MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptococcus gallolyticus subsp. gallolyticus ATCC BAA-2069 plasmid pSGG1

Total Repeats: 196

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015219	A	6	6	1	6	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015219	T	8	8	15	22	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015219	ATT	2	6	51	56	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015219	TAT	3	9	206	214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015219	T	6	6	223	228	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015219	ATA	2	6	240	245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015219	T	7	7	1383	1389	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015219	A	6	6	1395	1400	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015219	CAA	2	6	1419	1424	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_015219	CTA	2	6	1484	1489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_015219	ACAA	2	8	1490	1497	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_015219	ATT	2	6	1533	1538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015219	CCG	2	6	1608	1613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_015219	ATCGC	2	10	1648	1657	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
15	NC_015219	CTCAAA	2	12	1721	1732	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_015219	CAA	2	6	1870	1875	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_015219	TCC	2	6	1893	1898	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_015219	TTAATT	2	12	1917	1928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015219	ACG	2	6	1959	1964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_015219	TGA	2	6	1971	1976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015219	TCC	2	6	2031	2036	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_015219	CAC	2	6	2099	2104	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_015219	TCC	2	6	2125	2130	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_015219	TCAGC	2	10	2146	2155	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
25	NC_015219	AAC	2	6	2163	2168	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_015219	A	7	7	2242	2248	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015219	ACCAC	2	10	2267	2276	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
28	NC_015219	TGA	2	6	2295	2300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015219	GCTA	2	8	2384	2391	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_015219	GCTTTT	2	12	2574	2585	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_015219	A	6	6	2636	2641	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015219	A	6	6	2653	2658	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015219	A	7	7	2661	2667	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015219	TAA	2	6	2668	2673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015219	A	6	6	2672	2677	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015219	TAT	2	6	2678	2683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015219	TAT	2	6	3586	3591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015219	T	6	6	3591	3596	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015219	T	9	9	3633	3641	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015219	ATATA	2	10	3784	3793	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015219	AATAT	2	10	3794	3803	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015219	AT	4	8	3806	3813	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015219	GATTTT	2	12	3823	3834	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015219	T	6	6	3831	3836	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015219	A	7	7	3842	3848	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015219	T	6	6	3876	3881	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015219	CTTTT	2	10	3927	3936	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
48	NC_015219	T	6	6	3933	3938	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015219	AGT	2	6	3951	3956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015219	ACT	2	6	3968	3973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_015219	T	7	7	3973	3979	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015219	GAA	2	6	4025	4030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015219	GCC	2	6	4061	4066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_015219	T	7	7	4074	4080	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015219	T	6	6	4111	4116	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015219	GAA	2	6	4207	4212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015219	AAG	2	6	4222	4227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015219	TAT	3	9	4265	4273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015219	A	6	6	4348	4353	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015219	A	7	7	4358	4364	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015219	AACTG	2	10	4373	4382	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
62	NC_015219	TAAA	2	8	5266	5273	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015219	ATC	2	6	5297	5302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_015219	TAA	2	6	5384	5389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015219	ATC	2	6	5489	5494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_015219	TAGT	2	8	5532	5539	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015219	AT	3	6	5578	5583	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015219	AAT	2	6	5612	5617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015219	T	6	6	5642	5647	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015219	GAT	2	6	5663	5668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015219	AAT	2	6	6574	6579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015219	AGG	2	6	6593	6598	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015219	TTCT	2	8	7527	7534	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_015219	TCT	2	6	7538	7543	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_015219	ATC	2	6	7556	7561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_015219	TAAA	2	8	7582	7589	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015219	T	6	6	7606	7611	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015219	GT	3	6	7612	7617	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015219	GGC	2	6	7651	7656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_015219	GAT	2	6	8002	8007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015219	TAT	2	6	8094	8099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015219	TAA	2	6	8109	8114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015219	TAAA	2	8	8134	8141	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015219	T	6	6	8205	8210	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015219	T	6	6	8335	8340	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015219	ATG	2	6	10336	10341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015219	TAA	2	6	10386	10391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015219	AGGA	2	8	10396	10403	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015219	AAGA	2	8	10448	10455	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015219	TCA	2	6	10487	10492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_015219	ATC	2	6	10546	10551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_015219	A	8	8	10594	10601	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015219	GGGT	2	8	10610	10617	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015219	CAA	2	6	11661	11666	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_015219	TTG	2	6	11677	11682	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015219	TGA	2	6	11689	11694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015219	AGG	2	6	11748	11753	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015219	AATT	2	8	11754	11761	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015219	GA	3	6	13188	13193	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015219	TCT	2	6	13444	13449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_015219	A	6	6	13451	13456	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015219	TAC	2	6	13457	13462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_015219	C	7	7	13501	13507	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
104	NC_015219	T	7	7	13532	13538	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015219	T	6	6	13544	13549	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015219	A	8	8	13555	13562	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015219	CA	3	6	13618	13623	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_015219	TTC	2	6	13651	13656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_015219	CTT	2	6	13679	13684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_015219	AAT	2	6	13701	13706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015219	AGTT	2	8	13716	13723	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015219	T	6	6	13722	13727	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015219	ACC	2	6	13728	13733	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_015219	TCC	2	6	13749	13754	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_015219	ATTT	3	12	14642	14653	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015219	ATATA	2	10	14752	14761	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015219	AATAT	2	10	14762	14771	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015219	AT	4	8	14774	14781	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015219	GATTTT	2	12	14791	14802	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015219	T	6	6	14799	14804	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015219	A	7	7	14810	14816	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015219	T	6	6	14835	14840	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015219	T	6	6	14844	14849	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015219	CTTTT	2	10	14895	14904	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_015219	AGT	2	6	14918	14923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015219	ACT	2	6	14935	14940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_015219	T	6	6	14940	14945	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015219	TATAA	2	10	14968	14977	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015219	CAA	3	9	14979	14987	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_015219	T	6	6	15048	15053	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015219	TCA	2	6	15108	15113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_015219	AAC	2	6	15161	15166	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_015219	AAC	2	6	15188	15193	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_015219	AC	3	6	15222	15227	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_015219	ATT	2	6	15266	15271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015219	CTTT	2	8	15405	15412	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_015219	AGG	2	6	15414	15419	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015219	TAT	2	6	15427	15432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_015219	T	6	6	15445	15450	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015219	T	6	6	16187	16192	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_015219	TGA	2	6	16217	16222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_015219	A	6	6	16224	16229	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_015219	TCCAT	2	10	16230	16239	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
144	NC_015219	ATA	2	6	16256	16261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_015219	AG	3	6	16278	16283	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_015219	CAGTA	2	10	16286	16295	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
147	NC_015219	AGC	3	9	16484	16492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_015219	TTC	2	6	16616	16621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_015219	TTTG	2	8	16646	16653	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
150	NC_015219	TAA	2	6	16688	16693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_015219	ATA	3	9	16702	16710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_015219	TAATA	2	10	16752	16761	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_015219	ATT	2	6	16818	16823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_015219	C	6	6	16844	16849	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
155	NC_015219	GTT	2	6	16899	16904	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
156	NC_015219	AAAT	2	8	16910	16917	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_015219	AGC	2	6	17012	17017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
158	NC_015219	CAACC	2	10	17026	17035	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
159	NC_015219	CTT	2	6	17056	17061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
160	NC_015219	TTCT	2	8	17075	17082	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
161	NC_015219	C	6	6	17094	17099	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
162	NC_015219	TCT	2	6	17149	17154	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
163	NC_015219	TCA	2	6	17170	17175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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165	NC_015219	CTA	2	6	17264	17269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
166	NC_015219	T	6	6	17506	17511	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
167	NC_015219	TCT	2	6	17529	17534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
168	NC_015219	ATA	2	6	17567	17572	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
169	NC_015219	CTT	3	9	17580	17588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
170	NC_015219	AGC	2	6	17674	17679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
171	NC_015219	ATA	2	6	17681	17686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
172	NC_015219	GAT	2	6	17762	17767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
173	NC_015219	TCC	2	6	18461	18466	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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176	NC_015219	ATT	2	6	18548	18553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
177	NC_015219	AT	3	6	18576	18581	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
178	NC_015219	T	6	6	18636	18641	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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180	NC_015219	TCA	2	6	19249	19254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
181	NC_015219	ATT	2	6	19267	19272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
182	NC_015219	ATT	2	6	19275	19280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
183	NC_015219	A	6	6	19343	19348	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
184	NC_015219	CTT	2	6	19357	19362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
185	NC_015219	CAGT	2	8	19363	19370	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
186	NC_015219	T	7	7	19393	19399	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
187	NC_015219	ATC	2	6	19422	19427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
188	NC_015219	AT	3	6	20538	20543	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
189	NC_015219	ATA	2	6	20547	20552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
190	NC_015219	AT	4	8	20557	20564	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
191	NC_015219	GATTTT	2	12	20574	20585	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
192	NC_015219	T	6	6	20582	20587	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
193	NC_015219	A	7	7	20593	20599	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
194	NC_015219	TCA	2	6	20600	20605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
195	NC_015219	T	6	6	20637	20642	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
196	NC_015219	TA	3	6	20700	20705	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.