MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Stigmatella aurantiaca DW4/3-1 chromosome

Total Repeats: 19528

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_014623	GAG	2	6	1317376	1317381	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3002	NC_014623	GCG	2	6	1317732	1317737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3003	NC_014623	TCC	2	6	1317772	1317777	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3004	NC_014623	AGA	2	6	1318612	1318617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3005	NC_014623	GAA	2	6	1318631	1318636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_014623	GTGC	2	8	1319810	1319817	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3007	NC_014623	GC	3	6	1320953	1320958	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3008	NC_014623	GGC	2	6	1320970	1320975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3009	NC_014623	GTCC	2	8	1323213	1323220	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3010	NC_014623	GGC	2	6	1323221	1323226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3011	NC_014623	CCGG	2	8	1323258	1323265	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3012	NC_014623	CTG	2	6	1323306	1323311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3013	NC_014623	CGG	2	6	1323316	1323321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3014	NC_014623	C	6	6	1323364	1323369	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3015	NC_014623	GAG	2	6	1323465	1323470	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3016	NC_014623	GCCC	2	8	1323486	1323493	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3017	NC_014623	CGCC	2	8	1323554	1323561	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3018	NC_014623	CCACG	2	10	1323585	1323594	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
3019	NC_014623	CGA	2	6	1323614	1323619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3020	NC_014623	TCC	2	6	1323681	1323686	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3021	NC_014623	GC	3	6	1323712	1323717	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3022	NC_014623	CG	3	6	1323764	1323769	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3023	NC_014623	GGT	2	6	1323818	1323823	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3024	NC_014623	GCA	2	6	1323824	1323829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3025	NC_014623	GCC	2	6	1323843	1323848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3026	NC_014623	GC	5	10	1323857	1323866	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3027	NC_014623	AAGG	2	8	1324824	1324831	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3028	NC_014623	AGG	2	6	1324920	1324925	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3029	NC_014623	CCT	3	9	1324926	1324934	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3030	NC_014623	TCC	2	6	1324995	1325000	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3031	NC_014623	TGC	2	6	1325005	1325010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3032	NC_014623	GAC	2	6	1329016	1329021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3033	NC_014623	AGC	2	6	1329517	1329522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3034	NC_014623	GCG	2	6	1329543	1329548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3035	NC_014623	GC	3	6	1329587	1329592	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3036	NC_014623	AGG	2	6	1329600	1329605	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3037	NC_014623	GGA	2	6	1329607	1329612	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3038	NC_014623	TCCG	2	8	1329673	1329680	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3039	NC_014623	C	6	6	1329710	1329715	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3040	NC_014623	GGA	2	6	1330226	1330231	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3041	NC_014623	TGG	2	6	1330243	1330248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3042	NC_014623	CATC	2	8	1330259	1330266	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3043	NC_014623	GGA	2	6	1330330	1330335	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3044	NC_014623	TGGA	2	8	1330410	1330417	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3045	NC_014623	AGCA	2	8	1330435	1330442	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3046	NC_014623	AAG	2	6	1330448	1330453	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3047	NC_014623	CCTGC	2	10	1330496	1330505	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
3048	NC_014623	AGAT	2	8	1330552	1330559	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3049	NC_014623	TCG	2	6	1330575	1330580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3050	NC_014623	G	6	6	1330627	1330632	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3051	NC_014623	GGA	2	6	1330640	1330645	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3052	NC_014623	CTG	2	6	1330675	1330680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3053	NC_014623	CG	3	6	1330694	1330699	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3054	NC_014623	CAC	2	6	1338317	1338322	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3055	NC_014623	CCGC	2	8	1338335	1338342	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3056	NC_014623	CCCTC	2	10	1338352	1338361	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
3057	NC_014623	CTC	2	6	1338370	1338375	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3058	NC_014623	CCG	2	6	1338378	1338383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3059	NC_014623	CTT	2	6	1338665	1338670	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3060	NC_014623	GTC	2	6	1338705	1338710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3061	NC_014623	GCGGA	2	10	1338711	1338720	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
3062	NC_014623	GGC	2	6	1338829	1338834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3063	NC_014623	GCCC	2	8	1338856	1338863	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3064	NC_014623	GCT	2	6	1340128	1340133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3065	NC_014623	ACAAG	2	10	1340141	1340150	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
3066	NC_014623	GGA	2	6	1340160	1340165	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3067	NC_014623	TTA	2	6	1340207	1340212	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3068	NC_014623	CGGA	2	8	1340235	1340242	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3069	NC_014623	CAA	2	6	1341902	1341907	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3070	NC_014623	TTCAA	2	10	1341922	1341931	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
3071	NC_014623	TGC	2	6	1341955	1341960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3072	NC_014623	GGA	2	6	1341980	1341985	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3073	NC_014623	CGC	2	6	1341995	1342000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3074	NC_014623	CCTT	2	8	1343119	1343126	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3075	NC_014623	C	7	7	1343168	1343174	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3076	NC_014623	CTT	2	6	1344493	1344498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3077	NC_014623	CTGGG	2	10	1344577	1344586	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
3078	NC_014623	CTG	2	6	1344605	1344610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3079	NC_014623	G	6	6	1344616	1344621	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3080	NC_014623	AGC	2	6	1344806	1344811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3081	NC_014623	CTTT	2	8	1346071	1346078	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3082	NC_014623	TCC	2	6	1346081	1346086	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3083	NC_014623	CTT	2	6	1346242	1346247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3084	NC_014623	AGC	2	6	1346254	1346259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3085	NC_014623	CCG	2	6	1346935	1346940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3086	NC_014623	C	6	6	1347006	1347011	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3087	NC_014623	GCC	2	6	1347034	1347039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3088	NC_014623	AGG	2	6	1347060	1347065	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3089	NC_014623	CCGA	2	8	1347089	1347096	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3090	NC_014623	GAT	2	6	1347132	1347137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3092	NC_014623	TGG	2	6	1347166	1347171	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3093	NC_014623	TG	3	6	1347200	1347205	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3094	NC_014623	GCCC	2	8	1347415	1347422	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3095	NC_014623	TCC	2	6	1347427	1347432	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3096	NC_014623	AGC	2	6	1347433	1347438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3097	NC_014623	CGC	2	6	1347467	1347472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3098	NC_014623	GTG	2	6	1347498	1347503	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3099	NC_014623	AGG	2	6	1347508	1347513	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3100	NC_014623	AGCC	2	8	1350240	1350247	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3101	NC_014623	TCG	2	6	1350284	1350289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3102	NC_014623	CG	3	6	1350317	1350322	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3103	NC_014623	TCC	2	6	1355829	1355834	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3104	NC_014623	GAG	2	6	1355875	1355880	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3105	NC_014623	GGAC	2	8	1356873	1356880	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3106	NC_014623	TGCC	2	8	1356896	1356903	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3107	NC_014623	GGC	2	6	1356905	1356910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3108	NC_014623	GAG	2	6	1356911	1356916	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3109	NC_014623	GC	3	6	1356956	1356961	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3110	NC_014623	GAGG	2	8	1356966	1356973	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3111	NC_014623	TC	3	6	1361390	1361395	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3112	NC_014623	GCG	2	6	1366010	1366015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3113	NC_014623	AGGT	2	8	1366024	1366031	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3114	NC_014623	TCC	6	18	1366036	1366053	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3115	NC_014623	TCC	2	6	1366060	1366065	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3116	NC_014623	TTG	2	6	1366089	1366094	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3117	NC_014623	CAGG	2	8	1366132	1366139	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3118	NC_014623	GATG	2	8	1366160	1366167	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3119	NC_014623	CG	4	8	1366172	1366179	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3120	NC_014623	CG	3	6	1366190	1366195	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3121	NC_014623	AAG	2	6	1366234	1366239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3122	NC_014623	AG	3	6	1366280	1366285	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3123	NC_014623	CCT	2	6	1382009	1382014	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3124	NC_014623	AG	3	6	1382024	1382029	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3125	NC_014623	G	6	6	1395975	1395980	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3126	NC_014623	GCCT	2	8	1395984	1395991	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3127	NC_014623	GTGCC	2	10	1396905	1396914	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3128	NC_014623	TTG	2	6	1399243	1399248	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3129	NC_014623	GA	3	6	1399268	1399273	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3130	NC_014623	CAG	2	6	1399293	1399298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3131	NC_014623	GGCG	2	8	1399300	1399307	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3132	NC_014623	CGG	2	6	1399308	1399313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3133	NC_014623	GGGCCG	2	12	1399368	1399379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3135	NC_014623	TTG	2	6	1400687	1400692	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3137	NC_014623	TCC	2	6	1403325	1403330	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3138	NC_014623	G	7	7	1403952	1403958	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3139	NC_014623	GCG	2	6	1404082	1404087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3141	NC_014623	TCAT	2	8	1404155	1404162	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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3252	NC_014623	GAT	2	6	1459362	1459367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3263	NC_014623	CGG	2	6	1467775	1467780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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