	6	2154750	2154755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5044	NC_015436	AGC	2	6	2154831	2154836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5045	NC_015436	CTTT	2	8	2155010	2155017	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5046	NC_015436	CTTT	2	8	2155025	2155032	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5047	NC_015436	CTTT	2	8	2155040	2155047	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5048	NC_015436	CTTC	2	8	2155055	2155062	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5049	NC_015436	GCG	2	6	2155081	2155086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5050	NC_015436	CTTTC	2	10	2155127	2155136	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
5051	NC_015436	GCC	2	6	2155207	2155212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5052	NC_015436	TA	3	6	2155257	2155262	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5053	NC_015436	A	7	7	2155266	2155272	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5054	NC_015436	GCTG	2	8	2155309	2155316	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5055	NC_015436	TCC	2	6	2155423	2155428	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5056	NC_015436	CATA	2	8	2155445	2155452	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5057	NC_015436	ATG	2	6	2155535	2155540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5058	NC_015436	AAG	2	6	2155566	2155571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5059	NC_015436	AAG	2	6	2160227	2160232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5060	NC_015436	TCC	2	6	2161195	2161200	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5061	NC_015436	TCCT	2	8	2161239	2161246	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5062	NC_015436	AT	3	6	2161247	2161252	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5063	NC_015436	TAT	2	6	2164532	2164537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5064	NC_015436	TCC	2	6	2165139	2165144	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5065	NC_015436	TTC	2	6	2165184	2165189	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5066	NC_015436	CCG	2	6	2165207	2165212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5067	NC_015436	ACC	2	6	2165223	2165228	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5068	NC_015436	TCC	2	6	2167260	2167265	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5069	NC_015436	TTC	2	6	2168110	2168115	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5070	NC_015436	TCC	2	6	2171031	2171036	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5071	NC_015436	AT	3	6	2171062	2171067	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5072	NC_015436	TAC	2	6	2171096	2171101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5073	NC_015436	GGGTAT	2	12	2171173	2171184	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
5074	NC_015436	TAT	2	6	2171195	2171200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5075	NC_015436	TAT	2	6	2171228	2171233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5076	NC_015436	CGG	2	6	2171244	2171249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5077	NC_015436	CTGGC	2	10	2171261	2171270	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
5078	NC_015436	T	6	6	2171271	2171276	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5079	NC_015436	AATA	2	8	2171278	2171285	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5080	NC_015436	TC	3	6	2171379	2171384	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5081	NC_015436	CCTT	2	8	2171813	2171820	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5082	NC_015436	TCC	2	6	2172179	2172184	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5083	NC_015436	AGG	2	6	2172860	2172865	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5084	NC_015436	TAT	2	6	2178480	2178485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5085	NC_015436	ATA	2	6	2178512	2178517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5086	NC_015436	T	6	6	2178599	2178604	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5087	NC_015436	GA	26	52	2178626	2178677	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5088	NC_015436	GA	3	6	2178682	2178687	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5089	NC_015436	CCGA	2	8	2180897	2180904	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5090	NC_015436	CTT	2	6	2180933	2180938	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5091	NC_015436	ACC	2	6	2180955	2180960	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5092	NC_015436	TCAT	2	8	2183847	2183854	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5093	NC_015436	CA	3	6	2183864	2183869	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5094	NC_015436	ATC	2	6	2183870	2183875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5095	NC_015436	AGTC	2	8	2183890	2183897	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5096	NC_015436	TTTTA	2	10	2183904	2183913	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5097	NC_015436	GA	3	6	2186257	2186262	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5098	NC_015436	AGG	2	6	2186278	2186283	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5099	NC_015436	CT	4	8	2186330	2186337	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5100	NC_015436	T	7	7	2186342	2186348	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5101	NC_015436	GTA	2	6	2186359	2186364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5102	NC_015436	CCT	2	6	2186456	2186461	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5103	NC_015436	GTT	2	6	2186471	2186476	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5104	NC_015436	T	6	6	2186475	2186480	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5105	NC_015436	ACA	2	6	2186482	2186487	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5106	NC_015436	TCA	2	6	2186564	2186569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5107	NC_015436	GA	3	6	2186584	2186589	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5108	NC_015436	CT	4	8	2186659	2186666	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5109	NC_015436	GTT	2	6	2186690	2186695	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5110	NC_015436	GA	3	6	2186711	2186716	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5111	NC_015436	GT	3	6	2186751	2186756	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5112	NC_015436	CT	4	8	2186785	2186792	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5113	NC_015436	AGC	2	6	2186861	2186866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5114	NC_015436	CTG	2	6	2186902	2186907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5115	NC_015436	ACG	2	6	2186960	2186965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5116	NC_015436	ACAG	2	8	2186969	2186976	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5117	NC_015436	ATT	2	6	2186999	2187004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5118	NC_015436	ATT	2	6	2188861	2188866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5119	NC_015436	GTCAA	2	10	2188885	2188894	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5120	NC_015436	TC	3	6	2189470	2189475	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5121	NC_015436	TCT	2	6	2189482	2189487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5122	NC_015436	AT	3	6	2189508	2189513	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5123	NC_015436	GAT	2	6	2189560	2189565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5124	NC_015436	TCA	2	6	2189635	2189640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5125	NC_015436	CCAT	2	8	2189655	2189662	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5126	NC_015436	T	7	7	2192207	2192213	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5127	NC_015436	CAT	2	6	2192404	2192409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5128	NC_015436	A	8	8	2192416	2192423	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5129	NC_015436	AAC	2	6	2192428	2192433	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5130	NC_015436	A	6	6	2193902	2193907	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5131	NC_015436	TCT	2	6	2193923	2193928	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5132	NC_015436	TCTT	2	8	2193933	2193940	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5133	NC_015436	TCTT	2	8	2193948	2193955	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5134	NC_015436	TTC	2	6	2193958	2193963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5141	NC_015436	GCC	2	6	2199715	2199720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5142	NC_015436	CT	3	6	2201272	2201277	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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5165	NC_015436	ATT	2	6	2209494	2209499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5232	NC_015436	TAA	2	6	2222600	2222605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5233	NC_015436	AATT	2	8	2222606	2222613	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5234	NC_015436	TTA	2	6	2227146	2227151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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