MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptococcus suis ST3 chromosome

Total Repeats: 6487

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_015433	GTT	2	6	1843653	1843658	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6002	NC_015433	CAG	3	9	1843678	1843686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6003	NC_015433	TGC	2	6	1843781	1843786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6004	NC_015433	AGT	2	6	1843835	1843840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6005	NC_015433	CTG	2	6	1843846	1843851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6006	NC_015433	AACCA	2	10	1844108	1844117	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
6007	NC_015433	CGTCT	2	10	1844138	1844147	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
6008	NC_015433	GCC	2	6	1844154	1844159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6009	NC_015433	AAC	2	6	1844205	1844210	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6010	NC_015433	TTC	2	6	1844267	1844272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6011	NC_015433	GTT	2	6	1844296	1844301	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6012	NC_015433	CTT	2	6	1844383	1844388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6013	NC_015433	ATT	2	6	1844396	1844401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6014	NC_015433	ATCA	2	8	1844579	1844586	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6015	NC_015433	AAT	2	6	1844606	1844611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6016	NC_015433	TTG	2	6	1844703	1844708	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6017	NC_015433	TTG	2	6	1844722	1844727	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6018	NC_015433	CAA	2	6	1844743	1844748	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6019	NC_015433	CTT	2	6	1844760	1844765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6020	NC_015433	T	7	7	1844819	1844825	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6021	NC_015433	T	6	6	1844831	1844836	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6022	NC_015433	TAT	2	6	1844883	1844888	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6023	NC_015433	TTG	2	6	1844923	1844928	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6024	NC_015433	CTT	2	6	1844934	1844939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6025	NC_015433	GTT	2	6	1844962	1844967	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6028	NC_015433	TA	3	6	1845460	1845465	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6029	NC_015433	A	6	6	1845468	1845473	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6030	NC_015433	AT	3	6	1845489	1845494	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6031	NC_015433	TTTA	2	8	1845500	1845507	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6032	NC_015433	A	6	6	1845511	1845516	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6033	NC_015433	ATT	2	6	1845519	1845524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6034	NC_015433	A	7	7	1845578	1845584	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6035	NC_015433	GAAG	2	8	1845587	1845594	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6036	NC_015433	AAAC	2	8	1845602	1845609	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6037	NC_015433	TCC	2	6	1845612	1845617	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6038	NC_015433	AAT	2	6	1845655	1845660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6039	NC_015433	ACC	2	6	1845671	1845676	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6040	NC_015433	ATC	2	6	1846524	1846529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6041	NC_015433	T	6	6	1846539	1846544	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6042	NC_015433	TAT	2	6	1846546	1846551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6043	NC_015433	CAA	2	6	1846556	1846561	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6044	NC_015433	T	6	6	1846578	1846583	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6045	NC_015433	GAT	3	9	1846642	1846650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6046	NC_015433	TCT	2	6	1846675	1846680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6049	NC_015433	TG	3	6	1851838	1851843	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6050	NC_015433	CTA	2	6	1851850	1851855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6051	NC_015433	A	7	7	1851874	1851880	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6052	NC_015433	TAA	2	6	1851937	1851942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6053	NC_015433	GGT	2	6	1851955	1851960	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6054	NC_015433	TCC	2	6	1852023	1852028	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6055	NC_015433	ATT	2	6	1852031	1852036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6056	NC_015433	TCA	2	6	1852259	1852264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6057	NC_015433	AATCA	2	10	1852265	1852274	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
6058	NC_015433	TGATTT	2	12	1852283	1852294	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6059	NC_015433	GAA	2	6	1852297	1852302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6060	NC_015433	TAT	2	6	1853946	1853951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6061	NC_015433	AAAGAA	2	12	1853987	1853998	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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6063	NC_015433	TC	3	6	1856623	1856628	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6064	NC_015433	A	7	7	1858373	1858379	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6065	NC_015433	CT	3	6	1858390	1858395	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6066	NC_015433	GAAGT	2	10	1858420	1858429	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
6067	NC_015433	GA	3	6	1858476	1858481	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6068	NC_015433	ACTG	2	8	1858484	1858491	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6069	NC_015433	A	6	6	1858499	1858504	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6070	NC_015433	AAT	2	6	1858591	1858596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6071	NC_015433	C	6	6	1858634	1858639	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6072	NC_015433	AGAT	2	8	1858654	1858661	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6073	NC_015433	GATT	2	8	1858687	1858694	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6074	NC_015433	CAAT	2	8	1858708	1858715	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6075	NC_015433	TTCT	2	8	1859600	1859607	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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6078	NC_015433	CTTT	2	8	1862919	1862926	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6079	NC_015433	CTA	2	6	1862928	1862933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6081	NC_015433	GAA	2	6	1862963	1862968	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6082	NC_015433	A	8	8	1862967	1862974	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6083	NC_015433	CAG	2	6	1862976	1862981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6085	NC_015433	CCT	2	6	1863162	1863167	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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6088	NC_015433	CT	3	6	1864320	1864325	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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6092	NC_015433	TAT	2	6	1868209	1868214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6093	NC_015433	T	6	6	1868251	1868256	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6094	NC_015433	A	6	6	1868260	1868265	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6095	NC_015433	AATA	2	8	1868268	1868275	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6096	NC_015433	A	6	6	1868301	1868306	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6097	NC_015433	AT	3	6	1868334	1868339	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6101	NC_015433	T	6	6	1869522	1869527	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6102	NC_015433	A	6	6	1869569	1869574	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6103	NC_015433	ATC	2	6	1869600	1869605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6106	NC_015433	C	8	8	1871105	1871112	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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6110	NC_015433	CTTT	2	8	1873974	1873981	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6111	NC_015433	AAT	2	6	1873984	1873989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6112	NC_015433	TTTTA	2	10	1874008	1874017	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6115	NC_015433	TAT	2	6	1875191	1875196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6121	NC_015433	ATA	2	6	1876217	1876222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6122	NC_015433	A	7	7	1876239	1876245	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6123	NC_015433	CCT	2	6	1876810	1876815	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6124	NC_015433	TGA	2	6	1876820	1876825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6131	NC_015433	TTAC	2	8	1883436	1883443	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6132	NC_015433	AT	4	8	1883456	1883463	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6134	NC_015433	AT	3	6	1883507	1883512	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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