MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus pseudintermedius HKU10-03 chromosome

Total Repeats: 10505

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_014925	AGTTT	2	10	2506510	2506519	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
10002	NC_014925	TGT	2	6	2506626	2506631	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10003	NC_014925	GAA	2	6	2506642	2506647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10004	NC_014925	TTA	2	6	2506675	2506680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10005	NC_014925	AAT	2	6	2506693	2506698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10006	NC_014925	TAT	2	6	2506724	2506729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10007	NC_014925	ATTT	2	8	2506757	2506764	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10008	NC_014925	CAT	2	6	2506794	2506799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10009	NC_014925	TAC	2	6	2506804	2506809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10010	NC_014925	AAAT	2	8	2506815	2506822	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10011	NC_014925	GTT	2	6	2506904	2506909	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10012	NC_014925	TC	3	6	2506944	2506949	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10013	NC_014925	TGTC	2	8	2506978	2506985	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10014	NC_014925	ATT	2	6	2507004	2507009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10015	NC_014925	ATT	2	6	2507025	2507030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10016	NC_014925	T	8	8	2507098	2507105	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10017	NC_014925	CTT	2	6	2507111	2507116	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10018	NC_014925	TTA	2	6	2507126	2507131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10019	NC_014925	TAT	2	6	2507236	2507241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10020	NC_014925	T	6	6	2507304	2507309	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10021	NC_014925	AAT	2	6	2508981	2508986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10022	NC_014925	A	7	7	2508990	2508996	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10023	NC_014925	ACT	2	6	2509275	2509280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10024	NC_014925	AATT	2	8	2509302	2509309	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10025	NC_014925	AAGAA	2	10	2509330	2509339	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
10026	NC_014925	ATAA	2	8	2509350	2509357	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10027	NC_014925	AAC	2	6	2510083	2510088	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10028	NC_014925	TCA	2	6	2510099	2510104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10029	NC_014925	TCG	2	6	2510216	2510221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10030	NC_014925	GTCA	2	8	2510272	2510279	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10031	NC_014925	CTG	2	6	2510299	2510304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10032	NC_014925	GCT	2	6	2510307	2510312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10033	NC_014925	TAT	2	6	2510409	2510414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10034	NC_014925	TGA	2	6	2510499	2510504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10035	NC_014925	TGA	2	6	2510613	2510618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10036	NC_014925	GTCATT	2	12	2510630	2510641	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10037	NC_014925	AT	3	6	2510650	2510655	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10038	NC_014925	AAG	2	6	2510850	2510855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10039	NC_014925	AG	3	6	2510984	2510989	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10040	NC_014925	CCA	2	6	2510998	2511003	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10041	NC_014925	TAC	2	6	2511048	2511053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10042	NC_014925	GAA	2	6	2511056	2511061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10043	NC_014925	ATC	2	6	2511131	2511136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10044	NC_014925	AT	3	6	2511149	2511154	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10045	NC_014925	GAA	2	6	2511274	2511279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10046	NC_014925	CAA	2	6	2511285	2511290	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10047	NC_014925	AAGCG	2	10	2511351	2511360	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
10048	NC_014925	TC	3	6	2511370	2511375	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10049	NC_014925	TAA	2	6	2511446	2511451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10050	NC_014925	GAT	2	6	2511528	2511533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10051	NC_014925	TC	3	6	2512754	2512759	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10052	NC_014925	AAAATT	2	12	2512816	2512827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10053	NC_014925	TAT	2	6	2512843	2512848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10054	NC_014925	T	6	6	2512853	2512858	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10055	NC_014925	CTG	2	6	2512959	2512964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10056	NC_014925	CT	3	6	2513865	2513870	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10057	NC_014925	CCT	2	6	2513872	2513877	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10058	NC_014925	ACA	2	6	2514422	2514427	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10059	NC_014925	AGTAA	2	10	2514432	2514441	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
10060	NC_014925	AGG	2	6	2514456	2514461	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10061	NC_014925	ATT	2	6	2516279	2516284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10062	NC_014925	CTT	2	6	2516302	2516307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10063	NC_014925	TTA	2	6	2516330	2516335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10064	NC_014925	ATC	2	6	2516377	2516382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10065	NC_014925	CTTT	2	8	2516406	2516413	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
10066	NC_014925	TTTC	2	8	2516435	2516442	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
10067	NC_014925	G	6	6	2517662	2517667	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10068	NC_014925	A	6	6	2521066	2521071	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10069	NC_014925	T	6	6	2521098	2521103	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10070	NC_014925	CTTT	2	8	2521461	2521468	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
10071	NC_014925	CAT	2	6	2521478	2521483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10072	NC_014925	ACG	2	6	2521502	2521507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10073	NC_014925	TCA	2	6	2521521	2521526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10074	NC_014925	CCT	2	6	2523291	2523296	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10075	NC_014925	AC	3	6	2524292	2524297	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10076	NC_014925	ACA	2	6	2526441	2526446	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10077	NC_014925	TGA	2	6	2526459	2526464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10078	NC_014925	CA	3	6	2526559	2526564	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10079	NC_014925	ATC	2	6	2526587	2526592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10080	NC_014925	TAA	2	6	2527630	2527635	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10081	NC_014925	A	6	6	2527650	2527655	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10082	NC_014925	TCT	2	6	2527672	2527677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10083	NC_014925	TAT	2	6	2527692	2527697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10084	NC_014925	TCA	2	6	2527767	2527772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10085	NC_014925	AT	3	6	2527807	2527812	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10086	NC_014925	AAAG	2	8	2527886	2527893	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
10087	NC_014925	TTA	2	6	2529163	2529168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10088	NC_014925	ACC	2	6	2529183	2529188	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10089	NC_014925	GGT	2	6	2529211	2529216	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10090	NC_014925	A	6	6	2529243	2529248	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10091	NC_014925	CAT	2	6	2529267	2529272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10092	NC_014925	CTAT	2	8	2529375	2529382	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10093	NC_014925	TGA	2	6	2529384	2529389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10094	NC_014925	ACT	2	6	2529460	2529465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10095	NC_014925	TAT	2	6	2529560	2529565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10096	NC_014925	TTTC	2	8	2529576	2529583	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
10097	NC_014925	AAT	2	6	2529933	2529938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10098	NC_014925	TAT	2	6	2529951	2529956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10099	NC_014925	AAATA	2	10	2529957	2529966	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
10100	NC_014925	TAA	2	6	2529971	2529976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10101	NC_014925	ACT	2	6	2529996	2530001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10102	NC_014925	TA	3	6	2530006	2530011	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10103	NC_014925	A	6	6	2530048	2530053	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10106	NC_014925	CTC	2	6	2534426	2534431	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10107	NC_014925	TTA	2	6	2534461	2534466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10108	NC_014925	TAA	2	6	2534494	2534499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10109	NC_014925	TAA	2	6	2534536	2534541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10110	NC_014925	A	6	6	2534540	2534545	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10111	NC_014925	TAA	2	6	2534685	2534690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10112	NC_014925	TACT	2	8	2534718	2534725	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10113	NC_014925	TAA	2	6	2534831	2534836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10114	NC_014925	CTAA	2	8	2534843	2534850	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10115	NC_014925	ATTT	2	8	2534921	2534928	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10116	NC_014925	T	9	9	2534931	2534939	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10117	NC_014925	A	6	6	2535033	2535038	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10118	NC_014925	T	6	6	2535710	2535715	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10119	NC_014925	ACTG	2	8	2535723	2535730	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10120	NC_014925	TGT	2	6	2535778	2535783	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10121	NC_014925	TGA	2	6	2535799	2535804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10122	NC_014925	ATA	2	6	2535947	2535952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10123	NC_014925	GAG	2	6	2536002	2536007	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10124	NC_014925	CTT	2	6	2536562	2536567	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10125	NC_014925	TA	3	6	2537466	2537471	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10126	NC_014925	ATT	2	6	2537525	2537530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10127	NC_014925	CATT	2	8	2537588	2537595	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10128	NC_014925	TA	3	6	2537643	2537648	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10129	NC_014925	TAA	2	6	2537713	2537718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10130	NC_014925	CAAA	2	8	2537734	2537741	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
10131	NC_014925	ATT	2	6	2537787	2537792	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10241	NC_014925	CT	3	6	2563093	2563098	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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10243	NC_014925	CAAC	2	8	2563226	2563233	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10244	NC_014925	CCT	2	6	2564716	2564721	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10245	NC_014925	T	7	7	2564725	2564731	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10246	NC_014925	TTTA	2	8	2564753	2564760	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10247	NC_014925	TCT	2	6	2564769	2564774	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10248	NC_014925	TAA	2	6	2564776	2564781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10249	NC_014925	T	6	6	2564856	2564861	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10250	NC_014925	CATTTT	2	12	2564891	2564902	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10251	NC_014925	A	6	6	2564907	2564912	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10252	NC_014925	A	6	6	2564976	2564981	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10253	NC_014925	TAA	2	6	2564994	2564999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10254	NC_014925	T	6	6	2565803	2565808	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10255	NC_014925	TAT	2	6	2565824	2565829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10256	NC_014925	ATGT	2	8	2565872	2565879	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10257	NC_014925	TTTCT	2	10	2565934	2565943	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
10258	NC_014925	TAA	2	6	2565960	2565965	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10259	NC_014925	GTA	2	6	2566029	2566034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10261	NC_014925	ATA	2	6	2566106	2566111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10389	NC_014925	TCA	2	6	2592671	2592676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10391	NC_014925	CAT	2	6	2593015	2593020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10392	NC_014925	ATG	2	6	2593077	2593082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10393	NC_014925	A	6	6	2593127	2593132	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10394	NC_014925	A	6	6	2593178	2593183	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10395	NC_014925	CCA	2	6	2593231	2593236	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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10401	NC_014925	TCAT	2	8	2593431	2593438	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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