MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptococcus suis ST3 chromosome

Total Repeats: 6487

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015433	T	6	6	1387	1392	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015433	A	6	6	1393	1398	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015433	T	6	6	1404	1409	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015433	TCA	2	6	1454	1459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_015433	ACT	2	6	1482	1487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_015433	ATA	2	6	1507	1512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015433	AGG	2	6	2674	2679	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015433	GTT	2	6	2750	2755	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015433	T	7	7	2814	2820	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015433	TTTAT	2	10	2847	2856	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015433	A	6	6	2860	2865	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015433	TA	3	6	2884	2889	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015433	CTG	2	6	4005	4010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_015433	A	6	6	4073	4078	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015433	GAG	2	6	4079	4084	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015433	ATT	2	6	4463	4468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015433	ATT	2	6	4477	4482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015433	A	6	6	4564	4569	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015433	TTC	2	6	5704	5709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_015433	GTT	2	6	5710	5715	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015433	GAT	2	6	5789	5794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015433	TTGG	2	8	5798	5805	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015433	AAT	2	6	9936	9941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015433	AGG	2	6	10697	10702	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015433	AAC	2	6	13257	13262	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_015433	CTA	2	6	13818	13823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_015433	T	7	7	15889	15895	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015433	A	6	6	15898	15903	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015433	TTAT	2	8	15933	15940	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015433	A	7	7	16024	16030	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015433	CAA	2	6	16104	16109	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_015433	CAT	2	6	16608	16613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_015433	T	7	7	16669	16675	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015433	AGA	2	6	16692	16697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015433	A	6	6	16711	16716	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015433	TAT	2	6	16825	16830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015433	A	7	7	16877	16883	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015433	TA	3	6	16906	16911	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015433	TAG	2	6	16981	16986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015433	ACT	2	6	17017	17022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_015433	A	6	6	18448	18453	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015433	AGA	2	6	18623	18628	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015433	A	7	7	18678	18684	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015433	A	6	6	18690	18695	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015433	AGA	2	6	18777	18782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015433	ACAAA	2	10	18829	18838	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_015433	GGC	2	6	18922	18927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_015433	GCA	2	6	19241	19246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_015433	CGC	2	6	19288	19293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_015433	GTGA	2	8	19294	19301	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015433	TGT	2	6	19327	19332	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015433	AGA	2	6	19336	19341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015433	AGA	2	6	19348	19353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015433	CAG	2	6	19410	19415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_015433	AGCG	2	8	19465	19472	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
56	NC_015433	AT	3	6	19594	19599	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015433	GGA	2	6	19600	19605	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015433	CT	3	6	19625	19630	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_015433	GAA	2	6	19864	19869	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015433	GGT	2	6	19938	19943	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015433	GTC	2	6	19952	19957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_015433	TCGTG	2	10	19961	19970	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
63	NC_015433	CAT	2	6	20020	20025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_015433	TAA	2	6	20055	20060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015433	GGA	2	6	20064	20069	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015433	ATC	2	6	20088	20093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_015433	AC	3	6	20115	20120	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_015433	CGC	2	6	20254	20259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_015433	AC	3	6	20284	20289	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_015433	CAC	2	6	20299	20304	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_015433	AGCC	2	8	20347	20354	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
72	NC_015433	GAT	2	6	20370	20375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015433	CCT	2	6	20426	20431	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_015433	TCT	2	6	20461	20466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_015433	AGG	2	6	20527	20532	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015433	CTA	2	6	20574	20579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_015433	CTT	2	6	20614	20619	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_015433	TG	3	6	20641	20646	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015433	AC	3	6	20651	20656	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_015433	CGT	2	6	20701	20706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_015433	A	7	7	20843	20849	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015433	TAA	2	6	20856	20861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015433	GTTAA	2	10	20863	20872	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015433	ACG	2	6	20926	20931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_015433	GTAA	2	8	20949	20956	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015433	TCAC	2	8	21006	21013	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_015433	TAG	2	6	21097	21102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015433	GCGA	2	8	21105	21112	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
89	NC_015433	AGG	2	6	21119	21124	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015433	GAG	2	6	21132	21137	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015433	CTC	2	6	21142	21147	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_015433	AGA	2	6	21184	21189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015433	AG	3	6	21212	21217	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015433	TCG	2	6	21287	21292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_015433	GGA	2	6	21300	21305	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015433	CT	3	6	21326	21331	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_015433	ACA	2	6	21418	21423	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_015433	ATG	2	6	21485	21490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015433	TAT	2	6	21550	21555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015433	GGA	2	6	21618	21623	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015433	TC	3	6	21704	21709	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_015433	ACC	2	6	21884	21889	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_015433	AAT	2	6	21904	21909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015433	AGC	2	6	21964	21969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_015433	ATTC	2	8	21971	21978	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_015433	TG	3	6	22095	22100	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015433	AAG	2	6	22101	22106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015433	GAG	2	6	22116	22121	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015433	GA	3	6	22246	22251	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015433	ACA	2	6	22272	22277	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_015433	CTAA	2	8	22327	22334	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_015433	GA	3	6	22542	22547	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015433	CT	3	6	22658	22663	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_015433	GAT	2	6	22676	22681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015433	AGG	2	6	22721	22726	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015433	CGG	2	6	22767	22772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_015433	GA	3	6	22865	22870	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015433	TAGG	2	8	22983	22990	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015433	TAC	2	6	23037	23042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_015433	CCT	2	6	23125	23130	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_015433	GGT	2	6	23261	23266	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015433	TCG	2	6	23376	23381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_015433	CGT	2	6	23456	23461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_015433	GA	3	6	23680	23685	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015433	TGGAAG	2	12	23703	23714	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015433	T	6	6	23843	23848	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015433	CAG	2	6	24000	24005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_015433	AGT	2	6	24026	24031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015433	AATC	2	8	24231	24238	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_015433	ATAGA	2	10	24425	24434	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015433	ACC	2	6	24549	24554	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_015433	CGT	2	6	24586	24591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_015433	ATTAT	2	10	24900	24909	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015433	CGC	2	6	24979	24984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_015433	TA	3	6	24985	24990	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015433	AT	3	6	25076	25081	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015433	GGA	2	6	25083	25088	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015433	CGTG	2	8	25143	25150	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
139	NC_015433	TCC	2	6	25166	25171	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
140	NC_015433	TCG	2	6	25207	25212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_015433	CGG	2	6	25319	25324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_015433	TAT	2	6	25367	25372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_015433	GGT	2	6	25425	25430	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
144	NC_015433	ATATT	2	10	25449	25458	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_015433	TAA	2	6	26956	26961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_015433	T	7	7	26983	26989	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_015433	GA	3	6	26998	27003	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_015433	GAG	2	6	27017	27022	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
149	NC_015433	TTTG	2	8	28330	28337	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
150	NC_015433	AT	3	6	28377	28382	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_015433	AGG	2	6	28383	28388	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
152	NC_015433	CTT	2	6	29385	29390	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_015433	T	6	6	29389	29394	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_015433	ATTT	2	8	29397	29404	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_015433	TAT	2	6	29413	29418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_015433	T	6	6	32662	32667	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_015433	A	6	6	32671	32676	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_015433	TGT	2	6	32686	32691	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
159	NC_015433	TG	3	6	32704	32709	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
160	NC_015433	T	6	6	45399	45404	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_015433	ATAG	2	8	49235	49242	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
162	NC_015433	T	7	7	50585	50591	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_015433	AATA	2	8	50603	50610	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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165	NC_015433	AAAT	2	8	50660	50667	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_015433	T	6	6	50670	50675	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
167	NC_015433	A	7	7	50728	50734	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
168	NC_015433	TTA	2	6	50757	50762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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171	NC_015433	A	6	6	50854	50859	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
172	NC_015433	TAAG	2	8	50877	50884	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
173	NC_015433	AC	3	6	50913	50918	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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181	NC_015433	TCGGTG	2	12	52672	52683	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
182	NC_015433	AATA	2	8	52893	52900	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
183	NC_015433	ATCT	2	8	52920	52927	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
184	NC_015433	CAG	2	6	58001	58006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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186	NC_015433	ATC	2	6	58020	58025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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191	NC_015433	GAAT	2	8	58391	58398	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
192	NC_015433	TA	3	6	58569	58574	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
193	NC_015433	TC	3	6	61058	61063	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
194	NC_015433	TAA	2	6	61169	61174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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285	NC_015433	ACA	2	6	89998	90003	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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287	NC_015433	AGAA	2	8	90164	90171	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
288	NC_015433	TCG	2	6	90182	90187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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290	NC_015433	TGT	2	6	90420	90425	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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